デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンス

デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンス
科学的分類
ドメイン：	細菌
王国：	バチラッティ
門:	バシロタ
クラス：	クロストリジウム
注文：	真正細菌目
家族：	デスルフィトバクテリア科
属:	デスルフィトバクテリウム
種：	D.デハロゲナンス
二名法名
	デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンス; ウトキンら1994

細菌の種

デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンスは細菌の一種です。^[1]通性有機ハロゲン化物呼吸細菌であり、クロロフェノール化合物およびテトラクロロエチレンを還元的に脱塩素化することができます。嫌気性、運動性、グラム陽性、桿菌であり、^{幅広い電子供与体および受容体を利用できます。 [2]}標準株 JW/IU-DC^T、DSM 9161、NCBi分類ID 756499。

この種の分離株としてJW/IU-DC ^T株^[1]とPCE1株^{[3]の2つが知られています。両株のゲノムは配列決定されており、いずれの株もプラスミドをコードしていませんが、6つの}還元脱ハロゲン化酵素に加えて、ゲノムにはさまざまな電子供与体と受容体を利用するための多数の遺伝子がコードされています。


歪み	ソース	ゲノムサイズ、メガビット	数還元性脱ハロゲン酵素	DSM
JW/IU-DC ^T	淡水池	4,3 ^[4]	6	9161
PCE1	汚れた魂	4,2 ^[5]	6	10344

参考文献

^ Utkin I, Woese C, Wiegel J (1994年10月). 「クロロフェノール化合物を還元的に脱塩素化する嫌気性細菌、Desulfitobacterium dehalogenans gen. nov., sp. nov. の分離と特性解析」International Journal of Systematic Bacteriology . 44 (4): 612–9 . doi : 10.1099/00207713-44-4-612 . PMID 7981092.
^ ヴィルムール R、ランティエ M、ボーデ R、レピーヌ F (2006 年 9 月)。「デスルフィトバクテリウム属」。FEMS 微生物学のレビュー。30 (5): 706–33 .土井: 10.1111/j.1574-6976.2006.00029.x。PMID 16911041。
^ Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (1996年2月). 「テトラクロロエチレンまたはオルト塩素化フェノールの還元脱塩素化によって増殖できる嫌気性細菌、Desulfitobacterium sp. PCE1株」Archives of Microbiology . 165 (2): 132– 40. doi :10.1007/s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.
^ クルーゼ・T、ファン・デ・パス BA、アテイア A、クラブ K、ハーゲン WR、グッドウィン L、チェイン P、ボーレン S、マフォサ F、シュラー G、デ・ヴォス WM、ファン・デル・オースト J、スミット H、スタムス AJ (2015 年 3 月)。「デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンスの有機ハロゲン化物呼吸経路のゲノム、プロテオミクス、および生化学的分析」。細菌学ジャーナル。197 (5): 893–904。土井:10.1128/JB.02370-14。PMC 4325113。PMID 25512312。
^ Kruse T, Goris T, Maillard J, Woyke T, Lechner U, de Vos W, Smidt H (2017年12月). 「Desulfitobacterium属の比較ゲノミクス」. FEMS Microbiology Ecology . 93 (12). doi : 10.1093/femsec/fix135 . PMID 29040502.

さらに読む

Wiegel J, Zhang X, Wu Q (1999年5月). 「Desulfitobacterium dehalogenansによるヒドロキシル化ポリ塩化ビフェニルの嫌気性脱ハロゲン化」.応用環境微生物学. 65 (5): 2217–21 . doi :10.1128/AEM.65.5.2217-2221.1999. PMC 91319. PMID 10224022 .
Mackiewicz M, Wiegel J (1998年1月). 「クロロフェノールと様々な従来型電子受容体の利用におけるDesulfitobacterium dehalogenansのエネルギー収量と増殖収量の比較」.応用環境微生物学. 64 (1): 352–5 . doi :10.1128/AEM.64.1.352-355.1998. PMC 124717. PMID 16349491 .
Bergey DH, Krieg NR, Holt JG (1989). Bergey's manual of systematic bacteriology . 第3巻. メリーランド州ボルチモア: Williams and Wilkins. pp. 2250– 2251.
Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (1996年2月). 「テトラクロロエチレンまたはオルト塩素化フェノールの還元脱塩素化によって増殖する嫌気性細菌、Desulfitobacterium sp. PCE1株」Archives of Microbiology . 165 (2): 132– 40. doi :10.1007/s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.

外部リンク

BacDive - 細菌多様性メタデータデータベースにおける Desulfitobacterium dehalogenans の標準株

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[UtkinWoese1994-1] Utkin I, Woese C, Wiegel J (1994年10月). 「クロロフェノール化合物を還元的に脱塩素化する嫌気性細菌、Desulfitobacterium dehalogenans gen. nov., sp. nov. の分離と特性解析」International Journal of Systematic Bacteriology . 44 (4): 612–9 . doi : 10.1099/00207713-44-4-612 . PMID 7981092.

[2] ヴィルムール R、ランティエ M、ボーデ R、レピーヌ F (2006 年 9 月)。「デスルフィトバクテリウム属」。FEMS 微生物学のレビュー。30 (5): 706–33 .土井: 10.1111/j.1574-6976.2006.00029.x。PMID 16911041。

[3] Gerritse J, Renard V, Pedro Gomes TM, Lawson PA, Collins MD, Gottschal JC (1996年2月). 「テトラクロロエチレンまたはオルト塩素化フェノールの還元脱塩素化によって増殖できる嫌気性細菌、Desulfitobacterium sp. PCE1株」Archives of Microbiology . 165 (2): 132– 40. doi :10.1007/s002030050308. PMID 8593100. S2CID 29965475.

[4] クルーゼ・T、ファン・デ・パス BA、アテイア A、クラブ K、ハーゲン WR、グッドウィン L、チェイン P、ボーレン S、マフォサ F、シュラー G、デ・ヴォス WM、ファン・デル・オースト J、スミット H、スタムス AJ (2015 年 3 月)。「デスルフィトバクテリウム・デハロゲナンスの有機ハロゲン化物呼吸経路のゲノム、プロテオミクス、および生化学的分析」。細菌学ジャーナル。197 (5): 893–904。土井:10.1128/JB.02370-14。PMC 4325113。PMID 25512312。

[5] Kruse T, Goris T, Maillard J, Woyke T, Lechner U, de Vos W, Smidt H (2017年12月). 「Desulfitobacterium属の比較ゲノミクス」. FEMS Microbiology Ecology . 93 (12). doi : 10.1093/femsec/fix135 . PMID 29040502.