デファ6

デファ6
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1ZMQ、3QTE
識別子
エイリアス	DEFA6、DEF6、HD-6、デフェンシンアルファ6
外部ID	オミム：600471; MGI : 3711900;ホモロジーン: 130499;ジーンカード：DEFA6; OMA :DEFA6 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	8番染色体（ヒト）
終わり	6,926,076 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	8番染色体（マウス）
終わり	21,556,012 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	十二指腸; ; 直腸; ; 横行結腸粘膜; ; 付録; ; リンパ節; ; 膵臓の体; ; 腹部の皮膚; ; 骨髄; ; 右肺; ; 胃粘膜;
	上位の表現
	回腸; ; 空腸; ; 十二指腸; ; 胚; ; 結腸; ; 膵臓; ; 胸腺; ; 食道; ; 肝臓; ; 胃;
	より多くの参照表現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; タンパク質ホモ二量体化活性;
細胞成分	ゴルジ体腔; 細胞外領域; 細胞外空間;
生物学的プロセス	防御対応; 細菌に対する防御反応; 真菌に対する防御反応; 抗菌体液性反応; 抗菌ペプチドを介した抗菌性体液性免疫応答; 他の生物の細胞を殺す; 粘膜における自然免疫反応; 抗菌性体液性反応; グラム陰性細菌に対する防御反応; グラム陽性細菌に対する防御反応; 他の生物における膜破壊; リポ多糖に対する細胞反応;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	1671
	100041688
	ENSG00000164822 ; ENSG00000285136
	ENSMUSG00000061845
	Q01524
	E9QLQ1
	NM_001926
	NM_001177481
	NP_001917
	NP_001170952
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

デフェンシンα6（DEFA6）はヒトαデフェンシン6 （HD6 ）としても知られ、 DEFA6遺伝子によってコードされるヒトタンパク質である。^[5]^[6]DEFA6は回腸のパネート細胞で発現する。^[7]

関数

アルファディフェンシンは、細菌やウイルスから宿主を守る殺菌性および細胞傷害性ペプチドのファミリーです。HD6は抗菌力が低いです。^[8]しかし、HD6は自己集合して線維やナノネットを形成し、細菌を取り囲んで絡み合わせることで、腸内細菌性病原体の侵入を防ぎます。 ^[9]

DEFA6を含むいくつかのαデフェンシン遺伝子は、8番染色体上に集まっている。^[5]

参考文献

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さらに読む

Szyk A, Wu Z, Tucker K, Yang D, Lu W, Lubkowski J (2006年12月). 「ヒトα-ディフェンシンHNP4、HD5、およびHD6の結晶構造」. Protein Science . 15 (12): 2749–60 . doi :10.1110/ps.062336606. PMC 2242434. PMID 17088326 .
Wu Z, Ericksen B, Tucker K, Lubkowski J, Lu W (2004年9月). 「ヒトα-ディフェンシン4-6の合成と特性解析」. The Journal of Peptide Research . 64 (3): 118–25 . doi :10.1111/j.1399-3011.2004.00179.x. PMID 15317502.
Mallow EB, Harris A, Salzman N, Russell JP, DeBerardinis RJ, Ruchelli E, Bevins CL (1996年2月). 「ヒト腸管デフェンシン. 遺伝子構造と発生的発現」. The Journal of Biological Chemistry . 271 (8): 4038–45 . doi : 10.1074/jbc.271.8.4038 . PMID 8626737.
Bevins CL, Jones DE, Dutra A, Schaffzin J, Muenke M (1996年1月). 「ヒト腸管デフェンシン遺伝子：染色体地図上の位置と進化的関係のモデル」. Genomics . 31 (1): 95–106 . doi :10.1006/geno.1996.0014. PMID 8808285.
Eisenhauer PB, Harwig SS, Lehrer RI (1992年9月). 「クリプトジン：マウス小腸の抗菌性デフェンシン」.感染と免疫. 60 (9): 3556–65 . doi :10.1128/IAI.60.9.3556-3565.1992. PMC 257361. PMID 1500163 .
Huttner KM, Selsted ME, Ouellette AJ (1994年2月). 「マウスクリプトジン遺伝子ファミリーの構造と多様性」. Genomics . 19 (3): 448–53 . doi :10.1006/geno.1994.1093. PMID 8188287.

外部リンク

PDBe-KBは、ヒトデフェンシン6のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。

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[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000285136 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000164822, ENSG00000285136 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000061845 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[entrez-5] "Entrez Gene: DEFA6 デフェンシン、アルファ 6、パネート細胞特異的 (Homo sapiens)".

[pmid8417977-6] Jones DE, Bevins CL (1993年1月). 「ヒトパネート細胞におけるデフェンシン6 mRNA：ヒト腸管の宿主防御における抗菌ペプチドの意義」. FEBS Letters . 315 (2): 187–92 . Bibcode :1993FEBSL.315..187J. doi : 10.1016/0014-5793(93)81160-2 . PMID 8417977. S2CID 45099115.

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[pmid15616305-8] Ericksen B, Wu Z, Lu W, Lehrer RI (2005年1月). 「6種類のヒトα-デフェンシンの抗菌活性と特異性」. 『抗菌剤と化学療法』. 49 (1): 269–75 . doi :10.1128/AAC.49.1.269-275.2005. PMC 538877. PMID 15616305 .

[pmid22722251-9] Chu H, Pazgier M, Jung G, Nuccio SP, Castillo PA, de Jong MF, et al. (2012年7月). 「ヒトα-デフェンシン6は自己組織化ペプチドナノネットを介して粘膜自然免疫を促進する」. Science . 337 (6093): 477–81 . Bibcode :2012Sci...337..477C. doi :10.1126/science.1218831. PMC 4332406. PMID 22722251 .