GABARAP
ホモ・サピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
GABARAP
利用可能な構造
PDBオーソログ検索：PDBe RCSB
識別子
別名GABARAP、ATG8A、GABARAP-a、MM46、GABA A型受容体関連タンパク質
外部IDOMIM : 605125; MGI : 1861742; HomoloGene : 134119; GeneCards : GABARAP; OMA :GABARAP - オーソログ
オーソログ
種ヒトマウス
Entrez

11337

56486

Ensembl

ENSG00000170296

ENSMUSG00000018567

UniProt

O95166

Q9DCD6

RefSeq (mRNA)

NM_007278

NM_019749

RefSeq (タンパク質)

NP_009209

NP_062723

場所（UCSC）17番染色体：7.24～7.24 Mb11番染色体：69.88～69.89 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
ヒトの表示／編集マウスの表示／編集

γ-アミノ酪酸受容体関連タンパク質は、ヒトではGABARAP遺伝子によってコードされるタンパク質です。[5]

機能

γ-アミノ酪酸A受容体[GABA(A)受容体]は、抑制性神経伝達を媒介するリガンド依存性塩素イオンチャネルです。この遺伝子はGABA(A)受容体関連タンパク質をコードしており、このタンパク質はN末端で高い正電荷を帯びており、微小管関連タンパク質1Aおよび1Bの軽鎖3と配列相同性を共有しています。このタンパク質は、細胞骨格との相互作用を媒介することにより、神経伝達物質受容体をクラスター化します。[6]

さらに、GABARAPはオートファゴソームを介したオートファジーにおいて重要な機能を有しています。オートファゴソームの形成と細胞質カーゴの二重膜小胞への隔離に不可欠であり、リソソームとの融合後に分解につながります。[7]さらに、GABARAPは、特定のカーゴに結合してリクルートする、いわゆるオートファジー受容体（例：p62、NBr1）に結合するため、選択的オートファジーを媒介することができます。

相互作用

GABARAPは、 TFRC [8]、ULK1 [9] [10]、GABRG2 [5] [ 11] [12]と相互作用することが示されています。実験観察と一致するGABARAPとGABRG2の結合構造が計算によって導出されています。[13]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000170296 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000018567 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス」、米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス」、米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ ab Wang H, Bedford FK, Brandon NJ, Moss SJ, Olsen RW (1999年1月). 「GABA(A)受容体関連タンパク質はGABA(A)受容体と細胞骨格を結びつける」Nature 397 ( 6714 ): 69– 72. doi :10.1038/16264. PMID  9892355. S2CID  204990449.
  6. ^ 「Entrez遺伝子：GABARAP GABA(A)受容体関連タンパク質」
  7. ^ Szalai P, Hagen LK, Sætre F, Luhr M, Sponheim M, Øverbye A, Mills IG, Seglen PO, Engedal N (2015). 「オートファジーによる細胞質内貨物のバルク隔離はLC3とは独立しているが、GABARAPを必要とする」Experimental Cell Research . 333 (1): 21– 38. doi :10.1016/j.yexcr.2015.02.003. PMID  25684710
  8. ^ Green F, O'Hare T, Blackwell A, Enns CA (2002年5月). 「ヒトトランスフェリン受容体とGABARAPの関連性」(PDF) . FEBS Letters . 518 ( 1–3 ): 101–106 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)02655-8 . PMID  11997026. S2CID  29391940.
  9. ^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」. Molecular Systems Biology . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948 . PMID  17353931. 
  10. ^ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (2000年12月). 「脳におけるUnc-51様キナーゼと微小管関連タンパク質軽鎖3関連タンパク質の相互作用：軸索伸長における小胞輸送の役割の可能性」. Brain Research. Molecular Brain Research . 85 ( 1–2 ): 1–12 . doi :10.1016/S0169-328X(00)00218-7. PMID  11146101
  11. ^ Nymann-Andersen J, Wang H, Chen L, Kittler JT, Moss SJ, Olsen RW (2002年3月). 「GABA(A)受容体関連タンパク質（GABARAP）とGABA(A)受容体間のサブユニット特異性と相互作用ドメイン」. Journal of Neurochemistry . 80 (5): 815–823 . doi :10.1046/j.0022-3042.2002.00762.x. PMID  11948245. S2CID  38049055
  12. ^ Coyle JE, Qamar S, Rajashankar KR, Nikolov DB (2002年1月). 「2つのコンフォメーションにおけるGABARAPの構造：GABA(A)受容体の局在とチューブリン結合への影響」. Neuron . 33 (1): 63–74 . doi : 10.1016/S0896-6273(01)00558-X . PMID  11779480. S2CID  14487823
  13. ^ Irwin BW, Vukovic S, Payne MC, ElGamacy M, Chau PL (2018年12月). 「GABA A型受容体とGABARAPの相互作用の予測」. Proteins . 86 (12): 1251–1264 . doi :10.1002/prot.25589. PMC 6492159. PMID 30218455.   

参考文献

  • 兼松 剛志、平田 正之 (2002年4月). 「PRIP-1を中心とするタンパク質間相互作用の解析」.日本薬理学雑誌. Folia Pharmacologica Japonica . 119 (4): 241–6 . doi : 10.1254/fpj.119.241 . PMID  11979730.
  • Paz Y, Elazar Z, Fass D (2000年8月). 「膜輸送調節因子であり、オートファゴサイトーシス因子Aut7pの哺乳類相同遺伝子であるGATE-16の構造」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (33): 25445– 25450. doi : 10.1074/jbc.C000307200 . PMID  10856287.
  • Wang H, Olsen RW (2000年8月). 「GABA(A)受容体関連タンパク質（GABARAP）の微小管および微小フィラメントへの結合は、GABARAP-GABA(A)受容体相互作用における細胞骨格の関与を示唆する」Journal of Neurochemistry . 75 (2): 644– 655. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750644.x . PMID  10899939. S2CID  86634862
  • Kneussel M, Haverkamp S, Fuhrmann JC, Wang H, Wässle H, Olsen RW, Betz H (2000年7月). 「γ-アミノ酪酸A型受容体（GABAAR）関連タンパク質GABARAPはゲフィリンと相互作用するが、シナプスにおける受容体のアンカーには関与しない」.  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (15): 8594–8599 . Bibcode : 2000PNAS...97.8594K. doi : 10.1073/pnas.97.15.8594 . PMC  26993. PMID 10900017
  • Hu RM、Han ZG、Song HD、Peng YD、Huang QH、Ren SX、Gu YJ、Huang CH、Li YB、Jiang CL、Fu G、Zhang QH、Gu BW、Dai M、Mao YF、Gao GF、Rong R、Ye M、Zhou J、Xu SH、Gu J、Shi JX、Jin WR、Zhang CK、Wu TM、Huang GY、Chen Z、Chen MD、Chen JL (2000年8月)。「ヒト視床下部-下垂体-副腎系における遺伝子発現プロファイリングと完全長cDNAクローニング」米国科学アカデミー紀要97 (17): 9543–9548 .書誌コード:2000PNAS... 97.9543H doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC  16901. PMID  10931946.
  • Chen L, Wang H, Vicini S, Olsen RW (2000年10月). 「γ-アミノ酪酸A型（GABAA）受容体関連タンパク質（GABARAP）はGABAA受容体のクラスター化を促進し、チャネル動態を調節する」米国 科学アカデミー紀要. 97 (21): 11557–11562 .書誌コード:2000PNAS...9711557C. doi : 10.1073/pnas.190133497 . PMC  17239. PMID 10984509
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000年10月). 「CD34陽性造血幹/前駆細胞で発現する、これまで未同定であった300遺伝子のオープンリーディングフレームを持つcDNAのクローニングと機能解析」. Genome Research . 10 (10): 1546– 1560. doi :10.1101/gr.140200. PMC  310934. PMID  11042152 .
  • 岡崎尚志、ヤン・ジュン、湯浅誠、上野孝文、小南英樹、増保雄三、古賀浩志、村松正之（2000年12月）。「脳におけるUnc-51様キナーゼと微小管関連タンパク質軽鎖3関連タンパク質の相互作用：軸索伸長における小胞輸送の役割の可能性」。脳 研究。分子脳研究。85 ( 1–2 ): 1–12。doi : 10.1016 /S0169-328X(00)00218-7。PMID 11146101
  • Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (2001年6月). 「GABA(A)受容体関連タンパク質のヒトホモログ3種およびマウスホモログ2種のクローニング、発現パターン、および染色体局在」. Genomics . 74 (3): 408–413 . doi :10.1006/geno.2001.6555. PMID  11414770
  • Kittler JT、Rostaing P、Schiavo G、Fritschy JM、Olsen R、Triller A、Moss SJ（2001年7月）。「GABARAPの細胞内分布とNSFとの相互作用能力は、このタンパク質がGABA(A)受容体の細胞内輸送において役割を果たしていることを示唆している」。Molecular and Cellular Neurosciences . 18 (1): 13– 25. doi :10.1006/mcne.2001.1005. PMID  11461150. S2CID  43244403
  • Stangler T, Mayr LM, Dingley AJ, Luge C, Willbold D (2001年10月). 「ヒトGABA受容体関連タンパク質の配列特異的1H、13C、15N共鳴帰属」. Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 183–4 . doi :10.1023/A:1012416810974. PMID  11727985. S2CID  31757286
  • Harris R, McAlister MS, Sankar A, Phelan JP, Moss SJ, Keep NH, Driscoll PC (2001年10月). 「14 kDタンパク質、GABA(A)受容体関連タンパク質（GABARAP）のバックボーン1H、13C、および15N共鳴帰属」. Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 185–6 . doi :10.1023/A:1012473609468. PMID  11727986. S2CID  82224217.
  • Knight D, Harris R, McAlister MS, Phelan JP, Geddes S, Moss SJ, Driscoll PC, Keep NH (2002年2月). 「γ-アミノ酪酸受容体A型受容体関連タンパク質のX線結晶構造と推定リガンド由来ペプチド結合特性」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5556– 5561. doi : 10.1074/jbc.M109753200 . PMID  11729197.
  • Coyle JE、Qamar S、Rajashankar KR、Nikolov DB（2002年1月）。「2つのコンフォメーションにおけるGABARAPの構造：GABA(A)受容体の局在とチューブリン結合への影響」。Neuron . 33 ( 1 ): 63–74 . doi : 10.1016/S0896-6273(01)00558-X . PMID  11779480. S2CID  14487823
  • 谷田一郎、谷田（三宅）英二、小松正之、上野剛志、小南英二（2002年4月）。「ヒトApg3p/Aut1pホモログは、GATE-16、GABARAP、MAP-LC3といった複数の基質に対する真のE2酵素であり、hApg12pからhApg5pへの結合を促進する」The Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13739– 13744. doi : 10.1074/jbc.M200385200 . PMID  11825910
  • Stangler T, Mayr LM, Willbold D (2002年4月). 「ヒトGABA(A)受容体関連タンパク質GABARAPの溶液構造：生物学的機能とその調節への示唆」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13363–13366 . doi : 10.1074/jbc.C200050200 . PMID  11875056
  • 河野 剛志、三浦 健、兼松 剛志、白川 正之、平田 正治、河野 健志 (2002年1月). 「GABAA受容体関連タンパク質GABARAPの1H、13C、および15N共鳴帰属」. Journal of Biomolecular NMR . 22 (1): 97–98 . doi :10.1023/A:1013884402033. PMID  11885988. S2CID  82980835
  • 谷田一郎、谷田（三宅）英二、西谷 剛志、小松 正治、山崎 秀、上野 剛志、小南 恵介（2002年3月）。「マウスApg12pは、3つのApg8pホモログよりもマウスApg7pを基質として好む」。生化学および生物物理学的研究コミュニケーション。292 (1): 256–262 . doi :10.1006/bbrc.2002.6645. PMID  11890701
  • Nymann-Andersen J, Wang H, Chen L, Kittler JT, Moss SJ, Olsen RW (2002年3月). 「GABA(A)受容体関連タンパク質（GABARAP）とGABA(A)受容体間のサブユニット特異性と相互作用ドメイン」. Journal of Neurochemistry . 80 (5): 815– 823. doi :10.1046/j.0022-3042.2002.00762.x. PMID  11948245. S2CID  38049055.
「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=GABARAP&oldid=1301011212」より取得