ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
AP2S1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2JKR、2JKT、2VGL、2XA7、4UQI、4NEE
識別子 エイリアス AP2S1 、AP17、CLAPS2、FBH3、FBHOk、HHC3、アダプター関連タンパク質複合体2シグマ1サブユニット、アダプター関連タンパク質複合体2サブユニットシグマ1 外部ID オミム ：602242; MGI : 2141861; ホモロジーン ：3001; ジーンカード ：AP2S1; OMA :AP2S1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 7番染色体（マウス） [2] バンド 7|7 A2 始める 16,472,335 bp [2] 終わり 16,483,219 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 子宮内膜間質細胞 右副腎 右前頭葉 横行結腸粘膜 人間のペニス 右副腎皮質 左副腎 左副腎皮質 前頭前皮質 帯状回
上位の表現 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 上前頭回 顆粒球 顔面運動核 神経管 心室帯 卵黄嚢 リップ 骨髄間質
より多くの参照表現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
トランスポーター活性 クラスリンアダプター活性 タンパク質結合 細胞成分
エンドサイトーシス小胞膜 細胞質 クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞膜 膜 細胞膜 エンドリソソーム膜 膜コート クラスリン被覆ピット AP-2アダプター複合体 クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞 細胞内膜小器官 生物学的プロセス
エンドサイトーシスの調節 エンドサイトーシス MHCクラスIIを介した外因性ペプチド抗原の抗原処理と提示 エフリン受容体シグナル伝達経路 ウイルスによる宿主防御の緩和 クラスリン依存性エンドサイトーシス クラスリンコートアセンブリ タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 小胞輸送 微小管に基づく運動 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 膜組織 低密度リポタンパク質粒子受容体の分解プロセス 低密度リポタンパク質粒子クリアランス 輸送 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001301076 NM_001301078 NM_001301081 NM_004069 NM_021575
RefSeq（タンパク質） NP_001288005 NP_001288007 NP_001288010 NP_004060 NP_067586
場所（UCSC） 19章: 46.84 – 46.85 Mb 7章: 16.47 – 16.48 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
AP-2複合体サブユニットシグマ は、 ヒトでは AP2S1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
2つの主要なクラスリン関連アダプター複合体のうちの1つであるAP-2は、細胞膜に結合するヘテロ四量体です。この複合体は、2つの大鎖、1つの中鎖、および小鎖で構成されています。この遺伝子は、この複合体の小鎖をコードしています。この遺伝子では選択的スプライシングが観察されており、2つの転写産物が知られています。 [7]
参考文献
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さらに読む
Pearse BM, Smith CJ, Owen DJ (2000). 「エンドサイトーシスにおけるクラスリンコートの構築」. Curr. Opin. Struct. Biol . 10 (2): 220–8 . doi :10.1016/S0959-440X(00)00071-3. PMID 10753805. Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」 Mol. Syst. Biol . 3 (1) 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 . Byland R, Vance PJ, Hoxie JA, Marsh M (2007). 「保存されたジロイシンモチーフがクラスリンおよびAP-2依存性のHIV-1エンベロープタンパク質のエンドサイトーシスを媒介する」 Mol. Biol. Cell . 18 (2): 414–25 . doi :10.1091/mbc.E06-06-0535. PMC 1783771. PMID 17108326 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Batonick M, Favre M, Boge M, et al. (2006). 「HIV-1 Gagとクラスリン関連アダプターAP-2との相互作用」. Virology . 342 (2): 190– 200. doi : 10.1016/j.virol.2005.08.001 . PMID 16139856. Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、そして拡大」 Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Vendeville A, Rayne F, Bonhoure A, et al. (2005). 「HIV-1 Tatはコーティングピットを介してT細胞に侵入し、酸性エンドソームから移行して生物学的反応を誘発する」 Mol. Biol. Cell . 15 (5): 2347–60 . doi :10.1091/mbc.E03-12-0921. PMC 404028. PMID 15020715 . Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Collins BM, McCoy AJ, Kent HM, et al. (2002). 「エンドサイトーシスAP2複合体の分子構造と機能モデル」. Cell . 109 (4): 523–35 . doi : 10.1016/S0092-8674(02)00735-3 . PMID 12086608. S2CID 483953. Berlioz-Torrent C, Shacklett BL, Erdtmann L, et al. (1999). 「ヒトおよびサルレトロウイルス膜貫通タンパク質の細胞質ドメインとクラスリンアダプター複合体の構成要素との相互作用は、エンベロープ糖タンパク質の細胞内および細胞表面発現を調節する」 J. Virol . 73 (2): 1350–61 . doi :10.1128/JVI.73.2.1350-1361.1999. PMC 103959. PMID 9882340 . Kirchhausen T, Nathanson KL, Matsui W, et al. (1989). 「クラスリン関連タンパク質複合体AP-2の大型（100～115 kDa）鎖の2つのドメインへの構造的・機能的分割」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (8): 2612–6 . Bibcode :1989PNAS...86.2612K. doi : 10.1073/pnas.86.8.2612 . PMC 286967. PMID 2495531 . Kirchhausen T, Davis AC, Frucht S, et al. (1991). 「哺乳類のクラスリン関連タンパク質複合体の小鎖であるAP17とAP19は、酵母における推定ホモログであるYap17pと相同性を示す」 J. Biol. Chem . 266 (17): 11153–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)99141-6 . PMID 2040623.
外部リンク
