GGA1

GGA1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1J2J、1JWF、1JWG、1NA8、1NAF、1NWM、1O3X、1OM9、1OXZ、1PY1、1UJJ、1UJK、1X79、2DWX、2DWY、3G2S、3G2T、3G2U、3G2V、3G2W
識別子
エイリアス	GGA1、ゴルジ体関連、ガンマアダプチン耳含有、ARF結合タンパク質1
外部ID	オミム：606004; MGI : 2146207;ホモロジーン: 39250;ジーンカード：GGA1; OMA :GGA1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 22番染色体（ヒト）[1] バンド 22q13.1 始める 37,608,725 bp [1] 終わり 37,633,564 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 15番染色体（マウス）[2] バンド 15|15 E1 始める 78,761,390 bp [2] 終わり 78,778,785 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 膵管細胞 左精巣 右精巣 内皮細胞 右卵管 回腸粘膜 小脳の右半球 下垂体 歯肉上皮 下垂体前葉 上位の表現 顆粒球 太ももの筋肉 リップ 幽門洞 卵黄嚢 上前頭回 心室帯 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 食道 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 分子機能 細胞成分 エンドソーム ゴルジ体 エンドソーム膜 細胞内解剖学的構造 膜 細胞内膜小器官 クラスリンアダプター複合体 核質 初期エンドソーム膜 初期エンドソーム 細胞質 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 毒素輸送 タンパク質分解プロセスの正の調節 小胞輸送 輸送 ゴルジ体から細胞膜への輸送 タンパク質の局在 細胞表面へのタンパク質の局在 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ ゴルジ体から細胞膜へのタンパク質輸送 繊毛膜へのタンパク質の局在 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 26088 106039 アンサンブル ENSG00000100083 ENSMUSG00000033128 ユニプロット Q9UJY5 Q8R0H9 RefSeq (mRNA) NM_001001560 NM_001001561 NM_001172687 NM_001172688 NM_013365 NM_001363771 NM_145929 RefSeq（タンパク質） NP_001001560 NP_001166158 NP_001166159 NP_037497 NP_001350700 NP_666041 場所（UCSC） 22章: 37.61 – 37.63 MB 15章: 78.76 – 78.78 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ADPリボシル化因子結合タンパク質GGA1は、ヒトではGGA1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

この遺伝子は、ゴルジ体に局在するγアダプチン耳含有ARF結合（GGA）タンパク質ファミリーのメンバーをコードしています。このファミリーのメンバーは、トランスゴルジネットワークとリソソーム間のタンパク質輸送を制御する普遍的なコートタンパク質です。これらのタンパク質は、トランスゴルジネットワークにおけるマンノース6リン酸受容体の選別を媒介するアミノ末端VHSドメインを共有しています。また、γアダプチンの耳ドメインと相同性を持つカルボキシ末端領域も含みます。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の選択的スプライシング転写バリアントが見つかっています。^[8]

相互作用

GGA1はソルチリン1、^{[9] 、} BACE2、^{[10] 、} RABEP1 ^[11]、ARF3と相互作用することが示されている。^{[12] [13]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100083 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000033128 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (2000年5月). 「トランスゴルジ体ネットワークと液胞／リソソーム間の輸送を促進するγ-アダプチンおよびVHSドメインを持つタンパク質ファミリー」. J Cell Biol . 149 (1): 67– 80. doi :10.1083/jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID  10747088 . 
6. Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (2000年5月). 「GGA：アダプターに関連し、ゴルジ体と関連するADPリボシル化因子結合タンパク質ファミリー」J Cell Biol . 149 (1): 81– 94. doi :10.1083/jcb.149.1.81. PMC 2175099. PMID 10747089  . 
7. Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (2006年3月). 「アディポネクチンの細胞内輸送と分泌はGGA被覆小胞に依存する」. J Biol Chem . 281 (11): 7253–9 . doi : 10.1074/jbc.M511313200 . hdl : 2445/176753 . PMID  16407204.
8. 「Entrez Gene: GGA1 ゴルジ体関連、ガンマ アダプチン耳含有、ARF 結合タンパク質 1」。
9. リンダ、ジェイコブセン;マドセン・ペダー。ニールセン・モルテンS;ゲラルツ・ワイナンド首相。グリーマン・ヨルゲン;スミット・オーガストB;ピーターセン・クラウス・M (2002 年 1 月)。 「sorLA 細胞質ドメインは GGA1 および GGA-2 と相互作用し、GGA 結合の最小要件を定義します。」FEBS レット。511 ( 1–3 ): 155– 8.土井: 10.1016/S0014-5793(01)03299-9。ISSN  0014-5793。PMID  11821067。S2CID 21977507  。
10. He, Xiangyuan; Chang Wan-Pin; Koelsch Gerald; Tang Jordan (2002年7月). 「メマプシン2（βセクレターゼ）細胞質ドメインはGGA1およびGGA2のVHSドメインに結合する：メマプシン2のエンドサイトーシス機構への影響」. FEBS Lett . 524 ( 1–3 ): 183–7 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)03052-1 . ISSN  0014-5793. PMID  12135764.
11. Mattera, Rafael; Arighi Cecilia N; Lodge Robert; Zerial Marino; Bonifacino Juan S (2003年1月). 「GGAとRabaptin-5-Rabex-5複合体との二価相互作用」. EMBO J. 22 ( 1): 78– 88. doi :10.1093/emboj/cdg015. ISSN  0261-4189. PMC 140067. PMID 12505986  . 
12. Boman, Annette L; Salo Paul D; Hauglund Melissa J; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Zhdankina Olga (2002年9月). 「ADP-リボシル化因子（ARF）相互作用は酵母GGAタンパク質の機能や局在には不十分である」. Mol. Biol. Cell . 13 (9): 3078–95 . doi :10.1091/mbc.E02-02-0078. ISSN  1059-1524. PMC 124144. PMID 12221117  . 
13. Boman, AL; Zhang C j; Zhu X; Kahn RA (2000年4月). 「トランスゴルジ体を介した膜輸送を変化させるADPリボシル化因子エフェクターファミリー」. Mol. Biol. Cell . 11 (4): 1241–55 . doi :10.1091/mbc.11.4.1241. ISSN  1059-1524. PMC 14844. PMID 10749927  . 

さらに読む

• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
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• Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ, et al. (2003). 「ADP-リボシル化因子（ARF）相互作用は酵母GGAタンパク質の機能や局在には不十分である」. Mol. Biol. Cell . 13 (9): 3078–95 . doi :10.1091/mbc.E02-02-0078. PMC  124144. PMID 12221117  .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Mattera R, Arighi CN, Lodge R, et al. (2003). 「GGAとRabaptin-5-Rabex-5複合体との二価相互作用」. EMBO J. 22 ( 1): 78– 88. doi :10.1093/emboj/cdg015. PMC 140067.  PMID 12505986  .
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