CLTC

CLTC
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2XZG、4G55
識別子
別名	CLTC、CHC、CHC17、CLH-17、CLTCL2、Hc、クラスリン重鎖、MRD56
外部ID	OMIM : 118955; MGI : 2388633; HomoloGene : 3572; GeneCards : CLTC; OMA : CLTC - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 17番染色体（ヒト）[1] バンド 17q23.1 開始 59,619,689 bp [1] 終了 59,696,956 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 11番染色体（マウス）[2] バンド 11|11 C 開始 86,585,177 bp [2] 終了 86,648,391 bp [2]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 橋 視床外側核群 ブロードマン領域46 中側頭回 S状結腸粘膜 眼窩前頭皮質 中心後回 精巣上体 海綿骨 緻密部 最もよく発現している 骨髄間質 手綱 橋核 内側膝状体核 内側背側核 内側前庭神経核 視床下部背内側核 外側膝状体核 深部小脳核 腹側被蓋野 より多くの参照発現データ BioGPS より多くの参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 二本鎖RNA結合 タンパク質キナーゼ結合 構造分子活性 RNA結合 クラスリン軽鎖結合 無秩序なドメイン特異的結合 低密度リポタンパク質粒子受容体結合 ユビキチン特異的プロテアーゼ結合 細胞成分 細胞外小胞 細胞質 クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞膜 被覆小胞のクラスリン被覆 トランスゴルジ網膜 トランスゴルジ網小胞のクラスリンコート 接着斑 メラノソーム 細胞膜 エンドリソソーム膜 クラスリン被覆小窩 細胞外エクソソーム 細胞質小胞膜 細胞質小胞 クラスリン被覆小胞 細胞外マトリックス 膜 有糸分裂紡錘体 微小管 細胞質 リソソーム エンドソーム 紡錘体 細胞骨格 クラスリンコート クラスリン複合体 タンパク質含有複合体 細胞内膜に囲まれた細胞小器官 クラスリン被覆エンドサイトーシス小胞 有糸分裂紡錘体 細胞内解剖学的構造 生物学的プロセス MHCクラスIIを介した抗原処理と外因性ペプチド抗原の提示 トランスフェリン輸送 受容体の内在化 タンパク質の細胞膜への局在の負の調節 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ 骨芽細胞分化 小胞輸送 ヒアルロン酸生合成過程の負の調節 細胞内タンパク質輸送 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 有糸分裂紡錘体の組織化の調節 オートファジー 微小管を基盤とした運動 細胞周期 細胞分裂 膜組織 有糸分裂細胞周期 受容体を介したエンドサイトーシス 低密度リポタンパク質粒子受容体の分解プロセス 低密度リポタンパク質粒子クリアランス クラスリンコートの組み立て クラスリン依存性エンドサイトーシス トランスサイトーシスによるアミロイドβの除去 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス Entrez 1213 67300 アンサンブル ENSG00000141367 ENSMUSG00000047126 ユニプロット Q00610 Q68FD5 RefSeq (mRNA) NM_001288653 NM_004859 NM_001003908 NM_001356393 RefSeq（タンパク質） NP_001275582 NP_004850 NP_001003908 NP_001343322 場所（UCSC） 17章: 59.62 – 59.7 MB 11章: 86.59 – 86.65 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
ヒトの表示/編集 マウスの表示/編集

クラスリン重鎖1は、ヒトではCLTC遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

クラスリンは、被覆小胞および被覆小窩と呼ばれる細胞内小器官の細胞質側の主要なタンパク質成分です。これらの特殊な小器官は、受容体の細胞内輸送や様々な高分子のエンドサイトーシスに関与しています。クラスリンコートの基本サブユニットは、3本の重鎖と3本の軽鎖で構成されています。^[7]

相互作用

CLTCはPICALM ^[8]およびHGS [ ^9]と相互作用することが示されています

参照

• クラスリン

参考文献

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000141367 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000047126 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Dodge GR, Kovalszky I, McBride OW, Yi HF, Chu ML, Saitta B, Stokes DG, Iozzo RV (1992年2月). 「ヒトクラスリン重鎖（CLTC）：部分的な分子クローニング、発現、およびヒト染色体17q11-qterへの遺伝子マッピング」. Genomics . 11 (1): 174–8 . doi :10.1016/0888-7543(91)90115-U. PMID  1765375.
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8. Tebar, F; Bohlander SK; Sorkin A (1999年8月). 「クラスリンアセンブリリンパ性骨髄性白血病（CALM）タンパク質：エンドサイトーシス被覆ピットにおける局在、クラスリンとの相互作用、そしてクラスリンを介した輸送に対する過剰発現の影響」. Mol. Biol. Cell . 10 (8): 2687– 702. doi :10.1091/mbc.10.8.2687. ISSN  1059-1524. PMC 25500. PMID 10436022  . 
9. Raiborg, C; Bache KG; Mehlum A; Stang E; Stenmark H (2001年9月). 「Hrsはクラスリンを初期エンドソームにリクルートする」. EMBO J. 20 ( 17): 5008–21 . doi :10.1093/emboj/20.17.5008. ISSN  0261-4189. PMC 125612. PMID 11532964  . 

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さらに詳しい情報

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外部リンク

• UCSCゲノムブラウザにおけるヒトCLTCゲノムの位置とCLTC遺伝子の詳細ページ