サボテン

サボテン
識別子
エイリアス	CACTIN、C19orf29、NY-REN-24、fSAPc、カクチン、スプライソソームC複合体サブユニット
外部ID	オミム：618536; MGI : 1917562;ホモロジーン: 69553;ジーンカード：カクティン; OMA :CACTIN - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	19番染色体（ヒト）
終わり	3,626,815 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	10番染色体（マウス）
終わり	81,162,076 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	腓骨神経; ; 顆粒球; ; 右卵巣; ; 左卵巣; ; 小脳の右半球; ; 左卵管; ; 心臓の頂点; ; 子宮体部; ; 腓腹筋; ; 横行結腸粘膜;
	上位の表現
	耳小胞; ; 心室中隔; ; 手; ; 腹壁; ; 原始的な条線; ; 胚葉上層; ; 原腸胚; ; 一次卵母細胞; ; 腸間膜リンパ節; ; 胸腺;
	より多くの参照表現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; RNA結合;
細胞成分	触媒ステップ2スプライソソーム; 核質; スプライセオソーム複合体; 細胞外エクソソーム; 核; 細胞質; 核の粒子; 細胞質;
生物学的プロセス	タンパク質リン酸化の負の制御; スプライソソームを介したmRNAスプライシング; 免疫システムのプロセス; I型インターフェロンを介したシグナル伝達経路の負の制御; 腫瘍壊死因子に対する細胞反応; mRNA処理; インターフェロンβ産生の負の調節; リポ多糖類を介したシグナル伝達経路の負の制御; 多細胞生物の発達; インターロイキン-8産生の負の調節; Toll様受容体シグナル伝達経路の負の制御; インターロイキン-1に対する細胞応答; RNAスプライシング; 腫瘍壊死因子産生の負の調節; 自然免疫反応; リポ多糖に対する細胞反応; NF-κB転写因子活性の負の制御;
	出典：Amigo / QuickGO
オルソログ
	58509
	70312
	ENSG00000105298
	ENSMUSG00000034889
	Q8WUQ7
	Q9CS00
	NM_001080543 ; NM_021231
	NM_027381
	NP_001074012 ; NP_067054
	NP_081657
	ウィキデータ
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ヒトのタンパク質コード遺伝子

カクチンは腎癌抗原NY-REN-24としても知られ、ヒトではCACTIN遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

カクチンはもともとショウジョウバエ（Drosophila）で同定されました。カクチン遺伝子産物は自然免疫系の制御に関与しており、 Toll様受容体、インターフェロン調節因子（IRF）、そして標準的なNF-κBシグナル伝達経路の負の調節因子として機能します。 ^[9]

構造

全長サクチンタンパク質の長さは3,150bpで、N末端は356～547残基、C末端は731～855残基のドメインを持つ。^[10]

種と組織分布

このタンパク質は全ての脊椎動物の多くの臓器や組織に存在しますが、植物、原生生物、真菌にも存在することが分かっています。カクチン遺伝子の濃度が最も高い部位は、雄の精巣と脾臓です。精巣などの特定の領域に存在するカクチン遺伝子は、RNA結合活性を可能にします。このタンパク質は、サイトカインに対する細胞応答や負のシグナル伝達（負のフィードバックループ）といった他のプロセスにも関与していることが分かっています。^[11]

植物では

植物では、カクトシンは核スペックルに局在するSRタンパク質と関連している。^[12]植物細胞とヒト細胞は同じスプライセオソームタンパク質を共有しており、成熟したメッセンジャーRNAを形成するためにイントロンが除去される。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000105298 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034889 – Ensembl、2017年5月
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^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996年4月). 「改良ショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」. Analytical Biochemistry . 236 (1): 107– 113. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, et al. (1997年4月). 「大規模連結cDNAシークエンシング」. Genome Research . 7 (4): 353– 358. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
^ 「Entrez Gene: C19orf29 染色体 19 オープンリーディングフレーム 29」。
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^ 「CACTIN遺伝子 - GeneCards | CATINタンパク質 | CATIN抗体」www.genecards.org . 2022年3月3日閲覧。
^ Zhang S, Shi L, Yang QH, Dong XH, Chi SY, Liu HY, Tan BP (2014年12月). 「Litopenaeus vannamei由来のCactin遺伝子の分子特性と機能解析」. Fish & Shellfish Immunology . 41 (2): 608– 617. Bibcode :2014FSI....41..608Z. doi :10.1016/j.fsi.2014.10.014. PMID 25462455.
^ 「CACTIN カクチン、スプライソソームC複合体サブユニット [Homo sapiens (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2022年4月24日閲覧。
^ Baldwin KL, Dinh EM, Hart BM, Masson PH (2013年4月). 「CACTINはシロイヌナズナにおいて必須の核タンパク質であり、真核生物のスプライセオソームと関連している可能性がある」. FEBS Letters . 587 (7): 873– 879. Bibcode :2013FEBSL.587..873B. doi : 10.1016/j.febslet.2013.02.041 . PMID 23454656. S2CID 10857716.

さらに読む

Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, 他 (1999年11月). 「腎細胞癌患者における自己抗体による抗原認識」. International Journal of Cancer . 83 (4): 456– 464. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . PMID 10508479.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002年4月). 「三次元構造解析に適したネイティブスプライセオソームの精製と特性解析」. RNA . 8 (4) S1355838202021088: 426– 439. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (2004年1月). 「ハイスループット酵母ツーハイブリッドシステムの解析と、ヒトMHCクラスIII領域にコードされる細胞内タンパク質の機能予測への応用」Genomics . 83 (1): 153– 167. doi :10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, et al. (2004年6月). 「トランスクリプトーム解析によりヒトES細胞の増殖と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」Nature Biotechnology 22 (6): 707– 716. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, 他 (2004年8月). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130– 12135. Bibcode :2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000105298 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034889 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid8619474-5] Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996年4月). 「改良ショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」. Analytical Biochemistry . 236 (1): 107– 113. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.

[pmid9110174-6] Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, et al. (1997年4月). 「大規模連結cDNAシークエンシング」. Genome Research . 7 (4): 353– 358. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .

[entrez-7] 「Entrez Gene: C19orf29 染色体 19 オープンリーディングフレーム 29」。

[8] Jo YH, Kim YJ, Park KB, Seong JH, Kim SG, Park S, 他 (2017年4月). 「TmCactinは、テネブリオ・モリターにおける7つのAMP遺伝子の発現を制御することで、グラム陰性細菌およびグラム陽性細菌の感染において重要な役割を果たす」. Scientific Reports . 7 (1) 46459. Bibcode :2017NatSR...746459J. doi :10.1038/srep46459. PMC 5394457. PMID 28418029 .

[9] 「CACTIN遺伝子 - GeneCards | CATINタンパク質 | CATIN抗体」www.genecards.org . 2022年3月3日閲覧。

[10] Zhang S, Shi L, Yang QH, Dong XH, Chi SY, Liu HY, Tan BP (2014年12月). 「Litopenaeus vannamei由来のCactin遺伝子の分子特性と機能解析」. Fish & Shellfish Immunology . 41 (2): 608– 617. Bibcode :2014FSI....41..608Z. doi :10.1016/j.fsi.2014.10.014. PMID 25462455.

[11] 「CACTIN カクチン、スプライソソームC複合体サブユニット [Homo sapiens (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2022年4月24日閲覧。

[12] Baldwin KL, Dinh EM, Hart BM, Masson PH (2013年4月). 「CACTINはシロイヌナズナにおいて必須の核タンパク質であり、真核生物のスプライセオソームと関連している可能性がある」. FEBS Letters . 587 (7): 873– 879. Bibcode :2013FEBSL.587..873B. doi : 10.1016/j.febslet.2013.02.041 . PMID 23454656. S2CID 10857716.