ハプログループHV
ハプログループHV
起源の可能性のある時期24000年前[ 1 ]
起源地の可能性西アジア（近東またはコーカサス）[ 2 ]
祖先R0
子孫HV0、HV1、HV2、HV3、HV4、HV5、H、V
突然変異の定義T14766C [ 3 ]

ハプログループ HVは、ヒトのミトコンドリア DNA (mtDNA) ハプログループです。

起源

ハプログループHVはハプログループR0から派生し、R0はさらにハプログループRから派生しています。HVはハプログループHとVの祖先系統でもあります。HVハプログループの起源は、HVの最も高い有病率が確認されている西イラン、メソポタミア、南コーカサス地方にあると考えられます。[ 4 ]

分布

ハプログループ HV は、主に西アジア、中央アジア、南ヨーロッパ、東ヨーロッパ、北アフリカに見られます。

アフリカでは、この系統群はエル・ハイエズ・オアシスに住むエジプト人（14.3%）の間でピークを迎えます。[ 5 ] HV0サブ系統群はモザバイト・ベルベル人（8.24%）、[ 6 ]リビア人（7.4%）、[ 7 ]レギバテ・サハラウィ人（6.48%）、[ 6 ]ゼナタ・ベルベル人（5.48%）、[ 6 ]アルジェリア人（合計4.84%、オランでは2.15%-3.75% ）の間で発生します。[ 6 ]

2013年に発表された研究では、ハプログループHV(xHV0, H)はアフガニスタンの人口のかなりの割合で発見されており、ウズベク人が11.0%(14/127) (HV2が1/127、HV6が1/127を含む)、タジク人が8.2 %(12/146)(HV6が3/146、HV2が1/146を含む)、トルクメン人が8.0% (6/75)(HV2が1/75を含む)、ハザラ人が6.4%(5/78)、パシュトゥーン人が5.6%(5/90)であった。[ 8 ]さらに、ハプログループHV0はアフガニスタンのタジク人のサンプルの1.4%(2/146)で発見されたが、これらがハプログループVサブクレードに属するかどうかは不明である。[ 8 ]ある研究では、サブクラスHV1a1aはヤクート人の1.8％（169人中3人）に見られ[ 9 ] 、2013年に発表された別の研究[ 10 ]ではヤクート人の1.2％（423人中5人）に見られました。

2003年に発表された研究では、南イタリアで発見された2万4000年前のクロマニョン人型の解剖学的に現代人の骨2体のmtDNA配列が報告されています。この研究では、1体がハプログループHVまたはR0のいずれかに属していることが示されました。[ 11 ]ハプログループHVは、中エジプトのアブシール・エル・メレク遺跡で発掘された、プトレマイオス朝前期/新王国時代後期、プトレマイオス朝、ローマ時代の古代エジプトのミイラからも発見されています。[ 12 ]

ハプログループHVは、古代DNAの分析が行われた様々な化石で発見されており、その中にはアルフォルド線状陶器（HV、メゾーケーヴェシュド・モチョリャス、1/3または33%）、線状陶器（HV0a、ファイシュ・ガラドンブ、1/2または50%）、ドイツ中期新石器時代（HV、クヴェードリンブルク、1/2または50%）の文化に関連する標本が含まれています。[ 13 ]

サブクレード

木

このハプログループHVサブクレードの系統樹は、van Oven（2009） [ 3 ]とMalyarchuk et al.（2008） [ 14 ]の論文に基づいています。

  • HV
    • HV0（以前はpre-Vと呼ばれていました）
      • HV0a（以前はpreV*2と呼ばれていました）
        • HV0a1
        • V
      • 195（旧称preV*1）
        • HV0b
        • HV0c
    • HV1
      • HV1a
        • HV1a1
          • HV1a1a
        • HV1a2
      • HV1b
        • HV1b1
        • HV1b2
      • HV1c
    • 73
      • HV2
        • HV2a
    • HV4
      • HV4a
    • HV5
    • 16311（以前はHV3として知られていた）[ 15 ]（13±2千年前）[ 16 ]
      • HV6（以前はHV3bとして知られていた）（15.4±4.5千年前）
        • HV6a（以前はHV3b1と呼ばれていました）
      • HV7（旧称HV3c）
      • HV8（旧称HV3d）
      • HV9（以前はHV3aとして知られていた）（8.2±2.9千年前）
        • 152
          • HV9a
      • HV10
    • H

HV0およびHVSI C16298T

2012年現在、超可変セグメントの1つであるセグメントIの位置16298におけるC/T変異の定義はHV0とされている。2002年に西ヨーロッパの人口を対象に行われた調査で、上記の変異の検査で陽性と判定された人の割合は以下のとおりである。[ 17 ]

人口＃いいえ人口の割合
フィンランド5012
ノルウェー3234
スコットランド8744
イングランド2623
北ドイツ1406
南ドイツ2665
フランス2133
ガリシア1355
北ポルトガル1847
ポルトガル中部1623
南ポルトガル1964
北アフリカ3495

ロシア人とポーランド人を対象とした研究では、この変異の検査で陽性反応を示した人の割合は両集団とも5％でした。[ 18 ]

人口＃いいえパーセンテージ
研磨4365
ロシア2015

イラク人を対象とした研究では、中東およびイタリアの人口においてこの変異のレベルが低いことを示した過去の多くの研究を要約しました。[ 19 ]

人口＃いいえ人口の割合
イラク2160.5
シリア692.9
ジョージア語1390.7
イタリア語995.1

この変異は、スウェーデンのゴットランド島で発掘された紀元前2800～2000年のものとされ、考古学的にはピットウェア文化に属すると分類されている19体の人骨のうちの1体から得られた古代DNAで検出された。[ 20 ]

参照

ウィキメディア コモンズには、ハプログループ HV (mtDNA)に関連するメディアがあります。

ヒトミトコンドリアDNA（mtDNA）ハプログループの系統樹

  ミトコンドリア・イブ（L）    
L0L1～6  
L1L2  L3    L4L5L6
M北 
チェコ共和国DEG質問  おあSR  私WXはい
CZBFR0  JT以前  P  あなた
HVJTK
HVJT

参考文献

  1. ^ Malyarchuk et al. (2008): 「中期後期旧石器時代（26,000年前）の主な構成要素はHV*、U1、おそらくU2、U4であり、前期後期旧石器時代（45,000年前）の主な構成要素は主にハプログループU5であった」
  2. ^ Malyarchuk et al. (2008): 「現在ヨーロッパで発見されているHVハプログループのほとんどは近東およびコーカサス地方に起源を持つと示唆されている (Richards et al. 2000; Tambets et al. 2000) が、HVファミリーに属するハプログループの分類に関してはまだ多くの疑問が残っている。」
  3. ^ a b Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). 「ヒトミトコンドリアDNA変異の包括的系統樹の更新」 . Human Mutation . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749 .
  4. ^シャムーン＝プール、ミシェル；リー、ミアン；メリウェザー、D・アンドリュー（2019年10月14日） 「稀なヒトミトコンドリアHV系統は、 LGM後および新石器時代の拡大期に近東およびコーカサスから拡散した」。Scientific Reports。9 ( 1 ) . doi : 10.1038 / s41598-019-48596-1。eISSN 2045-2322。PMC 6791841。PMID 31611588。   
  5. ^マルティナ・クヤノヴァ、ルイサ・ペレイラ、ヴェロニカ・フェルナンデス、ジョアナ・B・ペレイラ、ヴィクトル・チェルニー (2009). 「エジプト西部砂漠の小さなオアシスにおける近東新石器時代の遺伝的影響」.アメリカ自然人類学ジャーナル. 140 (2): 336– 346. doi : 10.1002/ajpa.21078 . PMID 19425100 . 
  6. ^ a b c dアスマハン・ベカダ;ララ・R・アラウナ。タリア・デバ;フランシス・カラフェル。ソラヤ・ベンハマムーシュ。デビッド・コマス（2015年9月24日）。「アルジェリア人集団における遺伝的異質性」。プロスワン。10 (9) e0138453。ビブコード: 2015PLoSO..1038453B。土井：10.1371/journal.pone.0138453。PMC 4581715。PMID 26402429。  ; S5 テーブル
  7. ^カリマ・ファドラウイ＝ジッド;ローラ・ロドリゲス＝ボティゲ。ネジブ・ナウイ。アメル・ベナンマル＝エルガイド。フランシス・カラフェル。デビッド・コマス (2011 年 5 月)。「北アフリカのミトコンドリア DNA 構造は、ナイル川流域の遺伝的不連続性を明らかにする」(PDF)。アメリカ物理人類学ジャーナル。145 (1): 107–117 .土井: 10.1002/ajpa.21472。hdl : 10261/42802。PMID 21312180 。2016 年4 月 20 日に取得。 
  8. ^ a bディ・クリストファロ・J、ペンナルン・E、マジエール・S、ミレス・NM、リン・AA、他。（2013）、「アフガニスタンのヒンドゥークシュ：ユーラシア亜大陸の遺伝子の流れが集まる場所」。PLoS ONE 8(10): e76748。土井:10.1371/journal.pone.0076748
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  11. ^ Caramelli, D; Lalueza-Fox, C; Vernesi, C; Lari, M; Casoli, A; Mallegni, F; Chiarelli, B; Dupanloup, I; et al. (2003). 「ネアンデルタール人と24,000年前の解剖学的に現代的なヨーロッパ人との間の遺伝的不連続性の証拠」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 100 (11): 6593–7 . Bibcode : 2003PNAS..100.6593C . doi : 10.1073 /pnas.1130343100 . PMC 164492. PMID 12743370 .  
  12. ^ Schuenemann, Verena J.; et al. (2017). 「古代エジプトのミイラゲノムは、ローマ帝国以後の時代にサハラ以南のアフリカ系祖先の増加を示唆している」 . Nature Communications . 8 15694. Bibcode : 2017NatCo...815694S . doi : 10.1038/ncomms15694 . PMC 5459999. PMID 28556824 .  
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  15. ^ハプログループ HVイアン・ローガンのミトコンドリアDNAサイト 2009
  16. ^ Malyarchuk et al. (2008): 「np 16311における遷移によって定義されるHV3全体の合体年齢は12,700 ± 1,960 YBPである。しかしながら、np 16311の高変異性のため、HV3は多系統性を持つ可能性があることに留意すべきである。一方、サブクラスターHV3aとHV3bは単系統性である可能性が高く、それぞれの推定年齢は8,200 ± 2,900 YBPと15,420 ± 4,500 YBPであった。しかし、HV3bは非同義置換と同義置換の比率が高いという特徴があるため、Kivisild et al. (2006) (表2) が示唆した比率を用いると、その合体年齢は11,837 ± 4,460 YBPと推定できる。ハプログループHV4の年齢推定についても同様のことが当てはまると考えられる。」
  17. ^ゴンザレス、AM;ブレーム、A;ペレス、JA;マカ・マイヤー、N;フローレス、C; VM、カブレラ (2003)。 「ヨーロッパの大西洋縁部におけるミトコンドリア DNA の親和性」。アメリカ物理人類学ジャーナル。120 (4): 391–404 .土井: 10.1002/ajpa.10168。PMID 12627534。 
  18. ^ Malyarchuk, BA; Grzybowski, T; Derenko, MV; Czarny, J; Woźniak, M; Miścicka-Sliwka, D (2002). 「ポーランド人とロシア人のミトコンドリアDNAの変異性」Annals of Human Genetics . 66 (Pt 4): 261– 83. doi : 10.1046/j.1469-1809.2002.00116.x . PMID 12418968 . S2CID 221424344 .  
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