エンシファー・ヌミディクス

エンシファー・ヌミディクス
Vigna unguiculata の根に付着した根粒菌の根粒
科学的分類この分類を編集する
ドメイン: 細菌
王国: シュードモナダティ
門: シュードモナドタ
クラス: アルファプロテオバクテリア
注文: ヒポミクロビアレス
家族: 根粒菌科
属: エンシファー
種:
E. ヌミディカス
二名法名
エンシファー・ヌミディクス
メラベットら 2010
タイプ株
ORS 1444、ORS1410、ORS 1407、LMG 24690、CIP 109850、PN14、LBi2

Ensifer numidicusはマメの窒素固定共生菌です。 [ 1 ]グラム陰性、好気性、非胞子形成、桿菌で、根粒菌科に。 [ 2 ] 2010年に初めて記載されました。 [ 1 ]その後、より多くの生物型が分離・記載され、 [ 3 ] ORS 1407が代表的な生物と考えられています。 [ 4 ]ほとんどの例はチュニジアの乾燥地域と亜乾燥地域で発見されています。 [ 5 ]

宿主植物

バイオバーズは、 Medicago Sativa (栽培アルファルファ) [ 6 ]ロータス クレティカス[ 3 ]シリアン メスキート( Prosopis farcta )[ 7 ] 、レンズキュリナリス メディクス ssp(レンズ豆) [ 3 ] [ 8 ]、およびCicerを含む、さまざまな共生適格植物種で根粒形成を誘導することが示されています。 arietinum (ひよこ豆) [ 3 ]Argyrolobium uniflorum[ 1 ]

関連するバイオバー

アルギロロビウム・ユニフロラム: ORS 1407 [ 1 ]

栽培アルファルファMedicago sativa :ORS 1407 [ 1 ]

ロータス クレティカス: PT26 [ 7 ] ORS 1410 [ 3 ]

栽培レンズ豆(Lens culinaris):ORS 1444 [ 3 ]

Cicer arietinum (ひよこ豆):LBi 2 [ 3 ]

シリアメスキート( Prosopis farcta ): PN14 [ 7 ]

栽培品種間の既知の関係

ヌミディカス

この系統発生は16SリボソームRNAの制約解析に基づいている[ 1 ]

ゲノム

16s RNA解析により、Ensifer numidicusはEnsifer medicaeおよびEnsifer garamanticusと近縁であることが判明している。[ 3 ]近縁種間の類似遺伝子は、近縁種間での遺伝子水平伝播のレベルが高いことを示唆している。[ 3 ]実験室での接種により、Ensifer numidicusは少なくともいくつかの状況下で宿主植物と不定根粒形成を行うことが示されている。 [ 9 ]

成長条件

E. numidicus は酵母マンニトール培地で 28 ℃、上限 40 ℃ で生育することが確認されています。[ 1 ]実験室で培養された菌株は、ズルシトール、D-リキソース、1-O-メチル α-D-グルコピラノシド、3-O-メチル-D-グルコピラノース、D-グルコン酸、L-ヒスチジン、コハク酸、フマル酸エタノールアミン、DL-b-ヒドロキシ酪酸、L-アスパラギン酸、L-アラニン、プロピオン酸など、少なくとも 13 種類の基質を代謝することが確認されています。[ 1 ] 4% を超える塩分濃度に対して感受性があることがわかっています。[ 3 ]他の Ensifer 種との類似性のため、生育条件だけで説明することはできず、遺伝子成分によって区別する必要があります。[ 3 ]

参考文献

  1. ^ a b c d e f g hメラベット、C.;マルテンス、M.マハディ、M.ザキア、F.サイ、A。ル・ルー、C.ドメルグ、O.コープマン、R.ベッキ、A.マース、M.ウィレムス、A. (2010 年 3 月)。 「Lotus arabicus (セネガル)、Lotus creticus、 Argyrolobium uniflorum、およびMedicago sativa (チュニジア)から分離された根粒の多座配列分析、およびEnsifer numidicus sp. nov. およびEnsifer garamanticus sp. nov.の説明。」系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル60 (Pt 3): 664–674 .土井: 10.1099/ijs.0.012088-0hdl : 1854/LU-936490 . ISSN  1466-5026 . PMID  19656922 .
  2. ^ Podstawka, Adam. Ensifer numidicus | Type strain | LMG 24690, CIP 109850, ORS 1407 | BacDiveID:133535」 . bacdive.dsmz.de . 2021年9月2日閲覧
  3. ^ a b c d e f g h ijkサミ、ダウイ;モフタル、レジリ。ピーター、マーガート。モハメド、火星(2016)。Rhizobium Leguminosarum symbiovar trifoliiEnsifer numidicus、およびMesorhizobium amorphae symbiovar ciceri (またはMesorhizobium Loti ) は、Lens culinaris Medik の新しい内部共生細菌です。 」 FEMS 微生物学、生態学92 (8): 未定義。ドイ: 10.1093/femsec/fiw118PMID 27267929 
  4. ^パーカー、チャールズ・トーマス;テイラー、ドロテア;ギャリティ、ジョージ・M. (2010). パーカー、チャールズ・トーマス;ギャリティ、ジョージ・M (編). 「ORS 1407株(=LMG 24690 =CIP 109850):微生物特性とゲノム情報」 . doi : 10.1601/ex.17831 .{{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=ヘルプ)が必要です
  5. ^ベッサドク、クロウド;ナバロ・トーレ、サルバドーラ;フテリッヒ、アミラ。カビデス、ミゲル・アンヘル。パフエロ、エロイーザ。ロドリゲス=ジョレンテ、イグナシオ・デイビッド。火星、モハメド(2021-05-01)。「Anthyllis henoniana と窒素固定共生を形成できるチュニジアの乾燥土壌から分離された根粒菌の多様性」乾燥環境ジャーナル188 104467。Bibcode : 2021JArEn.188j4467B土井10.1016/j.jaridenv.2021.104467ISSN 0140-1963S2CID 233567533  
  6. ^メラベット、チャヒネス;マルテンス、ミエット。マハディ、M。ザキア、フレデリック。サイ、A。ル・ルー、C.ドメルグ、O.コープマン、レナータ。ベッキ、A.マース、M.ウィレムズ、アン (2010)。 「 Lotus arabicus (セネガル)、Lotus creticusArgyrolobium uniflorum、およびMedicago sativa (チュニジア)から分離された根粒の多座配列分析、およびEnsifer numidicus sp nov およびEnsifer garamanticus sp novの説明。 」系統的および進化的微生物学の国際ジャーナル60 (3): 664–674 .土井: 10.1099/ijs.0.012088-0hdl : 1854/LU-936490ISSN 1466-5026 . PMID 19656922 .  
  7. ^ a b c Fterich, A.; Mahdhi, M.; Caviedes, MA; Pajuelo, E.; Rivas, R.; Rodriguez-Llorente, ID; Mars, M. (2011-06-01). 「チュニジアの乾燥地帯で生育するProsopis farctaに関連する根粒形成細菌の特性Archives of Microbiology . 193 (6): 385– 397. doi : 10.1007/s00203-011-0683- z . ISSN 1432-072X . PMID 21359955. S2CID 24398589 .   
  8. ^ 「チュニジアの乾燥土壌におけるアカシア・トルティリス亜種ラディアナの根粒から分離された細菌の分類学的および共生的多様性」 ResearchGate2021年9月2日閲覧
  9. ^コルデロ、アイリーン;ルイス・ディエス、ベアトリス。コバ・デ・ラ・ペーニャ、テオドーロ。ルイス・バラガー。ルーカス、M. メルセデス。アナ、リンコン。プエヨ、ホセ J. (2016-05-01)。 「根粒菌の多様性、共生効果、 Vachellia macracanthaの根粒の構造土壌生物学と生化学96 : 39–54 .土井: 10.1016/j.soilbio.2016.01.011ISSN 0038-0717