ADGRV1は、 Gタンパク質共役受容体98(GPR98)または超大型Gタンパク質共役受容体1(VLGR1)としても知られ、ヒトではGPR98遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ]いくつかの選択的スプライシング転写産物が報告されている。[ 5 ]
接着性GPCRであるVLGR1は、6300アミノ酸残基から成り、90のエクソンから構成される、既知のGPCRとしては最大のものです。[ 6 ] VlgR1には、VlgR1a-1eおよびMass1.1-1.3と呼ばれる8つのスプライスバリアントが存在します。N末端は5800アミノ酸残基から成り、35個のCalx-βドメイン、1個のペントラキシンドメイン、そして1個のてんかん関連リピートを含んでいます。VlgR1の変異はアッシャー症候群を引き起こすことが示されています。マウスにおけるVlgr1のノックアウトは、アッシャー症候群の表現型を模倣し、聴原性発作を引き起こすことが示されています。
関数
この遺伝子は、接着GPCRファミリーの受容体のメンバーをコードしています。[ 7 ]このタンパク質はカルシウムと結合し、中枢神経系で発現します。6300残基の長さを持つことから、超大型Gタンパク質共役受容体1としても知られています。C末端に7回膜貫通型受容体ドメインを含み、N末端側の大きなセグメント(5900残基)には、35個のカルシウム結合Calx-βドメインと6個のEARドメインが含まれています。
進化
ウニゲノムにはVLGR1の相同遺伝子が含まれている。[ 8 ]
臨床的意義
この遺伝子の変異は、アッシャー症候群2および家族性熱性けいれんと関連している。[ 5 ]
参考文献
- ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000164199 – Ensembl、2017年5月
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000069170 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ a b c「Entrez Gene: GPR98 Gタンパク質共役受容体98」。
- ^ Sun JP, Li R, Ren HZ, Xu AT, Yu X, Xu ZG (2013年5月). 「有毛細胞における超大型Gタンパク質共役受容体(Vlgr1)」. Journal of Molecular Neuroscience . 50 (1): 204– 214. doi : 10.1007/ s12031-012-9911-5 . PMID 23180093. S2CID 16730555 .
- ^ Stacey M, Yona S (2011). 『接着GPCR:構造から機能へ』(実験医学・生物学の進歩)ベルリン:シュプリンガー. ISBN 978-1-4419-7912-4。
- ^ Whittaker CA, Bergeron KF, Whittle J, Brandhorst BP, Burke RD, Hynes RO (2006年12月). 「棘皮動物の接着分子」 . Developmental Biology . 300 (1): 252– 266. doi : 10.1016/j.ydbio.2006.07.044 . PMC 3565218. PMID 16950242 .
さらに読む
- Staub E, Pérez-Tur J, Siebert R, Nobile C, Moschonas NK, Deloukas P, et al. (2002年9月). 「新規EPTPリピートはてんかん疾患に関与するタンパク質スーパーファミリーを定義する」. Trends in Biochemical Sciences . 27 (9): 441– 444. doi : 10.1016/S0968-0004(02)02163-1 . PMID 12217514 .
- 石川 功、永瀬 剛、須山 正之、宮島 暢、田中 明、小谷 秀、他 (1998年6月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. X. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」 . DNA Research . 5 (3): 169– 176. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811 .
- 中山 淳、浜野 和人、岩崎 直也、中原 俊、堀米 裕、斉藤 博 ほか(2000 年 1 月)。「熱性けいれんと染色体 5q14-q15 の関連性に関する重要な証拠」。ヒト分子遺伝学。9 (1): 87–91 .土井: 10.1093/hmg/9.1.87。PMID 10587582。
- Pieke-Dahl S, Möller CG, Kelley PM, Astuto LM, Cremers CW, Gorin MB, 他 (2000年4月). 「アッシャー症候群II型の遺伝的異質性:5番染色体qへの局在」 . Journal of Medical Genetics . 37 (4): 256– 262. doi : 10.1136/jmg.37.4.256 . PMC 1734554. PMID 10745043 .
- Nikkila H, McMillan DR, Nunez BS, Pascoe L, Curnow KM, White PC (2000年9月). 「新規Gタンパク質共役受容体とNa+/Ca2+交換輸送体の配列類似性から陽イオン結合ドメインが明らかに」. Molecular Endocrinology . 14 (9): 1351– 1364. doi : 10.1210/me.14.9.1351 . PMID 10976914 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et al. (2001年3月). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ化に向けて:500種類の新規完全タンパク質コードヒトcDNAの配列決定と解析」 . Genome Research . 11 (3): 422– 435. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Skradski SL, Clark AM, Jiang H, White HS, Fu YH, Ptácek LJ (2001年8月). 「メンデル遺伝性聴原性マウスてんかんを引き起こす新規遺伝子」 . Neuron . 31 (4): 537– 544. doi : 10.1016/S0896-6273(01)00397-X . PMID 11545713. S2CID 14468960 .
- McMillan DR, Kayes-Wandover KM, Richardson JA, White PC (2002年1月). 「既知の最大の細胞表面タンパク質である超大型Gタンパク質共役受容体1は、発達中の中枢神経系で高発現している」 . The Journal of Biological Chemistry . 277 (1): 785– 792. doi : 10.1074/jbc.M108929200 . PMID 11606593 .
- 永瀬 剛志、菊野 亮、小原 修 (2001年12月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XXII. 巨大タンパク質をコードする50個の新規cDNAクローンの完全配列」 . DNA Research . 8 (6): 319– 327. doi : 10.1093/dnares/8.6.319 . PMID 11853319 .
- Nakayama J, Fu YH, Clark AM, Nakahara S, Hamano K, Iwasaki N, et al. (2002年11月). 「熱性けいれんおよび無熱性けいれんを有する一家系におけるMASS1遺伝子のナンセンス変異」Annals of Neurology . 52 (5): 654– 657. doi : 10.1002/ana.10347 . PMID 12402266 . S2CID 36357793 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、大月 剛志、杉山 剛志、入江 亮、他 (2004年1月). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 . Nature Genetics . 36 (1): 40– 45. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Weston MD, Luijendijk MW, Humphrey KD, Möller C, Kimberling WJ (2004年2月). 「VLGR1遺伝子の変異は、アッシャー症候群II型の病因におけるGタンパク質シグナル伝達に関与している」 . American Journal of Human Genetics . 74 (2): 357– 366. doi : 10.1086/381685 . PMC 1181933. PMID 14740321 .
- ビャルナドッティル TK、フレドリクソン R、ヘグルンド PJ、グロリアム DE、ラーゲルストローム MC、シオス HB (2004 年 7 月)。 「Gタンパク質共役受容体の接着ファミリーのヒトおよびマウスのレパートリー」。ゲノミクス。84 (1): 23–33 .土井: 10.1016/j.ygeno.2003.12.004。PMID 15203201。
- Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (2004年7月). 「部分遺伝子のハイスループット伸長クローニングのためのcDNA末端の環状迅速増幅」. Genomics . 84 (1): 205– 210. doi : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . PMID 15203218 .
- Schwartz SB, Aleman TS, Cideciyan AV, Windsor EA, Sumaroka A, Roman AJ, et al. (2005年2月). 「VLGR1遺伝子変異(USH2C)に起因するアッシャー症候群の病態発現およびUSH2A表現型との比較」. Investigative Ophthalmology & Visual Science . 46 (2): 734– 743. doi : 10.1167/iovs.04-1136 . PMID 15671307 .
- 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、太田 剛、西川 剛、山下 亮、他 (2006年1月). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」 .ゲノム研究. 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
外部リンク