ヘインズ・ウルフ・プロット

Graph of enzyme kinetics
ミカエリス・メンテン動力学におけるa/vとaのヘインズプロット

生化学においてヘインズ・ウルフ・プロット(Hanes–Woolf plot)ヘインズ・プロット(Hanes plot) 、あるいは対比プロット( plot of against)は、 a / v {\displaystyle a/v} a {\displaystyle a} 酵素反応速度論 をグラフで表したもので、初期基質濃度反応速度の比を対比してプロットしたものである。これは、以下に示すミカエリス・メンテンの式の変形に基づいている a {\displaystyle a} v {\displaystyle v} a {\displaystyle a}

a v = a V + K m V {\displaystyle {a \over v}={a \over V}+{K_{\mathrm {m} } \over V}}

ここで、はミカエリス定数は限界速度である。[1] K m {\displaystyle K_{\mathrm {m} }} V {\displaystyle V}

JBSハルデーンは、彼とKGスターンが著書[2]で述べたことを繰り返して、この転置はバーネット・ウルフによるものだと述べた[3]しかし、これはウルフが導入した3つの変換のうちの1つに過ぎなかった。これはC.S.ヘインズによって初めて発表されたが、彼はそれをプロットとして用いなかった。[4]ヘインズは、この種の線形変換から運動パラメータを決定するために線形回帰を用いると、ではなくの 観測値と計算値の間に最も適合する結果が得られると指摘した[4] : 1415  1 / v {\displaystyle 1/v} v {\displaystyle v}

ミカエリス・メンテン方程式から出発します。

v = V a K m + a {\displaystyle v={{Va} \over {K_{\mathrm {m} }+a}}}

両辺の逆数をとると、ラインウィーバー・バークプロットの基礎となる方程式が得られます。

1 v = 1 V + K m V 1 a {\displaystyle {1 \over v}={1 \over V}+{K_{\mathrm {m} } \over V}\cdot {1 \over a}}

これを両辺に掛ける a {\displaystyle {a}}

a v = 1 V a + K m V {\displaystyle {a \over v}={1 \over V}\cdot a+{K_{\mathrm {m} } \over V}}

したがって、実験誤差データがない場合、を に対してプロットすると、 の傾き、 の縦軸切片、 の 横軸切片の直線が得られます a / v {\displaystyle {a/v}} a {\displaystyle {a}} 1 / V {\displaystyle 1/V} K m / V {\displaystyle {K_{\mathrm {m} }/V}} K m {\displaystyle -K_{\mathrm {m} }}

ミカエリス・メンテン方程式を線形化する他の手法と同様に、ヘインズ・ウルフ・プロットは、歴史的には運動パラメータ、 、を迅速に決定するために使用されていましたが、現在では、より精度が高く、もはや計算不可能ではない非線形回帰法に大きく取って代わられています。しかしながら、データをグラフで提示する手段としては、依然として有用です。 K m {\displaystyle K_{\mathrm {m} }} V {\displaystyle V} K m / V {\displaystyle K_{\mathrm {m} }/V}

参照

参考文献

  1. ^ 「 最大速度」という用語はよく使われますが、IUBMBでは推奨されていません。Cornish -Bowden, A (2014). 「Current IUBMB recommendations on enzyme nomenclature and kinetics. Persp. Sci . 1 ( 1– 6): 74– 87. Bibcode :2014PerSc...1...74C. doi : 10.1016/j.pisc.2014.02.006 を参照してください
  2. ^ ホールデーン、ジョン・バードン・サンダーソン;シュテルン、クルト・ギュンター(1932年)。酵素のすべての化学ラファエル・エドゥアルド・リーゼガング博士によるWissenschaftliche Forschungsberichte、Naturwissenschaftliche Reihe、herausgegeben 。 Vol. 28. ドレスデンとライプツィヒ:テオドール・シュタインコフ。119 ~ 120ページ。OCLC  964209806  。
  3. ^ Haldane, John Burdon Sanderson (1957). 「酵素化学におけるグラフィカル手法」. Nature . 179 (4564): 832. Bibcode :1957Natur.179R.832H. doi : 10.1038/179832b0 . S2CID  4162570.
  4. ^ ab ヘインズ、チャールズ・サミュエル (1932). 「植物アミラーゼに関する研究:発芽大麦アミラーゼによる加水分解速度に対するデンプン濃度の影響」.生化学ジャーナル. 26 (5): 1406– 1421. doi :10.1042/bj0261406. PMC 1261052. PMID 16744959  . 
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