SPDEF

SPDEF
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2DKX
識別子
エイリアス	SPDEF、PDEF、bA375E1.3、ETS転写因子を含むSAM尖端ドメイン
外部ID	オミム：608144; MGI : 1353422;ホモロジーン: 8231;ジーンカード：SPDEF; OMA :SPDEF - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	染色体6（ヒト）
終わり	34,556,333 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	17番染色体（マウス）
終わり	27,947,929 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	耳下腺; ; 鼻上皮; ; 横行結腸粘膜; ; 前立腺; ; 回腸粘膜; ; 鼻粘膜の嗅覚領域; ; 口腔粘膜細胞; ; 気管; ; S状結腸粘膜; ; 乳管;
	上位の表現
	小腸のリーベルキューン陰窩; ; 胃粘膜; ; 胃上皮; ; 胃の粘液細胞; ; 幽門洞; ; パネートセル; ; 耳下腺; ; 十二指腸; ; 女性の尿道; ; 精嚢;
	より多くの参照表現データ
	; ; ; ;
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	DNA結合転写因子活性; DNA結合; DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的; 配列特異的DNA結合; DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的;
細胞成分	核;
生物学的プロセス	多細胞生物の発達; 細胞分化; 転写の制御、DNAテンプレート; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; 細胞運命決定の負の調節; 肺杯細胞の分化; 腸上皮細胞の発達; 転写、DNAテンプレート; 細胞運命決定の正の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御; アポトーシス過程の正の調節; RNAポリメラーゼIIによる転写の調節;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	25803
	30051
	ENSG00000124664
	ENSMUSG00000024215
	O95238
	Q9WTP3
	NM_001252294 ; NM_012391
	NM_013891 ; NM_001357728
	NP_001239223 ; NP_036523
	NP_038919 ; NP_001344657
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

Protein-coding gene in the species Homo sapiens

SAM尖端ドメイン含有Ets転写因子は、ヒトではSPDEF遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

PDEFは前立腺上皮細胞で発現するETS転写因子であり、アンドロゲン非依存性PSA（MIM 176820）発現転写活性化因子として作用する。[OMIM提供] ^[7]

相互作用

SPDEFはNKX3-1と相互作用することが示されている。^[8]

参考文献

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^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024215 – Ensembl、2017年5月
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さらに読む

Lance V (1976). 「雌コブラNaja najaの年間生殖周期に関する研究。血漿無機イオンの季節変動」比較生化学・生理学誌A, 比較生理学. 53 (3): 285– 289. doi :10.1016/S0300-9629(76)80037-0. PMID 2437.
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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000124664 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000024215 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid10625666-5] Oettgen P, Finger E, Sun Z, Akbarali Y, Thamrongsak U, Boltax J, et al. (2000年1月). 「PDEFは前立腺上皮特異的な新規転写因子であり、アンドロゲン受容体と相互作用して前立腺特異抗原遺伝子の発現を活性化する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (2): 1216– 1225. doi : 10.1074/jbc.275.2.1216 . PMID 10625666.

[pmid6857767-6] Johannessen JV, Finseth I (1983年1月). 「5分でわかる電子顕微鏡写真」.超微細構造病理学. 4 (1): 97– 100. doi :10.3109/01913128309140576. PMID 6857767.

[entrez-7] 「Entrez Gene: SPDEF SAM 尖端ドメインを含む ets 転写因子」。

[pmid11809674-8] Chen H, Nandi AK, Li X, Bieberich CJ (2002年1月). 「NKX-3.1は前立腺由来Ets因子と相互作用し、PSAプロモーターの活性を制御する」. Cancer Research . 62 (2): 338– 340. PMID 11809674.