アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素

真菌、植物、原核生物におけるアミノ酸合成酵素
アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素
アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素テトラマー、Trichophyton rubrum
識別子
EC番号1.2.1.11
CAS番号9000-98-0
データベース
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エクスパスNiceZymeビュー
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メタサイクル代謝経路
プリアモスプロフィール
PDB構造RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジーアミゴー / クイックゴー
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NCBIタンパク質

酵素学においてアスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素(EC 1.2.1.11)は、原核生物、真菌、および一部の高等植物におけるアミノ酸の生合成において非常に重要な酵素です。アスパラギン酸からリジン、メチオニン、ロイシン、イソロイシンを生成する代謝経路の初期分岐点を形成します。この経路は、細菌細胞壁形成に重要な役割を果たすジアミノピメリン酸も生成します。ASADHは、この酵素を不活性化すると生物にとって致命的となることから、特に注目されています。ASADH阻害を目的とした新たな抗生物質、殺菌剤、除草剤の開発が期待されています。[要出典]

酵素は可逆的な化学反応を触媒する

L-アスパラギン酸4-セミアルデヒド + リン酸 + NADP + L -4-アスパルチルリン酸 + NADPH + H + {\displaystyle \rightleftharpoons }

この酵素の3つの基質はL-アスパラギン酸4-セミアルデヒドリン酸NADP +であり、3つの生成物はL-4-アスパルチルリン酸、NADPHH +である。しかし、生理学的条件下では、反応は逆方向に進行する。

この酵素は酸化還元酵素ファミリーに属し、特にNAD+またはNADP+を受容体として供与体のアルデヒド基またはオキソ基に作用する酵素です。この酵素クラスの系統名は、 L-アスパラギン酸-4-セミアルデヒド:NADP+酸化還元酵素(リン酸化)です。一般的な他の名称には、アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素、アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素、L-アスパラギン酸-β-セミアルデヒド:NADP+酸化還元酵素リン酸化)アスパラギン酸-β-セミアルデヒド脱水素酵素、ASA脱水素酵素などがあります。この酵素は、グリシンセリンスレオニンの代謝およびリジンの生合成に関与します

アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素は、一部の Asd 遺伝子の5' UTRにあるAsd RNA モチーフによってシス制御される可能性があります。

タンパク質ファミリー

タンパク質ドメイン
セミアルデヒド脱水素酵素、二量体化ドメイン
識別子
シンボルセミアルディド_dhC
ファムPF02774
ファム一族CL0139
インタープロIPR012280
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要

このドメインには、アルギニン生合成に関与するN-アセチルグルタミンセミアルデヒド脱水素酵素(AgrC)と、アスパラギン酸から様々なアミノ酸を生合成する酵素であるアスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素[1]の両方が含まれています。また、酵母および真菌のArg5,6タンパク質も含まれており、これはN-アセチル-γ-グルタミルリン酸還元酵素アセチルグルタミン酸キナーゼに切断されます。これらもアルギニン生合成に関与しています。このエントリのすべてのタンパク質は、セミアルデヒド脱水素酵素の二量体化ドメインを含んでいます。

構造研究

2007 年末現在、このクラスの酵素については 24 の構造が解明されており、PDBアクセス コードは 1BRM、1GL3、1MB4、1MC4、1NWC、1NWH、1NX6、1OZA、1PQP、1PQU、1PR3、1PS8、1PU2、1Q2X、1T4B、1T4D、1TA4、1TB4、1YS4、2EP5、2GYY、2GZ1、2GZ2、2GZ3 です。

参考文献

  1. ^ Hadfield A, Kryger G, Ouyang J, Petsko GA, Ringe D, Viola R (1999). 「大腸菌由来のアスパラギン酸-β-セミアルデヒド脱水素酵素の構造。アスパラギン酸ファミリーのアミノ酸生合成における鍵酵素」J Mol Biol . 289 (4): 991– 1002. doi :10.1006/jmbi.1999.2828. PMID  10369777.
  • BLACK S, WRIGHT NG (1955). 「アスパラギン酸β-セミアルデヒド脱水素酵素とアスパラギン酸β-セミアルデヒド」. J. Biol. Chem . 213 (1): 39– 50. doi : 10.1016/S0021-9258(18)71042-9 . PMID  14353904.
  • Boyer, PD, Lardy, H. および Myrback, K. (編)、『酵素』第 2 版、第 7 巻、Academic Press、ニューヨーク、1963 年、203-221 ページ。


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