TRNT1

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
TRNT1
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスTRNT1、CCA1、MtCCA、CGI-47、SIFD、tRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ1、RPEM
外部IDオミム:612907; MGI : 1917297;ホモロジーン: 9333;ジーンカード:TRNT1; OMA :TRNT1 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001302946
NM_016000
NM_182916

NM_001242358
NM_001242360
NM_027296

RefSeq(タンパク質)

NP_001289875
NP_886552
NP_001354250
NP_001354251
NP_001354252

NP_001229287
NP_001229289
NP_081572

場所(UCSC)3 章: 3.13 – 3.15 Mb6番目の文字: 106.75 – 106.76 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
人間の表示/編集マウスの表示/編集

tRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ1は、ヒトではTRNT1遺伝子によってコードされる酵素である[5] [6] [7]この酵素は、 ATPCTPを基質として、tRNA の3'末端にヌクレオチド配列CCAを付加する。この配列はアミノ酸の結合部位を形成する。[8]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000072756 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000013736 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000年8月). 「比較プロテオミクスによるCaenorhabditis elegansにおいて進化的に保存された新規ヒト遺伝子の同定」. Genome Res . 10 (5): 703–13 . doi :10.1101/gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093  . 
  6. ^ 長池 剛志、鈴木 剛志、泊 雄志、竹本-堀 千恵子、根ヶ山 史朗、渡辺 健志、上田 剛志 (2001年10月). 「哺乳類ミトコンドリアtRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼの同定と特性評価」. J Biol Chem . 276 (43): 40041–9 . doi : 10.1074/jbc.M106202200 . PMID  11504732.
  7. ^ 「Entrez Gene: TRNT1 tRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ、CCA付加、1」。
  8. ^ Lizano E, Scheibe M, Rammelt C, Betat H, Mörl M (2008年5月). 「ヒトおよび大腸菌由来のCCA付加酵素の比較分析:CCA付加とtRNA 3'末端修復における差異」. Biochimie . 90 (5): 762–72 . doi :10.1016/j.biochi.2007.12.007. PMID  18226598.

さらに読む

  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC 310948.  PMID 11076863  .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて:新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi :10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072.  PMID 11230166  .
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, et al. (2001). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」. EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614 .
  • Reichert AS, Thurlow DL, Mörl M (2002). 「ヒトtRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼは真正細菌由来か?」Biol. Chem . 382 (10): 1431–8 . CiteSeerX  10.1.1.657.1235 . doi :10.1515/BC.2001.176. PMID  11727826. S2CID  230616.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
  • Augustin MA, Reichert AS, Betat H, et al. (2003). 「ヒトCCA付加酵素の結晶構造:鋳型非依存性重合への知見」J. Mol. Biol . 328 (5): 985–94 . doi : 10.1016/S0022-2836(03)00381-4 . PMID  12729736.
  • Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ:機能ゲノミクスパイプライン」Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi :10.1101/gr.2576704. PMC  528930. PMID  15489336 .
  • 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). 「LIFEdbデータベース 2006」Nucleic Acids Res 34 (データベース号): D415–8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC  1347501. PMID  16381901 .
  • Lizano E, Schuster J, Müller M, et al. (2007). 「活性が改変されたヒトCCA付加酵素のスプライスバリアント」J. Mol. Biol . 366 (4): 1258–65 . doi :10.1016/j.jmb.2006.12.016. PMID  17204286.


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