エクソソーム構成要素4

EXOSC4
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2NN6
識別子
エイリアス	EXOSC4、RRP41、RRP41A、Rrp41p、SKI6、Ski6p、hRrp41p、p12A、エクソソーム構成要素4
外部ID	オミム：606491; MGI : 1923576;ホモロジーン: 6017;ジーンカード：EXOSC4; OMA :EXOSC4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	8番染色体（ヒト）
終わり	144,080,648 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	15番染色体（マウス）
終わり	76,214,877 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	左精巣; ; 右精巣; ; 横行結腸粘膜; ; 心臓の頂点; ; 右副腎; ; 左副腎; ; 右副腎皮質; ; 左副腎皮質; ; 肝臓の右葉; ; 生殖腺;
	上位の表現
	胚; ; 右腎臓; ; 耳板; ; 卵黄嚢; ; 胚; ; 近位尿細管; ; 耳小胞; ; 内側神経節隆起; ; 顔面運動核; ; 足首関節;
	より多くの参照表現データ
	; ; ; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; エキソリボヌクレアーゼ活性; 3'-5'-エキソリボヌクレアーゼ活性; RNA結合; mRNA 3'-UTR AUリッチ領域結合;
細胞成分	細胞質エクソソーム（RNase複合体）; 核エクソソーム（RNase複合体）; 細胞質; エクソソーム（RNase複合体）; 核小体; 核; 核質; 細胞質; 中間径フィラメント細胞骨格;
生物学的プロセス	ウイルスに対する防御反応; rRNA 3'末端プロセシング; rRNA分解プロセス; ポリアデニル化依存性snoRNA 3'末端プロセシング; U4 snRNA 3'末端プロセシング; 核転写されたmRNAの分解過程、エキソヌクレアーゼ、3'-5'; 細胞増殖の正の調節; 核転写されたmRNAの分解プロセス; DNA脱アミノ化; 5.8S rRNAの成熟; mRNAの安定性の調節; 核mRNA監視; 脱アデニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ分解; ヒストンmRNA分解プロセス; rRNA処理; RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	54512
	109075
	ENSG00000178896
	ENSMUSG00000034259
	Q9NPD3
	Q921I9
	NM_019037
	NM_175399
	NP_061910
	NP_780608
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

エクソソーム構成要素4はEXOSC4としても知られ、エクソソーム複合体の一部であるヒト遺伝子である。^[5]

相互作用

エクソソーム成分4はエキソソーム成分2と相互作用することが示されている。^[6]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000178896 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034259 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「Entrez Gene: EXOSC4 エキソソーム成分 4」。
^ Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). 「ヒトエクソソーム成分間のタンパク質間相互作用は、RNase PH型サブユニットの6員環PNPase様リングへの集合をサポートする」J. Mol. Biol . 323 (4): 653– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00947-6. hdl : 2066/186665 . PMID 12419256.

さらに読む

Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, et al. (1999). 「酵母エクソソームとヒトPM-Sclは3'->5'エクソヌクレアーゼの関連複合体である」. Genes Dev . 13 (16): 2148–58 . doi :10.1101/gad.13.16.2148. PMC 316947. PMID 10465791 .
Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R, et al. (2001). 「ヒトエクソソームの3つの新規構成要素」J. Biol. Chem . 276 (9): 6177–84 . doi : 10.1074/jbc.M007603200 . hdl : 2066/186951 . PMID 11110791.
Chen CY, Gherzi R, Ong SE, et al. (2002). 「AU結合タンパク質はエクソソームをリクルートし、ARE含有mRNAを分解する」. Cell . 107 (4): 451–64 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00578-5 . PMID 11719186. S2CID 14817671.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. (2002). 「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」. Curr. Biol . 12 (1): 1– 11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Raijmakers R、Noordman YE、van Venroij WJ、Pruijn GJ (2002)。「hCsl4pと他のヒトエキソソームサブユニットとのタンパク質間相互作用」。Ｊ．Ｍｏｌ．バイオル。315 (4): 809–18 .土井:10.1006/jmbi.2001.5265。hdl : 2066/261980。PMID 11812149。
Brouwer R, Vree Egberts WT, Hengstman GJ, et al. (2002). 「PM/Scl複合体の新規構成要素であるヒトエクソソームに対する自己抗体」Arthritis Res . 4 (2): 134–8 . doi : 10.1186/ar389 . PMC 83843 . PMID 11879549.
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). 「ヒトエクソソーム構成成分間のタンパク質間相互作用は、RNase PH型サブユニットの6員環PNPase様リングへの集合を支持する」J. Mol. Biol . 323 (4): 653– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00947-6. hdl : 2066/186665 . PMID 12419256.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2003). 「ヒトPM/Scl-75自己抗原とエクソソームの結合は、新たに同定されたN末端に依存する」J. Biol. Chem . 278 (33): 30698– 704. doi : 10.1074/jbc.M302488200 . hdl : 2066/186428 . PMID 12788944.
Lejeune F, Li X, Maquat LE (2003). 「哺乳類細胞におけるナンセンス鎖を介したmRNA分解は、脱キャップ、脱アデニル化、およびエキソヌクレアーゼ活性を伴う」Mol. Cell . 12 (3): 675–87 . doi : 10.1016/S1097-2765(03)00349-6 . PMID 14527413.
太田剛志、鈴木雄志、西川剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y, et al. (2006). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mamm. Genome . 16 (12): 942–54 . doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
van Dijk EL, Schilders G, Pruijn GJ (2007). 「ヒト細胞の増殖には機能的な細胞質エクソソームが必要であり、これは様々なmRNA分解経路に関与している」. RNA . 13 (7): 1027–35 . doi :10.1261/rna.575107. PMC 1894934. PMID 17545563 .

この記事はヒト8番染色体上の遺伝子に関するものです。この記事を拡張することで、Wikipedia に貢献できます。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000178896 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000034259 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[entrez-5] 「Entrez Gene: EXOSC4 エキソソーム成分 4」。

[pmid12419256-6] Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002). 「ヒトエクソソーム成分間のタンパク質間相互作用は、RNase PH型サブユニットの6員環PNPase様リングへの集合をサポートする」J. Mol. Biol . 323 (4): 653– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00947-6. hdl : 2066/186665 . PMID 12419256.