ホモサピエンスで発見された哺乳類タンパク質
| CCL28 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CCL28、CCK1、MEC、SCYA28、CCモチーフケモカインリガンド28 |
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| 外部ID | オミム:605240; MGI : 1861731;ホモロジーン: 10649;ジーンカード:CCL28; OMA :CCL28 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 13番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 13|13 D2.3 | 始める | 120,085,355 bp [2] |
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| 終わり | 120,115,895 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 耳下腺
- 膵管細胞
- 小唾液腺
- 直腸
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 結腸粘膜
- 乳腺上皮
- S状結腸粘膜
- 乳管
- 横行結腸粘膜
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| | 上位の表現 | - 涙腺
- 唾液腺
- パネートセル
- 顎下腺
- 耳下腺
- 左結腸
- 十二指腸
- 近位尿細管
- 右腎臓
- 回腸
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞外領域
- 細胞外エクソソーム
- 細胞外空間
- 分泌顆粒
| | 生物学的プロセス |
- 細胞走化性
- 走化性
- 細胞質カルシウムイオン濃度の正の調節
- 白血球の係留またはローリングの負の調節
- 免疫反応
- 細胞-マトリックス接着の正の調節
- 栄養素への反応
- 抗菌ペプチドを介した抗菌性体液性免疫応答
- シグナル伝達受容体の活性調節
- Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001301873 NM_001301874 NM_001301875 NM_019846 NM_148672 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001288802 NP_001288803 NP_001288804 NP_683513 |
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| 場所(UCSC) | 5章: 43.38 – 43.41 Mb | 13章: 120.09 – 120.12 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ケモカイン(CC モチーフ)リガンド 28(CCL28)は、粘膜関連上皮ケモカイン(MEC)、CCK1、SCYA28 としても知られるケモカインです。CCL28 は、ケモカイン受容体CCR3およびCCR10を発現する細胞の走化性を制御します。CCL28 は、腸、肺、乳房、唾液腺の円柱上皮細胞で発現し、CCR10 を発現するTリンパ球とB リンパ球の粘膜ホーミング、および CCR3 を発現する好酸球の移動を促進します。[5] [6] [7]このケモカインは結腸で恒常的に発現していますが、そのレベルは炎症誘発性サイトカインや特定の細菌産物によって上昇することがあり、上皮損傷部位へのエフェクター細胞のリクルートメントに役割を果たしていることが示唆されています。[8] CCL28は、 IgA発現細胞の乳腺、[9]唾液腺、腸管[10]およびその他の粘膜組織への遊走にも関与していることが示唆されています。[11]また、グラム陰性菌やグラム陽性菌、カンジダ・アルビカンスなどの特定の病原体に対して有効な抗菌剤としても期待されています。[8]
ヒトCCL28は、373ヌクレオチドのRNA転写産物と4つのエクソンを持つ遺伝子によってコードされています。この遺伝子は、22アミノ酸からなるN末端シグナルペプチドを含む127アミノ酸からなるCCL28タンパク質をコードしています。マウスの同等の分子と76%の核酸相同性および83%のアミノ酸相同性を有しています。[12] [13]配列解析により、CCL28はCCL27と呼ばれる別のCCケモカインと最も類似していることが明らかになっています。
ジーン地区
C5orf34遺伝子はCCL28の下流に位置し、ポロ様キナーゼファミリーに属すると予測されている。C5orf34は塩基対43,486,701から塩基対43,515,445まで伸びている。[14]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000151882 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000074715 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Rodriguez MW, Paquet AC, Yang YH, Erle DJ (2004年7月). 「インテグリンβ7+およびβ7-メモリーTヘルパー細胞による遺伝子発現の差異」. BMC Immunology . 5-13 . doi : 10.1186/1471-2172-5-13 . PMC 476736. PMID 15236665 .
- ^ Kunkel EJ, Kim CH, Lazarus NH, Vierra MA, Soler D, Bowman EP, Butcher EC (2003年4月). 「CCR10の発現は、循環血中および粘膜上皮組織のIgA抗体分泌細胞に共通する特徴である」. The Journal of Clinical Investigation . 111 (7): 1001–10 . doi :10.1172/JCI17244. PMC 152588. PMID 12671049 .
- ^ John AE, Thomas MS, Berlin AA, Lukacs NW (2005年2月). 「CCL28の一過性産生は、アレルギー性気道炎症における好酸球蓄積および気道過敏性亢進と相関する」. The American Journal of Pathology . 166 (2): 345–53 . doi :10.1016/S0002-9440(10)62258-4. PMC 1602329. PMID 15681819 .
- ^ ab Hieshima K, Ohtani H, Shibano M, Izawa D, Nakayama T, Kawasaki Y, Shiba F, Shiota M, Katou F, Saito T, Yoshie O (2003年2月). 「CCL28は広域抗菌活性ケモカインとして粘膜免疫において二重の役割を果たす」. Journal of Immunology . 170 (3): 1452–61 . doi : 10.4049/jimmunol.170.3.1452 . PMID 12538707.
- ^ Wilson E, Butcher EC (2004年9月). 「CCL28は授乳中の乳腺における免疫グロブリン(Ig)A形質細胞の蓄積と新生児へのIgA抗体の移行を制御する」. The Journal of Experimental Medicine . 200 (6): 805–9 . doi :10.1084/jem.20041069. PMC 2211970. PMID 15381732 .
- ^ Feng N, Jaimes MC, Lazarus NH, Monak D, Zhang C, Butcher EC, Greenberg HB (2006年5月). 「ロタウイルス感染後の腸管粘膜固有層へのIgA陽性形質芽球動員におけるケモカインCCL25/TECKおよびCCL28/MECの重複した役割」. Journal of Immunology . 176 (10): 5749–59 . doi : 10.4049/jimmunol.176.10.5749 . PMID 16670280.
- ^ Lazarus NH, Kunkel EJ, Johnston B, Wilson E, Youngman KR, Butcher EC (2003年4月). 「一般的な粘膜ケモカイン(粘膜関連上皮ケモカイン/CCL28)はIgA形質芽球を選択的に誘引する」. Journal of Immunology . 170 (7): 3799– 805. doi : 10.4049/jimmunol.170.7.3799 . PMID 12646646.
- ^ Wang W, Soto H, Oldham ER, Buchanan ME, Homey B, Catron D, Jenkins N, Copeland NG, Gilbert DJ, Nguyen N, Abrams J, Kershenovich D, Smith K, McClanahan T, Vicari AP, Zlotnik A (2000年7月). 「CCR10 (GPR2)に結合する新規ケモカイン(CCL28)の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (29): 22313–23 . doi : 10.1074/jbc.M001461200 . PMID 10781587.
- ^ Pan J, Kunkel EJ, Gosslar U, Lazarus N, Langdon P, Broadwell K, Vierra MA, Genovese MC, Butcher EC, Soler D (2000年9月). 「粘膜組織における上皮細胞によって発現されるCCR10およびCCR3に対する新規ケモカインリガンド」. Journal of Immunology . 165 (6): 2943–9 . doi : 10.4049/jimmunol.165.6.2943 . PMID 10975800.
- ^ 「CCL28 CCモチーフケモカインリガンド28 [ホモサピエンス(ヒト)]」。遺伝子 – NCBI。