DDB1

DDB1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2B5L、2B5M、2B5N、2HYE、3E0C、3EI1、3EI2、3EI3、3EI4、3I7H、3I7K、3I7L、3I7N、3I7O、3I7P、3I89、3I8C、​​​​​​​​​​ 3I8E、4A08、4A09、4A0A、4A0B、4A0K、4A0L、4A11、4CI1、4CI2、4CI3、4E54、4E5Z、4TZ4、5FQD、5HXB​​​​​​​​​​​​​​​​
識別子
エイリアス	DDB1、DDBA、UV-XAP1、XPCE、XPE、XPE-BF、損傷特異的DNA結合タンパク質1、WHIKERS
外部ID	OMIM : 600045 ; MGI : 1202384 ;ホモロジーン: 1448 ;ジーンカード: DDB1 ; OMA : DDB1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 11番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 11q12.2 始める 61,299,451 bp [ 1 ] 終わり 61,342,596 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 19番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 19 A|19 6.66 cM 始める 10,582,691 bp [ 2 ] 終わり 10,607,183 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右副腎 右副腎皮質 左副腎 左副腎皮質 心室帯 子宮内膜間質細胞 右精巣 神経節隆起 左精巣 右卵管 上位の表現 回腸上皮 網膜の神経層 精母細胞 第四脳室脈絡叢 原腸胚 心室帯 胚葉上層 胚の尾 乳腺 手 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 タンパク質結合 核酸結合 損傷したDNA結合 タンパク質-高分子アダプター活性 カリンファミリータンパク質結合 WD40リピートドメイン結合 タンパク質含有複合体結合 細胞成分 細胞質 核質 Cul4A-RING E3ユビキチンリガーゼ複合体 Cul4B-RING E3ユビキチンリガーゼ複合体 細胞外エクソソーム 核 細胞外空間 Cul4-RING E3ユビキチンリガーゼ複合体 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス 有糸分裂細胞周期の相転移の調節 ヌクレオチド除去修復 ヌクレオチド除去修復、DNA損傷認識 ウイルスによる宿主細胞内のウイルスタンパク質レベルの正の調節 ヒストンH2Aモノユビキチン化 アポトーシス過程の負の調節 Wntシグナル伝達経路 ゲノム全域ヌクレオチド除去修復 共生生物との相互作用に関与する生物学的プロセス ウイルスゲノム複製の正の制御 転写連動ヌクレオチド除去修復 ウイルスプロセス ヌクレオチド除去修復、DNA切断 紫外線によるダメージの除去修復 DNA修復 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス ヌクレオチド除去修復、DNA切断、3'-損傷 ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の安定化 ヌクレオチド除去修復、DNA二重鎖の巻き戻し ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の組み立て ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-損傷 翻訳後タンパク質修飾 プロテアソームによるタンパク質分解プロセス DNA損傷刺激に対する細胞応答 タンパク質のユビキチン化 タンパク質分解プロセスの正の調節 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 概日リズムの調節 糖新生の正の調節 リズミカルなプロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 1642 13194 アンサンブル ENSG00000167986 ENSMUSG00000024740 ユニプロット Q16531 Q3U1J4 RefSeq (mRNA) NM_001923 NM_015735 RefSeq（タンパク質） NP_001914 NP_056550 場所（UCSC） 11章: 61.3 – 61.34 Mb 19章: 10.58 – 10.61 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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DNA損傷結合タンパク質1は、ヒトではDDB1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

遺伝子

この遺伝子は染色体11q12-q13に位置している。^{[ 8 ]}

タンパク質

DDB1遺伝子は、 DNA損傷結合タンパク質の大サブユニットをコードしており、大サブユニットと小サブユニット（DDB2 ）からなるヘテロ二量体である。DDB1は1140個のアミノ酸を含み、質量は127 kDaである。^{[ 8 ]}

関数

その名前が示すように、DDB1は当初、ヌクレオチド除去修復として知られる特定のタイプのDNA修復プロセスに関係していると考えられていました。それ以来、研究者らはDDB1が主にCUL4AおよびCUL4BベースのE3ユビキチンリガーゼ複合体の中核構成要素として機能することを発見しました。DDB1は、DDB1およびCUL4関連因子（DCAF）として知られる数十のタンパク質と相互作用するブリッジまたはアダプタータンパク質として機能します。^{[ 9 ]}これらのDCAFはユビキチンリガーゼの基質であることが多く、DNA修復（DDB2）、DNA複製、クロマチンリモデリング（ Cdt2 ）など、細胞内の数多くの重要なプロセスを制御しています。

相互作用

DDB1は転写開始タンパク質SPT3ホモログ、^{[ 10 ]} GCN5L2、^{[ 11 ]} DDB2、^{[ 12 ] [ 13 ]} CUL4A、^{[ 13 ]} CUL4B ^{[ 13 ]}およびP21と相互作用することが示されている。^{[ 14 ]}

参考文献

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さらに読む

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