TCF3

TCF3
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MH0、2YPA、2YPB、3U5V
識別子
別名	TCF3、E2A、E47、ITF1、TCF-3、VDIR、bHLHb21、AGM8、転写因子3、p75
外部ID	OMIM : 147141; MGI : 98510; HomoloGene : 2408; GeneCards : TCF3; OMA : TCF3 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 19番染色体（ヒト）[1] バンド 19p13.3 開始 1,609,290bp [1] 終了 1,652,605bp [1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 10番染色体（マウス）[2] バンド 10 C1|10 39.72 cM 開始 80,245,348 bp [2] 終了 80,269,481 bp [2]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 神経節隆起 脳室帯 右精巣 左精巣 膵管細胞 リンパ節 骨髄細胞 生殖腺 虫垂 子宮内膜の間質細胞 最もよく発現している 脳室帯 生殖結節 胚の尾部 下顎突出 上顎突出 口唇 乳頭上皮 体節 腹壁 卵黄嚢 その他の参考発現データ バイオGPS その他の参考発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 配列特異的DNA結合 タンパク質二量体形成活性 タンパク質ホモ二量体形成活性 DNA結合転写因子活性 マイトジェン活性化プロテインキナーゼキナーゼキナーゼ結合 ビタミンD応答要素結合 転写コアクチベーター活性 転写因子結合 RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合 DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的 bHLH転写因子結合 Eボックス結合 タンパク質結合 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 細胞質 転写調節因子複合体 RNAポリメラーゼII転写調節因子複合体 核 核小体 核質 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス 細胞分化 DNAテンプレートによる転写の調節 筋細胞分化の正の調節 DNA結合転写因子活性の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 DNAテンプレート転写 神経系の発達 DNAテンプレート転写の正の調節 有糸分裂細胞周期のG1/S移行の調節 B細胞系統の決定 細胞周期の正の調節 B細胞増殖の正の調節 ニューロン分化の正の調節 B細胞分化 免疫グロブリンV(D)J組換え RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 造血幹細胞の分化の制御 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 6929 21423 アンサンブル ENSG00000071564 ENSMUSG00000020167 ユニプロット P15923 P15806 RefSeq (mRNA) NM_001136139 NM_003200 NM_001351778 NM_001351779 NM_001164147 NM_001164148 NM_001164149 NM_001164150 NM_001164151 NM_001164152 NM_001164153 NM_011548 NM_001378903 NM_001378904 NM_001378905 NM_001378908 NM_001378910 NM_001378912 NM_001378913 NM_001378914 RefSeq（タンパク質） NP_001129611 NP_003191 NP_001338707 NP_001338708 NP_001157619 NP_001157620 NP_001157621 NP_001157622 NP_001157623 NP_001157624 NP_001157625 NP_035678 NP_001365832 NP_001365833 NP_001365834 NP_001365837 NP_001365839 NP_001365841 NP_001365842 NP_001365843 場所（UCSC） 19番地：1.61～1.65メガバイト 10番地：80.25～80.27メガバイト PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

転写因子3（E2A免疫グロブリンエンハンサー結合因子E12/E47 ）はTCF3としても知られ、ヒトではTCF3遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7] TCF3はHes1（} Notchシグナル伝達のよく知られた標的）の発現を直接促進することが示されている。^[8]

機能

この遺伝子は、ヘリックス・ループ・ヘリックス 転写因子のEタンパク質（クラスI）ファミリーのメンバーをコードしています。Eタンパク質とMLLの9aaTAD転写活性化ドメインは非常に類似しており、どちらも汎用転写メディエーターCBPのKIXドメインに結合します。^{[9] [10]} Eタンパク質は、ヘテロ二量体またはホモ二量体として標的遺伝子の調節性Eボックス配列に結合して転写を活性化し、DNA結合阻害因子（クラスIV）ヘリックス・ループ・ヘリックスタンパク質とのヘテロ二量体形成によって阻害されます。Eタンパク質はリンパ球新生において重要な役割を果たしており、コードされているタンパク質はBリンパ球およびTリンパ球の発達に必要です。^[5]

この遺伝子は、リンパ球や中枢神経系（CNS）の発達など、多くの発達パターン形成過程を制御します。Eタンパク質はリンパ球の発達に関与しています。^[11] Eタンパク質は、標的遺伝子上の制御性Eボックス配列に結合することで転写を開始します。

臨床的意義

この遺伝子の欠失またはコードされているタンパク質の活性低下は、リンパ系悪性腫瘍において役割を果たす可能性があります。この遺伝子は、前B細胞急性リンパ芽球性白血病（PBX1を伴うt(1;19)、HLFを伴うt(17;19)）^{[12]、小児白血病（TFPTを伴うt(19;19)）}、急性白血病（ZNF384を伴うt(12;19)）など、リンパ系悪性腫瘍に関連するいくつかの染色体転座にも関与しています。^[5]

相互作用

TCF3は以下と 相互作用することが示されています

• CBFA2T3 , ^[13]
• CREBBP , ^[14]
• ELK3 , ^[15]
• EP300 , ^[14]
• ID3、^{[16] [17]}
• LDB1 , ^[13]
• LMX1A , ^[18]
• LYL1 , ^[19]
• MAPKAPK3 , ^[20]
• MyoD、^{[17] [21]}
• ミオゲニン、^{[17] [22]}
• PCAF、^[14]
• TAL1 ^{[13] [23]}
• TWIST1、^[24] および
• UBE2I . ^[25]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000071564 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020167 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 「Entrez Gene: TCF3」。
6. Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (1990年2月). 「正に作用する転写因子ITF-1をコードするcDNAの配列」. Nucleic Acids Research . 18 (3): 677. doi :10.1093/nar/18.3.677. PMC 333499. PMID 2308859  . 
7. Kamps MP, Murre C, Sun XH, Baltimore D (1990年2月). 「新規ホメオボックス遺伝子がpre-B ALLにおけるt(1;19)転座タンパク質のDNA結合ドメインに寄与する」. Cell . 60 (4): 547– 555. doi :10.1016/0092-8674(90)90658-2. PMID  1967983. S2CID  39661371.
8. Eタンパク質とノッチシグナル伝達は協力してT細胞系統の特定とコミットメントを促進する
9. Piskacek S, Gregor M, Nemethova M, Grabner M, Kovarik P, Piskacek M (2007年6月). 「9アミノ酸トランス活性化ドメイン：確立と予測ユーティリティ」. Genomics . 89 (6): 756– 768. doi :10.1016/j.ygeno.2007.02.003. PMID  17467953.
10. Piskacek M, Vasku A, Hajek R, Knight A (2015年3月). 「CBPと複合体を形成する9aaTADファミリーの共通の構造的特徴」. Molecular BioSystems . 11 (3): 844– 851. doi : 10.1039/c4mb00672k . PMID  25564305.
11. Quong MW, Romanow WJ, Murre C (2002). 「リンパ球の発達におけるEタンパク質の機能」. Annual Review of Immunology . 20 : 301–322 . doi :10.1146/annurev.immunol.20.092501.162048. PMID  11861605.
12. Herblot S, Aplan PD, Hoang T (2002年2月). 「B細胞発達におけるE2A活性の勾配」. Molecular and Cellular Biology . 22 (3): 886– 900. doi :10.1128/MCB.22.3.886-900.2002. PMC 133542. PMID  11784864 . 
13. Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, et al. (2006年1月). 「ETO2は赤血球生成における細胞増殖と分化を調整する」. The EMBO Journal . 25 (2): 357– 366. doi :10.1038/sj.emboj.7600934. PMC 1383517. PMID 16407974  . 
14. Bradney C, Hjelmeland M, Komatsu Y, Yoshida M, Yao TP, Zhuang Y (2003年1月). 「Bリンパ球の発達におけるヒストンアセチルトランスフェラーゼによるE2A活性の制御」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (4): 2370– 2376. doi : 10.1074/jbc.M211464200 . PMID  12435739.
15. Maira SM, Wurtz JM, Wasylyk B (1996年11月). 「Ras誘導性TCFの一つであるNet (ERP/SAP2)は、ヘリックス・ループ・ヘリックスモチーフに類似した新規阻害ドメインを有する」. The EMBO Journal . 15 (21): 5849– 5865. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00972.x. PMC 452333. PMID  8918463 . 
16. Deed RW, Jasiok M, Norton JD (1998年4月). 「造血細胞におけるId3遺伝子のリンパ球特異的発現．Id3誘導性赤白血病細胞分化に関連するE2A塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質の選択的拮抗作用」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (14): 8278– 8286. doi : 10.1074/jbc.273.14.8278 . PMID  9525934.
17. Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (1997年8月). 「Idタンパク質とbasic-helix-loop-helix転写因子との異なる相互作用」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (32): 19785– 19793. doi : 10.1074/jbc.272.32.19785 . PMID  9242638.
18. Johnson JD, Zhang W, Rudnick A, Rutter WJ, German MS (1997年7月). 「LIM-ホメオドメインタンパク質と塩基性ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質間の転写相乗効果：LIM2ドメインが特異性を決定する」. Molecular and Cellular Biology . 17 (7): 3488– 3496. doi :10.1128/mcb.17.7.3488. PMC 232202. PMID 9199284  . 
19. Miyamoto A, Cui X, Naumovski L, Cleary ML (1996年5月). 「ヘリックス-ループ-ヘリックスタンパク質LYL1とE2aは、ヘマトリンパ球系細胞において、特異なDNA結合特性を持つヘテロ二量体複合体を形成する」. Molecular and Cellular Biology . 16 (5): 2394– 2401. doi :10.1128/mcb.16.5.2394. PMC 231228. PMID 8628307  . 
20. Neufeld B, Grosse-Wilde A, Hoffmeyer A, Jordan BW, Chen P, Dinev D, et al. (2000年7月). 「セリン／スレオニンキナーゼ3pKおよびMAPK活性化プロテインキナーゼ2は、塩基性ヘリックス・ループ・ヘリックス転写因子E47と相互作用し、その転写活性を抑制する」The Journal of Biological Chemistry . 275 (27): 20239– 20242. doi : 10.1074/jbc.C901040199 . PMID  10781029.
21. Maleki SJ, Royer CA, Hurlburt BK (1997年6月). 「MyoD-E12ヘテロダイマーとMyoD-MyoDホモダイマーは同等に安定している」.生化学. 36 (22): 6762– 6767. doi :10.1021/bi970262m. PMID  9184158.
22. Chakraborty T, Martin JF, Olson EN (1992年9月). 「2ハイブリッドアッセイシステムを用いたin vivoにおけるミオジェニンおよびE2A産物のオリゴマー化の解析」. The Journal of Biological Chemistry . 267 (25): 17498– 17501. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37069-3 . PMID  1325437.
23. Hsu HL, Wadman I, Baer R (1994年4月). 「白血病T細胞におけるTAL1およびE2Aポリペプチド間の生体内複合体の形成」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (8): 3181– 3185. Bibcode :1994PNAS...91.3181H. doi : 10.1073/pnas.91.8.3181 . PMC 43539. PMID 8159721  . 
24. El Ghouzzi V, Legeai-Mallet L, Aresta S, Benoist C, Munnich A, de Gunzburg J, et al. (2000年3月). 「Saethre-Chotzen変異はTWISTタンパク質の分解または核内局在の障害を引き起こす」. Human Molecular Genetics . 9 (5): 813– 819. doi : 10.1093/hmg/9.5.813 . PMID  10749989.
25. Huggins GS, Chin MT, Sibinga NE, Lee SL, Haber E, Lee ME (1999年10月). 「E2Aタンパク質分解に必要なmUBC9結合部位の特性解析」. The Journal of Biological Chemistry . 274 (40): 28690– 28696. doi : 10.1074/jbc.274.40.28690 . PMID  10497239.

さらに読む

• LeBrun DP (2003年5月). 「ヒト白血病におけるE2A基本ヘリックス-ループ-ヘリックス転写因子」. Frontiers in Bioscience . 8 ( 1–3 ): s206 – s222 . doi : 10.2741/1030 . PMID  12700034.

この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。