ジョン・クラーディ
アメリカの化学者
ジョン・クラーディ
生まれ
ワシントンD.C
出身校イェール大学（学士）、ハーバード大学（博士）
受賞歴アーネスト・グエンサー賞 （1995年）

ジョン・クラーディ（1943年5月16日生まれ、ワシントンD.C.、アメリカ合衆国）は、現在、ハーバード大学医学部の生化学および分子薬理学のシェン・ウー・デイジー・イェン・ウー教授です。 [1]彼の研究は天然物の単離と構造特性の解明に焦点を当てており、現在は共生相互作用と疾患の媒介における生物学的に活性な小分子の役割を調査しています。[2]

略歴

クラーディはアメリカ合衆国バージニア州アーリントンで4人兄弟の長男として育ちました。 1964年にイェール大学に入学し、理学士号を取得し、ファイ・ベータ・カッパに選出されました。生物学に常に魅了されていましたが、大学時代には化学への関心が高まりました。R・スティーブン・ベリーの指導の下、有機合成の学部研究を行い、特にベンザインに重点を置きました。[3]イェール大学卒業後、ハーバード大学に移り、1969年に化学の博士号を取得しました。その後、アイオワ州立大学化学科の教員となり、エイムズ研究所に所属しました。1978年にコーネル大学化学科に移り、2002年にハーバード大学医学部の生物化学・分子薬理学科に移るまで在籍しました2004年、スチュアート・シュライバーとグレッグ・ヴァーディンと共に化学生物学の博士課程を開始した。[4]また、理系を専攻していないハーバード大学の学部生向けに「生命の分子」と題した人気授業を創設し、現在も教え続けている。

博士号取得を目指していたクラーディは、スワースモア大学を卒業した作家の妻、アンドレア・フレックと出会いました。彼女の作品には、児童書1冊、ニューヨーク州北部を舞台にした2冊の本、そして全米各地で上演された舞台劇などがあります。二人の間には二人の息子がいます。

天然物の発見

クラーディの初期の研究は、主にX線結晶構造解析による天然物の構造解明に焦点を当てていました。アイオワ州立大学在学初期に、クラーディはビル・フェニカル、ジョン・フォークナー、ポール・シューアーと重要な共同研究を行い、[5]抗癌剤ブリオスタチン[6]、殺虫・抗真菌剤ジャスパミド、ジアゾナミドAおよびB [7]など、数多くの海洋天然物の構造解明につながりました。彼の初期の最も注目すべき研究のいくつかは、「赤潮」に関連する神経毒に焦点を当てたものであり、ゴニオトキシン群のサキシトキシン[8]、および環状ポリエーテルのブレベトキシンBの三次元構造の解明につながりました。[9]コーネル大学に移ると、クラーディの研究は、真菌、放線菌、線虫など 、海洋以外の多様な生物にまで広がりました。彼は長年、内生菌類への関心から、選択的に細胞毒性を示すキノンであるトレヤン酸、構造的に多様なグアナカステペン、抗真菌剤であるクリプトシンなど、数多くの物質を発見しました。

最近、クラーディは、新規小分子の豊富な供給源として、細菌と他の生物との共生関係に注目しています。[10] キャメロン・カリーと共同で、クラーディは放線菌と南部松くい虫、アリ、シロアリなどの昆虫との共生関係を調査し、デンティゲルマイシン[11] [12]やミカンギマイシン[ 13] [14]などの抗真菌剤の発見につながりました。 複雑な生態学的相互作用における化学交換の研究は、クラーディ研究室の中心的な研究分野であり続けています。[15]

小分子-タンパク質相互作用のX線結晶構造解析

Clardy 氏は、Stuart Schreiber 氏および同僚と共同で、FK506/ FKBP 12 およびラパマイシン/FKBP12 複合体の結晶構造を取得した。[16] その後まもなく、Schreiber 氏と Clardy 氏は FK506/ラパマイシン/FRAP 複合体の構造を決定した。これは、細胞透過性小分子がタンパク質二量体化を促進する能力を明らかにした画期的な研究であった。[17] 新興製薬会社 Vertex は、FK506 の無毒バージョンを設計するために設立された。[18] Walter Leal 氏と共同で、Clardy 氏および同僚は、メスのカイコガの触角に位置する結合パートナーを持つ揮発性昆虫フェロモンボンビコールの X 線結晶構造を取得した。[19] この研究は、この非常に特異的な小分子とタンパク質の相互作用に関する理解をさらに深めただけでなく、匂い物質結合タンパク質の初の 3 次元構造となった。[20]

eDNA

クラーディは培養不可能な細菌が作る天然物質の解明でも知られており、ジョー・ハンデルスマンやロバート・M・グッドマンと共にメタゲノミクス分野の開拓者として知られています。ショーン・ブレイディと共に、土壌などの環境DNA （eDNA）からDNAを直接コスミドライブラリーに挿入し、生合成遺伝子クラスターを探索し、これらの遺伝子の産物を同定する方法を開発しました。[21] この方法を用いて、彼らは長鎖N-アシルチロシン由来の天然物質など、従来の実験室技術では達成できなかった多数の抗生物質の構造を解明しました。[22]

参考文献

  1. ^ 「BCMP | 生物化学・分子薬理学部」Bcmp.med.harvard.edu 。 2013年9月28日閲覧
  2. ^ “Jon Clardy | Clardy Laboratory”. Clardy.med.harvard.edu . 2013年9月28日閲覧。
  3. ^ ベリー, RS, クラーディ, J. & シェーファー, ME. ベンザイン. J. Am. Chem. Soc. 86, 2738–2739 (1964)
  4. ^ 「The Chemical Biologists | Harvard Magazine Mar-Apr 2005」. Harvard Magazine . Harvardmagazine.com. 2005年3月. 2013年9月28日閲覧。
  5. ^ アメリカ生薬学会ニュースレター 1-3 (2004)
  6. ^ Pettit, GR et al. ブリオスタチン1の単離と構造. J. Am. Chem. Soc. 104, 6846–6848 (1982)
  7. ^ Lindquist, N., Fenical, W., Van Duyne, GD & Clardy, J. 海産ホヤ類Diazona chinensis由来の異常細胞毒性代謝物であるジアゾナミドAおよびBの単離と構造決定. J. Am. Chem. Soc. 113, 2303–2304 (1991)
  8. ^ シャンツ、EJ 他。サキシトキシンの構造。 J.Am.化学。社会97、1238–1239 (1975)
  9. ^ Lin, Y.-Y. et al. 赤潮性渦鞭毛藻類Ptychodiscus brevis (Gymnodinium breve)からのブレベトキシンBの単離と構造 J. Am. Chem. Soc. 103, 6773–6775 (1981)
  10. ^ “甲虫と細菌について | The Scientist Magazine”. 2013年10月2日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年8月25日閲覧。
  11. ^ Oh, D.-C., Poulsen, M., Currie, CR & Clardy, J. Dentigerumycin: a bacterial mediator of an ant-fungus symbiosis. Nat Chem Biol 5, 391–393 (2009)
  12. ^ ウィルソン, E. & ヤーネル, A. 共謀：菌類、アリ、そして細菌。化学工学ニュース87, 15 (2009)
  13. ^ スコット、JJ他「甲虫と菌類の共生に対する細菌による保護」サイエンス322, 63 (2008)
  14. ^ Drahl, C. 甲虫細菌は抗真菌剤として機能する。Chemical & Engineering News 86, 47 (2008)
  15. ^ “Jon Clardy”. Academy.asm.org. 2013年4月25日時点のオリジナルよりアーカイブ。2013年9月28日閲覧。
  16. ^ Van Duyne, GD, Standaert, RF, Karplus, PA, Schreiber. SL, Clardy J. 免疫フィリン-免疫抑制剤複合体FKBP-FK506の原子構造. Science 252, 839-842 (1991)
  17. ^ Choi, J., Chen, J., Schreiber SL, Clardy J. ヒトFRAPの結合ドメインと相互作用するFKBP12-ラパマイシン複合体の構造。Science 273, 239-242 (1996)
  18. ^ 10億ドルの分子：完璧な薬を求めて、バリー・ワース、1994年
  19. ^ Sandler, BH, Nikonova, L., Leal, WS & Clardy, J. カイコガにおける性的誘引：フェロモン結合タンパク質-ボンビコール複合体の構造. Chemistry & Biology 7, 143–151 (2000)
  20. ^ Sandler, BH, Nikonova, L., Leal, WS & Clardy, J. カイコガにおける性的誘引：フェロモン結合タンパク質-ボンビコール複合体の構造. Chemistry & Biology 7, 143–151 (2000)
  21. ^ Brady, SF, Chao, CJ & Clardy, J. 環境DNA（eDNA）遺伝子クラスターからの新規天然物ファミリー. J. Am. Chem. Soc. 124, 9968–9969 (2002)
  22. ^ Brady, SF, Chao, CJ & Clardy, J. 環境DNAからの長鎖N-アシルチロシン合成. Appl. Environ. Microbiol. 70, 6865–6870 (2004)
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