ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| MXD1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1E91、1G1E、1NLW、1PD7、1S5Q |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MXD1、BHLHC58、MAD、MAD1、MAX二量体化タンパク質1 |
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| 外部ID | OMIM : 600021; MGI : 96908;ホモロジーン: 1767;ジーンカード:MXD1; OMA :MXD1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 6番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 D1|6 37.75 cM | 始める | 86,624,024 bp [2] |
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| 終わり | 86,646,143 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 口腔粘膜細胞
- 咽頭粘膜
- 卵母細胞
- 二次卵母細胞
- 羊水
- 血
- 口腔
- 小腸粘膜
- 結腸粘膜
- S状結腸粘膜
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| | 上位の表現 | - 顆粒球
- 左結腸
- 血
- 網膜色素上皮
- 十二指腸
- 毛様体
- 二次卵母細胞
- 胃上皮
- 空腸
- 結膜円蓋
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- タンパク質結合
- 転写コレギュレーター活性
- タンパク質二量体化活性
- 転写コリプレッサー活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 細胞集団の増殖
- 転写の制御、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_002357 NM_001202513 NM_001202514 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001189442 NP_001189443 NP_002348 |
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| 場所(UCSC) | 2番目の文字: 69.9 – 69.94 Mb | 6番目の文字: 86.62 – 86.65 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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MADタンパク質はヒトではMXD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
MAD-MAX二量体化タンパク質は、MAX相互作用タンパク質のサブファミリーに属します。このタンパク質は、MYCと競合してMAXに結合し、配列特異的なDNA結合複合体を形成します。また、転写抑制因子として作用し(MYCは転写活性化因子として機能するようです)、腫瘍抑制因子の候補となります。[6]
相互作用
MXD1はヒストン脱アセチル化酵素2、[7] [8] SMC3、[9] MLX、[10] [11] SIN3A [12] [13] [14]およびMAXと相互作用することが示されている。[9] [15] [16] [17]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000059728 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000001156 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Shapiro DN, Valentine V, Eagle L, Yin X, Morris SW, Prochownik EV (1995年2月). 「ヒトMAD遺伝子およびMXI1遺伝子の染色体2p12-p13および10q24-q25への割り当て」. Genomics . 23 (1): 282–5 . doi :10.1006/geno.1994.1496. PMID 7829091.
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- ^ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar (2004年8月). 「HBP1およびMad1リプレッサーは、Sin3コリプレッサーPAH2ドメインに逆らせん配向で結合する」. Nat. Struct. Mol. Biol . 11 (8). 米国: 738–46 . doi :10.1038/nsmb798. ISSN 1545-9993. PMID 15235594. S2CID 44324333.
- ^ Brubaker, K; Cowley SM; Huang K; Loo L; Yochum GS; Ayer DE; Eisenman RN; Radhakrishnan I (2000年11月). 「Mad-Sin3複合体の相互作用ドメインの溶液構造:クロマチン修飾複合体のリクルートメントへの影響」. Cell . 103 (4). 米国: 655–65 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00168-9 . ISSN 0092-8674. PMID 11106735. S2CID 17476603.
- ^ Ayer, DE; Lawrence QA; Eisenman RN (1995年3月). 「Mad-Max転写抑制は、酵母リプレッサーSin3の哺乳類ホモログとの三元複合体形成によって媒介される」. Cell . 80 (5). 米国: 767–76 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . ISSN 0092-8674. PMID 7889570. S2CID 8749951.
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- ^ Nair, Satish K; Burley Stephen K (2003年1月). 「DNAを認識するMyc-MaxとMad-MaxのX線構造.プロトオンコゲン転写因子による制御の分子基盤」. Cell . 112 (2). 米国: 193– 205. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01284-9 . ISSN 0092-8674. PMID 12553908. S2CID 16142388.
さらに読む
- Grandori C, Cowley SM, James LP, Eisenman RN (2001). 「Myc/Max/Madネットワークと細胞行動の転写制御」. Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 16 (1): 653–99 . doi :10.1146/annurev.cellbio.16.1.653. PMID 11031250.
- Lüscher B (2001). 「Myc/Max/Madネットワークの転写因子の機能と制御」. Gene . 277 ( 1– 2): 1– 14. doi :10.1016/S0378-1119(01)00697-7. PMID 11602341.
- Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (1995). 「Mad-Max転写抑制は酵母リプレッサーSin3の哺乳類ホモログとの三元複合体形成を介して起こる」. Cell . 80 (5): 767–76 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . PMID 7889570. S2CID 8749951.
- Edelhoff S, Ayer DE, Zervos AS, et al. (1994). 「MAX相互作用タンパク質の異なるサブファミリーに属する2つの遺伝子のマッピング:MADはヒト2番染色体およびマウス6番染色体へ、MXI1はヒト10番染色体およびマウス19番染色体へ」Oncogene . 9 (2): 665–8 . PMID 8290278.
- Ayer DE, Kretzner L, Eisenman RN (1993). 「Mad:Myc転写活性に拮抗するMaxのヘテロ二量体パートナー」. Cell . 72 (2): 211–22 . doi :10.1016/0092-8674(93)90661-9. PMID 8425218. S2CID 13317223.
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- Laherty CD, Yang WM, Sun JM, et al. (1997). 「mSin3コリプレッサーに関連するヒストン脱アセチル化酵素はmad転写抑制を媒介する」. Cell . 89 (3): 349–56 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80215-9 . PMID 9150134. S2CID 13490886.
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外部リンク