DNAβ-グルコシルトランスフェラーゼ

DNAβ-グルコシルトランスフェラーゼ
識別子
EC番号2.4.1.27
CAS番号9030-14-2
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MetaCyc代謝経路
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酵素学において、DNAβ-グルコシルトランスフェラーゼEC 2.4.1.27)は、DNA中のβ-D-グルコシル残基がUDP-グルコースからヒドロキシメチルシトシン残基に転移する化学反応を触媒する酵素です。 これは、DNAα-グルコシルトランスフェラーゼ酵素に類似しています

この酵素はグリコシルトランスフェラーゼファミリー、特にヘキソシルトランスフェラーゼに属します。この酵素クラスの系統名はUDP-グルコース:DNA β-D-グルコシルトランスフェラーゼです。一般的に用いられる他の名称には、 T4-HMC-β-グルコシルトランスフェラーゼT4-β-グルコシルトランスフェラーゼT4ファージβ-グルコシルトランスフェラーゼUDPグルコース-DNA β-グルコシルトランスフェラーゼウリジンジホスホグルコース-デオキシリボ核酸 β-グルコシルトランスフェラーゼなどがあります

構造研究

2007年末現在、このクラスの酵素については20の構造解明されており、PDBアクセッションコードは1BGT1BGU1C3J1IXY1J39、1JEJ1JG6、1JG7、1JIU1JIV1JIX1M5R1NVK1NZD1NZF1QKJ1SXP1SXQ 2BGT、2BGUです

バクテリオファージT4 β-グルコシルトランスフェラーゼ

T4-グルコトランスフェラーゼ
T4ファージBGTとUDPおよび13塩基のDNA二重鎖の三元複合体
識別子
シンボルT4-グルコトランスフェラーゼ
PfamPF09198
インタープロIPR015281
SCOP21jix / SCOPe / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
PDB  IPR015281 PF09198 ( ECOD ; PDBsum )  
アルファフォールド

分子生物学において、バクテリオファージT4 β-グルコシルトランスフェラーゼは、大腸菌ウイルスであるバクテリオファージT4に見られるタンパク質ドメインを指します。このファミリーのメンバーは、バクテリオファージT4によってコードされる酵素であり、ウリジンジホスホグルコースからファージT4 DNAの5-ヒドロキシメチルシトシン塩基へグルコースを転移させることでDNAを修飾します。[ 1 ]

機能

β-グルコシルトランスフェラーゼは酵素であり、より具体的には反転型グリコシルトランスフェラーゼ(GT)です。言い換えれば、ウリジンジホスホグルコース(UDPグルコース)からβ-グリコシド結合を介してグルコースを受容体である修飾DNAに転移します。この酵素の役割は、感染したウイルスDNAを細菌の制限酵素から保護することです。グルコシル化はウイルスDNAが切断されるのを防ぎます。さらに、グルコシル化は転写に影響を与えることでバクテリオファージの遺伝子発現を助ける可能性があります。[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

構造

この構造はαヘリックスβストランドの両方を持っています。[ 2 ]

参考文献

  1. ^ Moréra S, Larivière L, Kurzeck J, Aschke-Sonnenborn U, Freemont PS, Janin J, Rüger W (2001年8月). 「T4ファージβ-グルコシルトランスフェラーゼの高解像度結晶構造:誘導適合と基質および金属結合の影響」. J. Mol. Biol . 311 (3): 569–77 . doi : 10.1006/jmbi.2001.4905 . PMID  11493010
  2. ^ a b Larivière L, Gueguen-Chaignon V, Moréra S (2003). 「UDP-グルコースと複合体を形成したT4ファージβ-グルコシルトランスフェラーゼおよびD100A変異体の結晶構造:グルコース結合および直接置換機構の触媒基盤の同定」J Mol Biol . 330 (5): 1077– 86. doi : 10.1016/s0022-2836(03)00635-1 . PMID 12860129 . 
  3. ^ Moréra S, Imberty A, Aschke-Sonnenborn U, Rüger W, Freemont PS (1999). 「T4ファージβ-グルコシルトランスフェラーゼ:基質結合と提案された触媒機構」J Mol Biol . 292 (3): 717–30 . doi : 10.1006/jmbi.1999.3094 . PMID 10497034 . 
  4. ^ Moréra S, Larivière L, Kurzeck J, Aschke-Sonnenborn U, Freemont PS, Janin J, et al. (2001). 「T4ファージβ-グルコシルトランスフェラーゼの高解像度結晶構造:誘導適合と基質および金属結合の影響」J Mol Biol . 311 (3): 569– 77. doi : 10.1006/jmbi.2001.4905 . PMID 11493010 . 
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