外膜ポリンD

オペレーションD
識別子
シンボル	オペレーションD
ファム	PF03573
ファム一族	CL0193
インタープロ	IPR005318
メロプス	S43
TCDB	1.B.25
OPMスーパーファミリー	182
OPMタンパク質	2odj
利用可能なタンパク質構造: PDB   IPR005318 PF03573 ( ECOD ; PDBsum )   アルファフォールド IPR005318 PF03573

外膜ポリン Dは、カチオン性アミノ酸、ペプチド、抗生物質、およびその他の化合物の輸送に関与する 細菌外膜ポリンを含むタンパク質ファミリーです。

また、ある程度のセリンプロテアーゼ活性があるとも記載されています。^{[ 1 ]}しかし、これらのタンパク質の多くはペプチダーゼではなく、実験的にペプチダーゼ活性がないことが判明しているか、S43ファミリーのペプチダーゼの触媒活性に必須であると考えられるアミノ酸残基を欠いているため、非ペプチダーゼホモログに分類されます。

参考文献

1. Yoshihara E, Yoneyama H, Ono T, Nakae T (1998年6月). 「Pseudomonas aeruginosaにおけるタンパク質D2プロテアーゼの触媒三元構造の同定」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 247 (1): 142–5 . doi : 10.1006/bbrc.1998.8745 . PMID  9636669 .

この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR005318からのテキストが含まれています。