ヒトのタンパク質コード遺伝子
| NIFK |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | NIFK、MKI67IP、Nopp34、MKI67のFHAドメインと相互作用する核小体タンパク質 |
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| 外部ID | オミム:611970; MGI : 1915199;ホモロジーン: 49862;ジーンカード:NIFK; OMA :NIFK - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 E2.3 | 始める | 118,249,569 bp [2] |
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| 終わり | 1億1826万1552塩基対[2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - アキレス腱
- 心室帯
- 神経節隆起
- 軟骨組織
- 前脛骨筋
- S状結腸粘膜
- 膵臓の体
- リンパ節
- 子宮内膜
- 付録
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| | 上位の表現 | - 原始的な条線
- 性器結節
- 胚葉上層
- 胚
- 胚
- 胚の尾
- 桑実胚
- 桑実胚
- 卵黄嚢
- 心室帯
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ホスファターゼ活性の負の調節
- rRNA転写
- rRNA代謝プロセス
- タンパク質を含む複合体集合体
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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タンパク質ドメイン
| hNIFKのFHA Ki67結合ドメイン |
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 ki67fha/hnifk(226-269)3p複合体の溶液構造 |
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| シンボル | hNIFK_binding |
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| ファム | PF12196 |
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| インタープロ | IPR021043 |
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MKI67 FHAドメイン相互作用核小体リン酸化タンパク質は、ヒトではMKI67IP遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
MKI67 FHAドメイン相互作用核小体リン酸化タンパク質は、N末端付近にRNA認識モチーフ(RRM)を、C末端付近にFHA Ki67結合ドメインを有する。FHA Ki67結合ドメインには、TPVCTPとLERRKSという2つの保存配列モチーフがあり、このドメインはヒトKi67のフォークヘッド関連ドメインに結合する。高親和性結合には、CDK1とGSK3という2つのキナーゼによる連続的なリン酸化が必要であり、その結果、 pThr 238、pThr 234、およびpSer 230が生成される。この相互作用は細胞周期制御に関与している。 [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000155438 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026377 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 高木 正之、末石 正之、西脇 剛志、亀高 明生、米田 雄一 (2001年7月). 「新規核小体タンパク質NIFKは有糸分裂においてKi-67抗原のフォークヘッド関連ドメインと相互作用する」J Biol Chem . 276 (27): 25386–91 . doi : 10.1074/jbc.M102227200 . PMID 11342549.
- ^ 「Entrez Gene: MKI67IP MKI67 (FHA ドメイン) 相互作用核小体リン酸化タンパク質」。
- ^ Byeon IJ, Li H, Song H, Gronenborn AM, Tsai MD (2005年11月). 「Ki67のFHAドメインによる特異的標的認識は、連続リン酸化と多部位相互作用によって特徴付けられる」Nat. Struct. Mol. Biol . 12 (11): 987–93 . doi :10.1038/nsmb1008. PMID 16244663. S2CID 5680428.
さらに読む
- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). 「ヒト核小体の機能的プロテオーム解析」Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9 . doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Li H, Byeon IJ, Ju Y, Tsai MD (2004). 「ヒトKi67 FHAドメインの構造とhNIFKリン酸化タンパク質断片との結合は、特異的な認識部位とFHAドメイン機能の構造基盤への新たな視点を明らかにする」J. Mol. Biol . 335 (1): 371– 81. doi :10.1016/j.jmb.2003.10.032. PMID 14659764.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, et al. (2005). 「ヒト第2染色体および第4染色体のDNA配列の生成とアノテーション」. Nature . 434 (7034): 724–31 . Bibcode :2005Natur.434..724H. doi : 10.1038/nature03466 . PMID 15815621.
- Byeon IJ, Li H, Song H, et al. (2006). 「Ki67のFHAドメインによる特異的標的認識は、連続的なリン酸化と多部位相互作用によって特徴付けられる」Nat. Struct. Mol. Biol . 12 (11): 987–93 . doi :10.1038/nsmb1008. PMID 16244663. S2CID 5680428.
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). 「ヒト有糸分裂紡錘体のリン酸化プロテオーム解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 103 (14): 5391–6 . Bibcode :2006PNAS..103.5391N. doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365. PMID 16565220 .
外部リンク
- PDBe-KBは、ヒトMKI67 FHAドメイン相互作用核小体リン酸化タンパク質(MKI67IP)のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。
この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR021043からのテキストが含まれています。