ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| CADM3 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CADM3、BIgR、IGSF4B、NECL1、Necl-1、TSLL1、synCAM3、細胞接着分子3、CMT2FF |
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| 外部ID | オミム：609743; MGI : 2137858;ホモロジーン: 10919;ジーンカード：CADM3; OMA :CADM3 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| 上位の表現 | - 小脳半球
- 小脳の右半球
- 右前頭葉
- 脛骨神経
- 前帯状皮質
- 側坐核
- ブロードマン領域9
- 前頭前皮質
- 腓骨神経
- 扁桃体
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| | 上位の表現 | - 小脳皮質
- 網膜の神経層
- 上前頭回
- 一次視覚野
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 梨状皮質
- 小脳葉
- 小脳虫部
- 運動ニューロン
- 坐骨神経
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- シグナル伝達受容体結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- 細胞接着分子の結合
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 細胞接合
- 細胞膜
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞間接合
- 平行線維からプルキンエ細胞へのシナプス
- シナプス前膜の不可欠な構成要素
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質の局在
- 細胞膜細胞接着分子を介した異好性細胞間接着
- 細胞接着
- 細胞認識
- 接着結合組織
- 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着
| | 出典：Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_021189
NM_001127173
NM_001346510 |
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| RefSeq（タンパク質） | |
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NP_001120645
NP_001333439
NP_067012 |
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| 場所（UCSC） | 1章: 159.17 – 159.2 Mb | 1章: 173.16 – 173.2 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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細胞接着分子3は、ヒトではCADM3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
IGSF4Bは、カルシウム非依存性細胞間接着分子であるネクチンに関連する脳特異的タンパク質である（PVRL3; MIM 607147参照）（Kakunaga et al., 2005）。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000162706 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000005338 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Fukuhara H, Kuramochi M, Nobukuni T, Fukami T, Saino M, Maruyama T, Nomura S, Sekiya T, Murakami Y (2001年9月). 「腫瘍抑制因子TSLC1遺伝子ファミリーに属する膜貫通タンパク質をコードするTSLL1およびTSLL2遺伝子の単離」. Oncogene . 20 (38): 5401–7 . doi :10.1038/sj.onc.1204696. PMID 11536053. S2CID 6564286.
- ^ ab 「Entrez Gene: CADM3 細胞接着分子 3」。
外部リンク
さらに読む
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 新貝 剛志、池田 渉、角永 誠、他 (2003). 「ネクチン様分子-2/IGSF4/RA175/SgIGSF/TSLC1/SynCAM1の細胞間接着および上皮細胞における膜タンパク質局在への関与」J. Biol. Chem . 278 (37): 35421–7 . doi : 10.1074/jbc.M305387200 . PMID 12826663.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ（SPDI）：新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質の同定に向けた大規模取り組み：バイオインフォマティクスによる評価」Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 .
- Fukami T, Satoh H, Williams YN, et al. (2004). 「ヒトTSLC1様遺伝子1および2（TSLL1およびTSLL2）の相同遺伝子であるマウスTsll1およびTsll2遺伝子の単離」Gene . 323 : 11–8 . doi :10.1016/j.gene.2003.09.018. PMID 14659875.
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Zhang Z, Henzel WJ (2005). 「実験的に検証された切断部位の解析に基づくシグナルペプチド予測」. Protein Sci . 13 (10): 2819–24 . doi :10.1110/ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161 .
- 角永 聡、池田 渉、伊藤 誠、他 (2005). 「ネクチン様分子-1/TSLL1/SynCAM3：シナプス前神経終末、軸索、グリア細胞突起の非接合部接触部位に局在する神経組織特異的免疫グロブリン様細胞間接着分子」J. Cell Sci . 118 (Pt 6): 1267–77 . doi :10.1242/jcs.01656. PMID 15741237. S2CID 18949720.
- Zhou Y, Du G, Hu X, et al. (2005). 「ネクチン様分子1はタンパク質4.1N関連タンパク質であり、タンパク質4.1Nを細胞質から細胞膜へリクルートする」Biochim. Biophys. Acta . 1669 (2): 142– 54. doi :10.1016/j.bbamem.2005.01.013. PMID 15893517.
- Dong X, Xu F, Gong Y, et al. (2006). 「神経組織特異的免疫グロブリン様細胞間接着分子であるヒトネクチン様分子-1/Syncam3/Tsll1/Igsf4bのVドメインの結晶構造」J. Biol. Chem . 281 (15): 10610–7 . doi : 10.1074/jbc.M513459200 . PMID 16467305.
- Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). 「ヒト染色体1のDNA配列と生物学的アノテーション」. Nature . 441 (7091): 315–21 . Bibcode :2006Natur.441..315G. doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414.
