NDUFAF3
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
NDUFAF3
識別子
エイリアスNDUFAF3、2P1、C3orf60、E3-3、NADH:ユビキノン酸化還元酵素複合体組み立て因子3、MC1DN18
外部IDオミム：612911; MGI : 1913956;ホモロジーン: 32460;ジーンカード：NDUFAF3; OMA :NDUFAF3 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

25915

66706

アンサンブル

ENSG00000178057

ENSMUSG00000070283

ユニプロット

Q9BU61

Q9JKL4

RefSeq (mRNA)

NM_199417
NM_199069
NM_199070
NM_199073
NM_199074

NM_023247

RefSeq（タンパク質）

NP_951032
NP_951033
NP_951047
NP_951056

NP_075736

場所（UCSC）3章: 49.02 – 49.02 Mb9章: 108.44 – 108.44 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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NADH 脱水素酵素 [ユビキノン] 1 α サブ複合体組み立て因子 3 は、 2P1、E3-3、またはC3orf60としても知られ、ヒトではNDUFAF3遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] [7] NDUFAF3 は、ミトコンドリア内膜に位置し、電子伝達系の 5 つの複合体の中で最大の複合体 Iとしても知られるNADH 脱水素酵素 (ユビキノン)の組み立てに関与するミトコンドリア組み立てタンパク質です。[8] [9]この遺伝子の変異は、重度の複合体 I 欠損症やリー症候群と関連しています。[5] [9] [10]

構造

NDUFAF3は3番染色体のp腕の21.31番に位置し、7つのエクソンを有する。[5] NDUFAF3遺伝子は、184個のアミノ酸からなる20.4 kDaのタンパク質を生成する。[11] [12] NDUFAF3は、共通のDUF498ドメインを持つ2つのアイソフォームをコードしている。予測によると、アイソフォームAは35個のアミノ酸からなるN末端配列を追加しており、アイソフォームBよりも長い。この追加配列はミトコンドリアへの標的化に関与している可能性があり、ミトコンドリアの組み立てにおけるNDUFAF3の機能を支持する。[9]

関数

NADH:ユビキノン酸化還元酵素（複合体I）は、ミトコンドリア呼吸鎖の第一段階でNADHからユビキノン（コエンザイムQ）への電子の移動を触媒し、その結果、ミトコンドリア内膜を介したプロトンの転座が起こります。 [13] NDUFAF3遺伝子は、ミトコンドリア内膜に局在し、複合体Iサブユニットと相互作用するミトコンドリア複合体Iアセンブリタンパク質をコードしており、ミトコンドリア呼吸鎖の正しい機能に重要です。[5] [9]

NDUFAF3はNDUFAF4と共局在し、いくつかのアセンブリ中間体と共移動し、複合体Iの組み立ての初期段階から後期段階まで共依存的に作用する。NDUFAF3とNDUFAF4は互いに密接に相互作用するだけでなく、翻訳依存的な初期アセンブリ機構においてNDUFS2、NDUFS3、NDUFS8、およびNDUFA5と相互作用する。また、NDUFAF3は複合体Iの組み立て過程において、ミトコンドリア翻訳と膜挿入の連携に関与していることが示唆されている。[9]

臨床的意義

NDUFAF3の変異は、複合体I欠損症およびミトコンドリア病と関連付けられている。これらの疾患は、ミトコンドリア呼吸鎖の機能不全の結果であり、致死的な新生児疾患から成人発症の神経変性疾患まで、幅広い臨床症状を引き起こす可能性がある。表現型には、進行性白質ジストロフィーを伴う大頭症、非特異的脳症、心筋症、ミオパシー、肝疾患、リー症候群、レーバー遺伝性視神経症、およびパーキンソン病の一部の形態が含まれる。[6] [7]変異には、c.494C > T; p.(Ala165Val)のホモ接合変異、[10] c.365 G→CによるR122P、[10] c.2 T→CによるM1Tが含まれる。[9]臨床的には、NDUFAF3変異はリー症候群[10]および重症複合体I欠損症[9]と関連している。一般的な徴候と症状には、乳酸アシドーシス、眼振、筋緊張低下、脳病変などがある。[9] [10]

相互作用

共複合体に加えて、NDUFAF3はNDUFAF4 [14]およびSNRPA [15] とタンパク質間相互作用を有する。

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000178057 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000070283 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ abcd 「NDUFAF3 NADH:ユビキノン酸化還元酵素複合体アセンブリ因子3 [Homo sapiens (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2018年7月25日閲覧。
  6. ^ ab 「NDUFAF3 - NADH脱水素酵素[ユビキノン]1アルファサブ複合体組立因子3 - ホモサピエンス（ヒト） - NDUFAF3遺伝子とタンパク質」。www.uniprot.org . 2018年7月25日閲覧。
  7. ^ ab 「UniProt：ユニバーサルタンパク質知識ベース」. Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158 – D169 . 2017年1月. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622  .  
  8. ^ ドナルド・ヴォート;ジュディス・G・ヴォート;シャーロット・W・プラット (2013)。 「18」。生化学の基礎: 分子レベルでの生命(第 4 版)。ニュージャージー州ホーボーケン: ワイリー。ページ 581–620。ISBN​​ 9780470547847。
  9. ^ abcdefgh Saada A、Vogel RO、Hoefs SJ、van den Brand MA、Wessels HJ、Willems PH、Venselaar H、Shaag A、Barghuti F、Reish O、Shohat M、Huinen MA、Smeitink JA、van den Heuvel LP、Nijtmans LG (2009 年 6 月)。 「NDUFAF4 (C6ORF66) と相互作用する複合体 I アセンブリタンパク質をコードする NDUFAF3 (C3ORF60) の変異は、致死的な新生児ミトコンドリア病を引き起こす。」アメリカ人類遺伝学ジャーナル。84 (6): 718–27 .土井:10.1016/j.ajhg.2009.04.020。PMC 2694978。PMID  19463981。 
  10. ^ abcd バートリング F、サンチェス カバジェロ L、ティマル S、ファン デン ブランド MA、ングー LH、ディステルマイヤー F、ローデンブルク RJ、ナイトマンス LG (2017 年 3 月)。 「ミトコンドリア複合体 I 構築因子 NDUFAF3 の変異はリー症候群を引き起こす」。分子遺伝学と代謝。120 (3): 243–246。土井:10.1016/j.ymgme.2016.12.005。PMID  27986404。
  11. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (2013年10月). 「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」. Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338  . 
  12. ^ Yao, Daniel. 「心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース（COPaKB）——タンパク質情報」. amino.heartproteome.org . 2018年7月26日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年7月25日閲覧。
  13. ^ 参考文献、Genetics Home。「NDUFAF1遺伝子」。Genetics Home Reference。2017年2月16日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2018年7月25日閲覧。
  14. ^ "ndufaf3-ndufaf4". IntAct . EMBL-EBI.
  15. ^ "ndufaf3-snrpa-1". IntAct . EMBL-EBI.

さらに読む

  • ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Lehner B, Sanderson CM (2004年7月). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」. Genome Research . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147.  PMID 15231747  .
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000年9月). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」. EMBO Reports . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614 .
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1996年9月). 「正規化と減算：遺伝子発見を促進する2つのアプローチ」. Genome Research . 6 (9): 791–806 . doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID  8889548.

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