エクソソーム構成要素6

EXOSC6
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2NN6
識別子
エイリアス	EXOSC6、EAP4、MTR3、Mtr3p、hMtr3p、p11、エクソソーム構成要素6
外部ID	オミム：606490; MGI : 1919794;ホモロジーン: 12469;ジーンカード：EXOSC6; OMA :EXOSC6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 16番染色体（ヒト）[1] バンド 16q22.1 始める 70,246,778 bp [1] 終わり 70,251,940 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[2] バンド 8|8 E1 始める 111,782,971 bp [2] 終わり 111,784,296 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 口腔粘膜細胞 内皮細胞 ブロードマン野23 中心後回 ブロードマン領域46 一次視覚野 上前頭回 中側頭回 アキレス腱 嗅内皮質 上位の表現 胚 胚 胚盤胞 桑実胚 血管系 臓器の血管系 側頭葉 扁桃体 脊髄 脳幹 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 エキソリボヌクレアーゼ活性 RNA結合 細胞成分 細胞質 細胞質 エクソソーム（RNase複合体） 核エクソソーム（RNase複合体） 細胞質エクソソーム（RNase複合体） 核小体 核 核質 生物学的プロセス mRNAの安定性の調節 核転写されたmRNAの分解過程、エキソヌクレアーゼ、3'-5' rRNA 3'末端プロセシング rRNA分解プロセス DNA脱アミノ化 核mRNA監視 脱アデニル化mRNAのエキソヌクレアーゼ分解 U4 snRNA 3'末端プロセシング ポリアデニル化依存性snoRNA 3'末端プロセシング rRNA処理 アイソタイプスイッチの正の制御 アイソタイプスイッチング RNAホスホジエステル結合加水分解、エキソヌクレアーゼ 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 118460 72544 アンサンブル ENSG00000223496 ENSMUSG00000109941 ユニプロット Q5RKV6 Q8BTW3 RefSeq (mRNA) NM_058219 NM_028274 RefSeq（タンパク質） NP_478126 NP_082550 場所（UCSC） 16章: 70.25 – 70.25 Mb 8番目の文字: 111.78 – 111.78 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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エクソソーム複合体エキソヌクレアーゼMTR3は、ヒトではEXOSC6遺伝子によってコードされている酵素である。^{[5] [6] [7]}

この遺伝子産物は、mRNAの分解を媒介するエクソソーム複合体と呼ばれる多サブユニット粒子のサブユニットの1つを構成します。ヒトエクソソームの構成は、酵母のエクソソームと類似しています。このタンパク質は酵母Mtr3タンパク質と相同性があります。その正確な機能は不明ですが、無細胞RNA分解システムを用いて、エクソソームはAUリッチエレメント（ARE）を含む不安定なmRNAの急速な分解に必要であり、ポリ(A)短縮には必要ではないことが示されている。エクソソームはAREを含むmRNAを単独では認識せず、エクソソームと相互作用してエクソソームを不安定なmRNAにリクルートし、それによって急速な分解を促進するARE結合タンパク質を必要とします。^[7]

相互作用

エクソソーム成分6は、エクソソーム成分7、^{[6] 、}エクソソーム成分8 ^[6]、エクソソーム成分1 ^[6]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000223496 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000109941 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Chen CY, Gherzi R, Ong SE, Chan EL, Raijmakers R, Pruijn GJ, Stoecklin G, Moroni C, Mann M, Karin M (2001年11月). 「AU結合タンパク質はエクソソームをリクルートし、ARE含有mRNAを分解する」. Cell . 107 (4): 451–64 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00578-5 . PMID  11719186. S2CID  14817671.
6. Raijmakers R, Egberts WV, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2002年11月). 「ヒトエクソソーム成分間のタンパク質間相互作用は、RNase PH型サブユニットの6員環PNPase様リングへの集合をサポートする」J Mol Biol . 323 (4): 653– 63. doi :10.1016/S0022-2836(02)00947-6. hdl : 2066/186665 . PMID  12419256.
7. 「Entrez Gene: EXOSC6 エキソソーム成分 6」。

さらに読む

• Lehner B, Sanderson CM (2004). 「ヒトmRNA分解におけるタンパク質相互作用フレームワーク」Genome Res . 14 (7): 1315–23 . doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147.  PMID 15231747  .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• van Hoof A, Parker R (2002). 「メッセンジャーRNAの分解：終わりから始まる」. Curr. Biol . 12 (8): R285–7. Bibcode :2002CBio...12.R285V. doi : 10.1016/S0960-9822(02)00802-3 . PMID  11967169. S2CID  17142692.
• Raijmakers R、Noordman YE、van Venrooij WJ、Pruijn GJ (2002)。 「hCsl4pと他のヒトエキソソームサブユニットとのタンパク質間相互作用」。Ｊ．Ｍｏｌ．バイオル。315 (4): 809–18 .土井:10.1006/jmbi.2001.5265。hdl : 2066/261980。PMID  11812149。
• Brouwer R, Allmang C, Raijmakers R, et al. (2001). 「ヒトエクソソームの3つの新規構成要素」J. Biol. Chem . 276 (9): 6177–84 . doi : 10.1074/jbc.M007603200 . hdl : 2066/186951 . PMID  11110791.