DLX6-AS1

EVF-2
EVF-2
	Evf2 (選択的スプライシングされた Evf1) RNA の保存された二次構造。
識別子
シンボル	EVF-2
Rfam	RF01887
その他のデータ
RNA型	RNA遺伝子
ドメイン	哺乳類
PDB構造	PDBe

非コードRNA

RNAファミリー

DLX6アンチセンスRNA 1（DLX6-AS1）（Evf-1（Embryonic ventral forebrain-1））は、発生段階に応じて制御される長鎖非コードRNAです。ラットでは、発達中の前脳の脳室下帯のニューロンで発現します。その発現は、 Shh（ソニックヘッジホッグ）遺伝子ファミリーおよび DLX遺伝子ファミリーの発現と関連しており、これらは前脳腹側部および頭蓋顔面の発達に重要です。^[1] DLX6-AS1の選択的スプライス型であるDLX6-AS2は、Dlx-2タンパク質と安定した複合体を形成します。この複合体は、Dlx-5およびDlx-6の転写を活性化します。^[2]

DLX6-AS2は、発達期にGABA作動性介在ニューロンを産生する脳領域における遺伝子発現を制御する。 ^{[3]シグナル伝達経路に関与し、DLX}ホメオドメインタンパク質と連携して神経幹細胞内の DLX5/6エンハンサーエレメントの有効性を高める。介在ニューロンは、成人脳の海馬に存在し、学習と記憶を司る領域である。^[4]

GABA作動性介在ニューロンは、自閉症^[5]、統合失調症^[6]、てんかん^[7]など多くの精神疾患に関与していることが示唆されている。DLX6 -AS2はこれらのニューロンの発達を制御するため、これらの疾患の原因に関する研究の対象となっている。^[4]

DLX6-AS2は器官形成に関与することが知られている最初の長鎖非コードRNAである。^[8]

参照

参考文献

^ Kohtz JD, Fishell G (2004年7月). 「マウスDlx6遺伝子の上流で転写される新規非コードRNA、EVF-1の発生制御」. Gene Expr. Patterns . 4 (4): 407– 412. doi :10.1016/j.modgep.2004.01.007. PMID 15183307.
^ Feng J, Bi C, Clark BS, Mady R, Shah P, Kohtz JD (2006年6月). 「Evf-2非コードRNAはDlx-5/6超保存領域から転写され、Dlx-2転写コアクチベーターとして機能する」. Genes Dev . 20 (11): 1470– 1484. doi :10.1101/gad.1416106. PMC 1475760. PMID 16705037 .
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さらに読む

Kohtz JD, Baker DP, Corte G, Fishell G (1998年12月). 「哺乳類の終脳における領域化は、ソニック・ヘッジホッグに対する反応性の変化によって媒介される」 . Development . 125 (24): 5079– 5089. doi :10.1242/dev.125.24.5079. PMID 9811591. 2010年7月26日閲覧.
Ingham PW, McMahon AP (2001年12月). 「動物発生におけるヘッジホッグシグナル伝達：パラダイムと原理」. Genes Dev . 15 (23): 3059– 3087. doi : 10.1101/gad.938601 . PMID 11731473.
Licastro D, Gennarino VA, Petrera F, Sanges R, Banfi S, Stupka E (2010). 「超保存領域におけるエンハンサー、コーディング、非コーディング転写機能の混交性」. BMC Genomics . 11 151. doi : 10.1186/1471-2164-11-151 . PMC 2847969. PMID 20202189 .
Erdmann VA, Barciszewska MZ, Hochberg A, de Groot N, Barciszewski J (2001年6月). 「制御性RNA」. Cell. Mol. Life Sci . 58 (7): 960– 977. doi :10.1007/PL00000913. PMC 11337372. PMID 11497242. S2CID 19491637 .

外部リンク

Rfamにおける胎児腹側前脳RNA 1保存領域1のページ

[pmid15183307-1] Kohtz JD, Fishell G (2004年7月). 「マウスDlx6遺伝子の上流で転写される新規非コードRNA、EVF-1の発生制御」. Gene Expr. Patterns . 4 (4): 407– 412. doi :10.1016/j.modgep.2004.01.007. PMID 15183307.

[pmid16705037-2] Feng J, Bi C, Clark BS, Mady R, Shah P, Kohtz JD (2006年6月). 「Evf-2非コードRNAはDlx-5/6超保存領域から転写され、Dlx-2転写コアクチベーターとして機能する」. Genes Dev . 20 (11): 1470– 1484. doi :10.1101/gad.1416106. PMC 1475760. PMID 16705037 .

[3] Sciencedaily (2009年9月1日). 「Evf2と呼ばれる非コードRNAは遺伝子制御に重要」 . 2010年7月26日閲覧。

[Bon09-4] Bond AM, Vangompel MJ, Sametsky EA, et al. (2009年8月). 「胎児脳のncRNAによるバランスのとれた遺伝子制御は、成体海馬GABA回路に重要である」. Nat. Neurosci . 12 (8): 1020– 1027. doi :10.1038/nn.2371. PMC 3203213. PMID 19620975 .

[5] Dani VS, Chang Q, Maffei A, Turrigiano GG, Jaenisch R, Nelson SB (2005年8月). 「レット症候群マウスモデルにおける興奮と抑制のバランスの変化による皮質活動の低下」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (35): 12560– 12565. Bibcode :2005PNAS..10212560D. doi : 10.1073/pnas.0506071102 . PMC 1194957. PMID 16116096 .

[6] Lewis DA, Hashimoto T, Volk DW (2005年4月). 「皮質抑制性ニューロンと統合失調症」. Nat. Rev. Neurosci . 6 (4): 312– 324. doi :10.1038/nrn1648. PMID 15803162. S2CID 3335493.

[7] Di Cristo G (2007年7月). 「皮質GABA作動性回路の発達と神経発達障害への影響」. Clin. Genet . 72 (1): 1– 8. doi :10.1111/j.1399-0004.2007.00822.x. PMID 17594392. S2CID 22162349.^{[リンク切れ]}

[8] Shamovsky I, Nudler E (2006年10月). 「大型非コードRNAによる遺伝子制御」. Sci. STKE . 2006 (355): pe40. doi :10.1126/stke.3552006pe40. PMID 17018852. S2CID 41151259.