MeRIPseq

MeRIPseq ^[1]（またはMeRIP-seq）は、メチル化 RNA免疫沈降シーケンシングの略で、コーネル大学医学部大学院のサミー・ジャフリー研究室に在籍していたケイト・マイヤーらによって開発された、転写後RNA修飾を検出する手法です。m6A-seqとも呼ばれます。^[2]

MerIP-seq法のバリエーションは、2016年にベンジャミン・デラテとその同僚によって考案されました。hMerIP-seq（ヒドロキシメチルシトシンRNA免疫沈降法）と呼ばれるこのバリエーションでは、ショウジョウバエのin vitro翻訳と脳の発達に影響を与える修飾RNA塩基である5-ヒドロキシメチルシトシンを特異的に認識する抗体を使用します。^[3]

参考文献

^ Meyer, Kate D.; Saletore, Yogesh; Zumbo, Paul; Elemento, Olivier; Mason, Christopher E.; Jaffrey, Samie R. (2012年5月31日). 「mRNAメチル化の包括的解析により、3′ UTRと終止コドン近傍の濃縮が明らかに」. Cell . 149 (7): 1635– 1646. doi :10.1016/j.cell.2012.05.003. PMC 3383396. PMID 22608085 .
^ ダン・ドミニッシーニ;モシッチ・モシュコヴィッツ、シャロン。シュワルツ、シュラーガ。サーモンディヴォン、マリ。ウンガー、リオル。オーセンバーグ、シヴァン。セザーカス、カレン。ジェイコブ・ハーシュ、ジャスミン。アマリリオ、ニネット。クピエツ、マーティン。ソレク、ロテム。レチャヴィ、ギデオン（2012年4月28日）。「m6A-seqによって明らかにされたヒトおよびマウスm6A RNAメチロームのトポロジー」。自然。485 (7397): 201–206。書誌コード:2012Natur.485..201D。土井：10.1038/nature11112. PMID 22575960。S2CID 3517716 。
^ Delatte, Benjamin (2016). 「RNAヒドロキシメチルシトシンのトランスクリプトーム全体にわたる分布と機能」. Science . 351 (6270): 282– 285. Bibcode :2016Sci...351..282D. doi : 10.1126/science.aac5253 . PMID 26816380.

[1] Meyer, Kate D.; Saletore, Yogesh; Zumbo, Paul; Elemento, Olivier; Mason, Christopher E.; Jaffrey, Samie R. (2012年5月31日). 「mRNAメチル化の包括的解析により、3′ UTRと終止コドン近傍の濃縮が明らかに」. Cell . 149 (7): 1635– 1646. doi :10.1016/j.cell.2012.05.003. PMC 3383396. PMID 22608085 .

[2] ダン・ドミニッシーニ;モシッチ・モシュコヴィッツ、シャロン。シュワルツ、シュラーガ。サーモンディヴォン、マリ。ウンガー、リオル。オーセンバーグ、シヴァン。セザーカス、カレン。ジェイコブ・ハーシュ、ジャスミン。アマリリオ、ニネット。クピエツ、マーティン。ソレク、ロテム。レチャヴィ、ギデオン（2012年4月28日）。「m6A-seqによって明らかにされたヒトおよびマウスm6A RNAメチロームのトポロジー」。自然。485 (7397): 201–206。書誌コード:2012Natur.485..201D。土井：10.1038/nature11112. PMID 22575960。S2CID 3517716 。

[3] Delatte, Benjamin (2016). 「RNAヒドロキシメチルシトシンのトランスクリプトーム全体にわたる分布と機能」. Science . 351 (6270): 282– 285. Bibcode :2016Sci...351..282D. doi : 10.1126/science.aac5253 . PMID 26816380.