ラプゲフ3

ヒトのタンパク質コード遺伝子
ラプゲフ3
識別子
エイリアスRAPGEF3、CAMP-GEFI、EPAC、EPAC1、HSU79275、bcm910、Rapグアニンヌクレオチド交換因子3
外部IDオミム:606057; MGI : 2441741;ホモロジーン: 21231;ジーンカード:RAPGEF3; OMA :RAPGEF3 - オルソログ
オルソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

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NM_001098532
NM_006105

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NM_001177811
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RefSeq(タンパク質)

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NP_006096

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NP_001171282
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NP_001344559

場所(UCSC)12章: 47.73 – 47.77 Mb15章: 97.74 – 97.77 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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RAPGEF3は、 cAMP1によって直接活性化される交換因子(EPAC1)またはcAMP調節グアニンヌクレオチド交換因子I (cAMP-GEFI)としても知られ、ヒトではRAPGEF3遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5] [6] [7]

名前が示すように、EPAC タンパク質 (EPAC1 およびEPAC2 ) はcAMPの細胞内センサー ファミリーでありRAS様小型GTPaseのRapサブファミリーのヌクレオチド交換因子として機能します

歴史と発見

1957年にプロトタイプのセカンドメッセンジャーcAMPが画期的な発見をされて以来、cAMPの細胞内機能を媒介する真核生物のcAMP受容体の3つのファミリーが特定されています。タンパク質キナーゼA(PKA)またはcAMP依存性タンパク質キナーゼ環状ヌクレオチド調節イオンチャネル(CNGHCN)は、それぞれ1968年と1985年に最初に発表されましたが、EPAC遺伝子は2つの研究グループによって独立して1998年に発見されました。Kawasakiらは、ディファレンシャルディスプレイプロトコルとcAMP結合モチーフを持つクローンのスクリーニングを使用して、脳に豊富に存在する新規遺伝子としてcAMP-GEFIとcAMP-GEFIIを特定しました。[7] De Rooijらは、RasとRap1の両方のGEFとcAMP結合部位に配列相同性を持つタンパク質のデータベース検索を実行し、 RAPGEF3遺伝子の特定とその後のクローニングを行いました[6] EPACファミリーcAMPセンサーの発見は、cAMPシグナル伝達の複雑さと、その読み取り方法がこれまで考えられていたよりもはるかに複雑であることを示唆しています。これは、cAMPの生理学的効果はEPAC依存性経路とPKA依存性経路の統合を必要とし、これらの経路は特定の細胞機能を制御する際に、独立して作用したり、相乗的に収束したり、あるいは互いに拮抗したりする可能性があるためです。[8] [9] [10]

遺伝子

ヒトRAPGEF3遺伝子は、第12染色体(12q13.11: 47,734,367-47,771,041)に存在する。 [11]予測される多くの転写バリアントのうち、NCBIデータベースで検証されている3つは、転写バリアント1(6,239 bp)、2(5,773 bp)、3(6,003 bp)である。バリアント1はEPAC1a(923アミノ酸)をコードし、バリアント2と3はどちらもEPAC1b(881アミノ酸)をコードしている。[5]

タンパク質ファミリー

哺乳類では、EPACタンパク質ファミリーにはEPAC1(本タンパク質)とEPAC2RAPGEF4)の2つのメンバーが含まれます。これらはさらに、C3G(RAPGEF1)、PDZ-GEF1(RAPGEF2)、PDZ-GEF2 (RAPGEF6)、 Repac(RAPGEF5)、CalDAG-GEF1(ARHGEF1 、CalDAG-GEF3(ARHGEF3、PLCε1(PLCE1)、およびRasGEF1A、B、Cを含む、より広範なRap /Ras特異的GEFタンパク質ファミリーに属します。

タンパク質の構造と活性化のメカニズム

EPACタンパク質は、いわゆる中央の「スイッチボード」領域によって連結された2つの構造ローブ/半分から構成されています。[12] N末端調節ローブはcAMP結合を担い、C末端ローブはヌクレオチド交換因子活性を有しています。cAMPが存在しない基底状態では、EPACは自己阻害構造を維持しており、N末端ローブはC末端ローブの上に折り畳まれ、活性部位をブロックしています。[13] [14] cAMPがEPACに結合すると、調節ローブと触媒ローブの間にヒンジ運動が誘導されます。その結果、調節ローブは触媒ローブから離れ、活性部位が解放されます。[15] [16]さらに、cAMPは調節ローブ内の構造変化を促し、脂質結合モチーフの露出を促します。これにより、EPAC1が適切に細胞膜へ標的化されるようになります。[17] [18] タンパク質動態におけるエントロピー的に好ましい変化もcAMPを介したEPAC活性化に関与していることが示唆されている。[19] [20]

組織分布と細胞局在

ヒトおよびマウスにおけるEPAC1 mRNAの発現は、かなり普遍的です。Human Protein Atlasの資料によると、EPAC1 mRNAはすべての正常ヒト組織で検出されます。さらに、分析した80の組織サンプルの50%以上で、中程度から高レベルの対応するタンパク質が測定されました。[21]マウスでは、腎臓、卵巣、骨格筋、甲状腺、および脳の特定の領域で高レベルのEPAC1 mRNAが検出されます。[7]

EPAC1は、細胞機能が空間的および時間的に厳密に制御されている多機能タンパク質です。EPAC1は、細胞周期のさまざまな段階でさまざまな細胞内部位に局在します。[22] EPAC1は、さまざまな細胞パートナーとの相互作用を通じて、細胞膜[18] [23] [24] [25]、核膜[26 ] [27 ] [28 ] 、細胞骨格[29] [30 ] [31]で個別のシグナルソームを形成することが示されており、EPAC1はそこで多数の細胞機能を制御しています。

臨床的関連性

EPAC1の遺伝子改変マウスモデルを用いた研究は、生理学的条件下および病態生理学的条件下におけるEPAC1の生体内機能を理解するための貴重な知見をもたらしました。全体として、EPAC1またはEPAC1とEPAC2の両方を欠損したマウスは、大きな表現型異常を示さず、比較的正常な状態を示します。これらの観察結果は、cAMPが主要なストレス応答シグナルであるものの、生存には必須ではないという事実と一致しています。EPACをベースとした治療薬の標的毒性は低いと考えられるため、EPAC1は治療介入の魅力的な標的となります。現在までに、マウスにおけるEPAC1の遺伝学的および薬理学的解析により、EPAC1が心臓ストレスと心不全[32] [33] レプチン抵抗性とエネルギー恒常性[34] [35] [36] 慢性疼痛[37] [38] 感染[39] [40] 癌転移、 [41]代謝[ 42 ] 二次止血[ 43 ]において重要な役割を果たすことが明らかになっています興味深いことに、EPAC1欠損マウスは血液凝固時間が延長し、血小板の数が少なく、若く、大きく、アゴニスト応答性が高くなっています。EPAC1は成熟した血小板には存在しませんが、正常な巨核球生成と、それに続く主要な血小板機能に関与するいくつかの重要なタンパク質の発現に必要です。 [43]

薬理学的作動薬と拮抗薬

EPACタンパク質を介したcAMPシグナル伝達の機能をより深く理解し、EPACタンパク質を標的とした治療の可能性を探るため、EPACタンパク質に特異的な低分子モジュレーターの発見と開発に大きな関心が寄せられています。EPACとPKAのcAMP結合部位の主要な違いを標的とした構造ベースの設計により、EPAC1を選択的に活性化できるcAMP類似体、8-pCPT-2'-O-Me-cAMPが同定されました。[44] [45]さらなる改変により、より膜透過性が高く、代謝的に安定したEPAC特異的アゴニストの開発が可能になりました[46] [47] [48] [49]

ハイスループットスクリーニングの結果、いくつかの新規EPAC特異的阻害剤(ESI)が発見されました。[50] [51] [52]そのうち2つのESIはEPAC2選択的拮抗薬として作用し、EPAC1に対する活性は無視できます。[51] EPAC2よりもEPAC1に対して中程度の選択性を持つ別のESI、CE3F4も報告されています。[53] EPAC特異的拮抗薬の発見は、EPAC活性の薬理学的操作を可能にする研究上のマイルストーンを表しています。特に、優れた活性と最小限の生体内毒性を持つEPAC拮抗薬の1つであるESI-09は、EPACタンパク質の生理学的機能を調べ、動物疾患モデルでEPACを標的とした治療の可能性を試験するための有用な薬理学的ツールであることが示されている。[39] [41] [54]

注記

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さらに読む

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