ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| EXOSC10 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2CPR、3SAF、3SAG、3SAH |
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| 識別子 |
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| エイリアス | EXOSC10、PM-Scl、PM/Scl-100、PMSCL、PMSCL2、RRP6、Rrp6p、p2、p3、p4、エクソソーム成分10 |
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| 外部ID | オミム:605960; MGI : 1355322;ホモロジーン:31105;ジーンカード:EXOSC10; OMA :EXOSC10 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 4番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 E2 | 始める | 148,642,886 bp [2] |
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| 終わり | 148,666,858 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 小脳半球
- 小脳の右半球
- 脛骨神経
- 腓骨神経
- アキレス腱
- 左卵巣
- 右卵巣
- 子宮体部
- 子宮頸管
- 右卵管
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| | 上位の表現 | - 性器結節
- 胚の尾
- 精細管
- 上顎突出
- 下顎突出
- 胎児肝造血前駆細胞
- 精母細胞
- 耳板
- 神経管
- 耳小胞
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- エキソリボヌクレアーゼ活性
- タンパク質結合
- 触媒活性
- 3'-5'エキソヌクレアーゼ活性
- 核酸結合
- ヌクレアーゼ活性
- エキソヌクレアーゼ活性
- 加水分解酵素活性
- RNA結合
- 3'-5'-エキソリボヌクレアーゼ活性
- テロメラーゼRNA結合
- 一本鎖RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- エクソソーム(RNase複合体)
- 膜
- 核エクソソーム(RNase複合体)
- 細胞内解剖学的構造
- 核小体
- 核
- 核質
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- RNA処理
- 核ポリアデニル化依存性rRNA分解プロセス
- 核酸ホスホジエステル結合の加水分解
- 異化プロセスをカット
- 核転写されたmRNAの分解プロセス
- 核mRNA監視
- 細胞代謝
- 5.8S rRNAの成熟
- ヒストンmRNA分解プロセス
- X染色体の不活性化による用量補償
- 核酸塩基含有化合物の代謝プロセス
- rRNA処理
- RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ
- 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解
- テロメラーゼを介したテロメア維持の負の制御
- テロメラーゼRNAのカハール体への局在の制御
- トリシストロン性 rRNA 転写産物 (SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA) から 5.8S rRNA の成熟 3' 末端を生成するためのエキソヌクレアーゼによるトリミング
- 核ポリアデニル化依存性snoRNA分解プロセス
- 核ポリアデニル化依存性snRNA分解プロセス
- 核ポリアデニル化依存性tRNA分解プロセス
- 核ポリアデニル化依存性CUT分解プロセス
- 核ポリアデニル化依存性アンチセンス転写産物の分解プロセス
- ポリアデニル化依存性snoRNA 3'末端プロセシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_016699 NM_001355489 NM_001355490 |
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| RefSeq(タンパク質) | | |
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NP_057908 NP_001342418 NP_001342419 |
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| 場所(UCSC) | 1章: 11.07 – 11.1 Mb | 4号線: 148.64 – 148.67 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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エクソソーム成分10(別名EXOSC10)はヒト遺伝子であり、そのタンパク質産物(PM/Scl-100と呼ばれることもある)はエクソソーム複合体の一部であり、特定の自己免疫疾患、特に強筋炎の患者における自己抗原となる。[5]この遺伝子の変異は小頭症を引き起こす可能性がある。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000171824 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000017264 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez Gene: EXOSC10 エキソソーム成分 10」。
- ^ Ulmke PA, et al. 「EXOSC10ハプロ不全はソニックヘッジホッグシグナル伝達の抑制解除によって原発性小頭症を引き起こす」 . Brain . Oxford Academic. doi :10.1093/brain/awaf405.
さらに読む
- Blüthner M, Bautz FA (1992). 「多発性筋炎・強皮症重複症候群関連核小体100kDタンパク質をコードするcDNAのクローニングと特性解析」J. Exp. Med . 176 (4): 973–80 . doi :10.1084/jem.176.4.973. PMC 2119404. PMID 1383382 .
- Ge Q, Frank MB, O'Brien C, Targoff IN (1992). 「PM-Scl自己抗原の100kD抗原タンパク質をコードする相補DNAのクローニング」. J. Clin. Invest . 90 (2): 559–70 . doi :10.1172/JCI115895. PMC 443135. PMID 1644924 .
- Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). 「酵母エクソソームとヒトPM-Sclは3'->5'エクソヌクレアーゼの関連複合体である」. Genes Dev . 13 (16): 2148–58 . doi :10.1101/gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791 .
- Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R, et al. (2001). 「ヒトエクソソームの3つの新規構成要素」J. Biol. Chem . 276 (9): 6177–84 . doi : 10.1074/jbc.M007603200 . hdl : 20.500.11820/a03680a4-cf3a-4827-805c-447483ff4b9f . PMID 11110791.
- Stover C, Endo Y, Takahashi M, et al. (2001). 「補体活性化のレクチン経路のエフェクター成分であるマンナン結合レクチン関連セリンプロテアーゼ-2(MASP-2)のヒト遺伝子は、染色体1p36.2-3上の密接に連鎖した遺伝子クラスターの一部である」。Genes Immun . 2 (3): 119– 27. doi :10.1038/sj.gene.6363745. PMID 11426320. S2CID 23496123.
- Chen CY, Gherzi R, Ong SE, et al. (2002). 「AU結合タンパク質はエクソソームをリクルートし、ARE含有mRNAを分解する」. Cell . 107 (4): 451–64 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00578-5 . PMID 11719186. S2CID 14817671.
- Raijmakers R、Noordman YE、van Venrooij WJ、Pruijn GJ (2002)。 「hCsl4pと他のヒトエキソソームサブユニットとのタンパク質間相互作用」。J.Mol.バイオル。315 (4): 809–18 .土井:10.1006/jmbi.2001.5265。hdl : 2066/261980。PMID 11812149。
- Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ, et al. (2002). 「PM/Scl複合体の新規構成要素であるヒトエクソソームに対する自己抗体」Arthritis Res . 4 (2): 134–8 . doi : 10.1186/ar389 . PMC 83843 . PMID 11879549.
- Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). 「ヒトエクソソーム構成成分間のタンパク質間相互作用は、RNase PH型サブユニットの6員環PNPase様リングへの集合を支持する」J. Mol. Biol . 323 (4): 653– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00947-6. hdl : 2066/186665 . PMID 12419256.
- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). 「ヒト核小体の機能的プロテオーム解析」Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9 . doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2003). 「ヒトPM/Scl-75自己抗原とエクソソームの結合は、新たに同定されたN末端に依存する」J. Biol. Chem . 278 (33): 30698– 704. doi : 10.1074/jbc.M302488200 . hdl : 2066/186428 . PMID 12788944.
- Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). 「哺乳類細胞におけるナンセンス鎖を介したmRNA分解は、脱キャップ、脱アデニル化、およびエキソヌクレアーゼ活性を伴う」Mol. Cell . 12 (3): 675–87 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . PMID 14527413.
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). 「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」Nat. Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
- Raijmakers R, Renz M, Wiemann C, et al. (2004). 「PM-Scl-75は多発性筋炎/強皮症重複症候群患者における主要な自己抗原である」Arthritis Rheum . 50 (2): 565–9 . doi :10.1002/art.20056. PMID 14872500.
- Lehner B, Sanderson CM (2004). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- van Dijk EL, Schilders G, Pruijn GJ (2007). 「ヒト細胞の増殖には機能的な細胞質エクソソームが必要であり、これは様々なmRNA分解経路に関与している」. RNA . 13 (7): 1027–35 . doi :10.1261/rna.575107. PMC 1894934. PMID 17545563 .