Incertae sedis

「Colostethus」ruthveni 、ヤドクガエル科に属するカエル
カリフォルニアコンドルなどの新世界のハゲワシ類は、新しい目Cathartiformesが認識されるまで、鳥類の中にincertae sedis分類されていました。
Plumalina plumaria Hall, 1858(高さ6.3cm)、米国ニューヨーク州西部産、上部デボン系。研究者は通常、この生物をヒドロ虫綱(刺胞動物門、ヒドロ虫綱)またはヤギ目(刺胞動物門、花虫綱、ヤギ目)に分類するが、おそらくincertae sedisと呼ぶのが最も安全であろう。[ 1 ]
謎に包まれた四肢動物の科であるヴァラノピッド類は、他の多くの陸生四肢動物との関係について議論の的となってきました。古生物学者はこれまで、主にヴァラノピッド類を真蛹竜類の単弓類に分類してきました。また、基盤的な新二弓類に分類する説もあります。妥協案として、ヴァラノピッド類をAmniota incertae sedisに分類する説があります。

Incertae sedisラテン語で「不確かな位置づけ」) [ 2 ]またはproblematicaは、より広い関係が不明または定義されていない分類を指す用語です。 [ 3 ]また、このようなグループは「謎の分類群」と呼ばれることもあります。 [ 4 ]オープン命名法では、特定の分類レベルでの不確実性は、 incertae familiae(不確かな科)、 incerti subordinis(不確かな亜目)、 incerti ordinis(不確かな目)などの用語で示されます。 [ 5 ]

正式な命名法では

分類群に正式な命名を行う際、その分類学上の分類が不明確であることが問題となる場合がある。藻類、菌類、植物の国際命名規約では、「種および属の下位区分は属に、種以下の分類群は種に割り当てなければならない。なぜなら、それらの名称は組み合わせだからである」と規定されているが、属よりも上位の階級には、不確定な形で割り当てられる場合がある。[ 15 ]

使用理由

説明が不十分

2007年に発表された千島・カムチャッカ海溝日本海溝甲殻類に関する科学論文からの抜粋では、このカテゴリーが議論に適用される典型的な状況について説明しています。[ 16 ]

...多くの属が新科および既存の科から不確定な状態へと移行した。これらの属の地位低下は、主に記述の不備や不十分さに起因するとされたが、分析における曖昧さの一部は形質状態の不十分さに起因することも認められた。また、分析に用いられた形質の一部、あるいは特定の分類群におけるそれらの状態が不適切または無効であったことも明らかである。さらなる複雑さ、そして先行研究の権威を誤らせた要因として、広範な相同性、見かけ上の形質状態の逆転、そして収斂進化の介入が挙げられる。

分析に含まれない

特定の分類群を含まない正式な系統解析が行われた場合、著者はその分類群の位置を推測するのではなく、不確定な分類群として分類する選択をするかもしれない。これは、多くの希少生物の組織が入手困難なため、分子系統樹を作成する際に特によく見られる。また、化石分類群が含まれる場合にも、多くの化石が部分的な情報に基づいて定義されているため、このようなシナリオがよく見られる。例えば、系統樹が軟部組織と椎骨を主要な形質として構築され、問題の分類群が1本の歯からしか知られていない場合、その分類群を不確定な分類群として分類する必要があるだろう。[ 5 ]

論争

矛盾する結果が存在する場合、または分類群が他の生物とどのように関係するかについて研究者間で合意が得られていない場合は、矛盾が解決されるまで、その分類群は不確定な分類群としてリストされることがあります。 [ 5 ]

系統学的不確実性と命名学的不確実性

incertae sedisという用語は、分類群の系統学的位置に関する不確実性を指し、分類群名の前後に疑問符を付すことで表現される。これは、分類群名の使用方法が不確実である場合(タイプが失われた場合が多いため、名付け親が不明瞭な場合(nomen dubiumspecies inquirenda)、あるいは保存状態の悪い標本を特定の種または属に含めるべきかどうかが不明瞭な場合(分類群名の前に「cf.」(ラテン語のconfer、 compare に由来)を付す)など)とは区別される。このような慣習は、特に古生物学において広く用いられている。[ 17 ]

動物学の命名法では

動物命名法において、「不確定な」は、それ自体が命名法用語ではないが、分類学者が分類において「分類学上の位置が不確かな」という意味で使用している。[ 2 ]用語集植物学では、著者が同じ出版物で承認しない限り、その学名は有効に出版されない。[ 15 ]第36条1項動物学では、条件付きで提案された学名は、特定の条件下では使用できる場合がある。 [ 2 ]第11条および第15条より低レベルの不確実性については、一部の著者が「オープン命名法」のシステムを提案し、疑問符を使用して疑わしい割り当てを示すことを提案している。[ 5 ]例えば、新種がAntonによって種小名album を与えられ、不確実性を伴うAgenusに帰属された場合、「 Agenus ? album Anton (?Anton)」と表記することができる。「(?Anton)」は、疑問符を割り当てた著者を示す。[ 5 ]つまり、アントンがAgenus albumについて記述し、ブルーノがその帰属に疑問を呈した場合、アントンを括弧で囲んで「 Agenus ? album (アントン) (?ブルーノ)」と表記することができる。これは、元の帰属( Agenus )がブルーノによって( Agenus ?に)修正されたためである。[ 5 ]この方法は国際動物命名規約には含まれておらず、古生物学者のみが使用している。[ 5 ]

真菌分類学では

真菌分類学において、階層構造における位置を明確に示すことができない分類群には、不確定な分類群(incertae sedis)が適用される。この分野の歴史の大部分において、分類は形態に基づいており、命名規則は定期的に改訂されてきた。ICNafpの改訂では1菌類1名」などの使用法を安定させるための措置が採用された。多遺伝子バーコーディングやモデルに基づく系統発生学を含むDNAに基づく系統分類学は、属、科、目における大規模な再編を促してきた。それでもなお、かなりの数の属が未分類のまま残されており、その中には形態学的に明確に限定されているにもかかわらず、Species FungorumMycoBankなどの主要な索引に依然として不確定な分類群として記載されているものも数多く含まれる。その原因としては、分類群のサンプリング数が限られていること、異なる遺伝子マーカーからのシグナルが一致しないこと、有性型無性型の間のミッシングリンク、そして分類群がどの科や目とも単純に一致しない場合などが挙げられる。[ 18 ]

実務上の制約により、進捗はしばしば遅れる。タイプ標本は古く、断片的であったり、入手困難な場合があり、菌類からの貸出は生物多様性および検疫規則により厳しく制限されており、生きたタイプ標本株の不足が配列決定を妨げている。新鮮な標本が入手可能な場合は、エピタイプを指定することはできるが、ICNafpに基づく正式な保存によってのみエピタイプ化が認められるため、慎重に行う必要がある。未処理の標本は相当な規模である。2022年の「菌類および菌類様分類群の概要」では、約3,185属が不確定菌類( incertae sedis )として報告されており、子嚢菌類には約2,680属(うち約1,477属はどの科にも分類されていない)、担子菌類には約420属が含まれており、他のグループにも少数含まれている。これらの分類群を分類し、菌類系統樹を精緻化するには、継続的な収集と分子生物学的研究が必要である。[ 18 ]

参照

参考文献

  1. ^ Plumalina plumaria . JSJ Geology . 2021年1月20日閲覧
  2. ^ a b c「用語集」 .国際動物命名規約.国際動物命名委員会. 2011年6月12日閲覧
  3. ^ 「よくある質問」 . PLANTSデータベース.米国農務省. 2011年6月12日閲覧
  4. ^ Allaby, M. (1999). 『動物学辞典』オックスフォード大学出版局. p. 704. 2013年1月5日閲覧
  5. ^ a b c d e f g S. C. Matthews (1973). 「オープン命名法と同義語リストに関する注記」(PDF) .古生物学. 16 (4): 713– 719. 2011年7月27日時点のオリジナルよりアーカイブ。
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  9. ^ JV Remsen Jr.; CD Cadena; A. Jaramillo; M. Nores; JF Pacheco; MB Robbins; TS Schulenberg; FG Stiles; DF Stotz; KJ Zimmer (2011). 「南アメリカの鳥類の分類」南アメリカ分類委員会.アメリカ鳥類学者連合. 2009年3月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2011年6月12日閲覧
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  • ウィクショナリーにおけるincertae sedisの辞書定義
  • ウィキメディア・コモンズのincertae sedisに関連するメディア