細胞の接着に関与するタンパク質
| CADM1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CADM1、BL2、IGSF4、IGSF4A、NECL2、Necl-2、RA175、ST17、SYNCAM、TSLC1、sTSLC-1、sgIGSF、synCAM1、細胞接着分子1 |
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| 外部ID | オミム:605686; MGI : 1889272;ホモロジーン: 8641;ジーンカード:CADM1; OMA :CADM1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9|9 A5.3 | 始める | 47,530,173 bp [2] |
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| 終わり | 47,858,115 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 小脳の傍小葉
- 橋
- 歯周繊維
- アキレス腱
- 精巣上体頭
- 脳梁
- 臓側胸膜
- ランゲルハンス島
- 脊髄神経節
- ベータ細胞
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| | 上位の表現 | - 水晶体上皮
- 耳板
- 毛様体
- 鉤状部
- 耳小胞
- 虹彩
- CA3領域
- 球形嚢
- 網膜の神経層
- 扁桃体
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- PDZドメイン結合
- タンパク質ホモ二量体化活性
- タンパク質結合
- シグナル伝達受容体結合
- 細胞接着分子の結合
| | 細胞成分 |
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞間接合
- シナプス
- 細胞膜の不可欠な構成要素
- 細胞接合
- 基底外側細胞膜
- 細胞膜
| | 生物学的プロセス |
- 細胞分化
- 細胞膜細胞接着分子を介した異好性細胞間接着
- 活性化T細胞の増殖
- 免疫システムのプロセス
- 多細胞生物の発達
- 細胞接着
- 精子形成
- 接着結合組織
- T細胞を介した細胞傷害
- 細胞膜接着分子を介した同種親和性細胞接着
- アポトーシス過程
- ナチュラルキラー細胞を介した細胞傷害に対する感受性
- ナチュラルキラー細胞を介した細胞傷害の正の制御
- 刺激の検出
- 細胞認識
- ウイルスプロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001098517 NM_001301043 NM_001301044 NM_001301045 NM_014333 |
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NM_001025600 NM_018770 NM_207675 NM_207676 NM_001310841 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001091987 NP_001287972 NP_001287973 NP_001287974 NP_055148 |
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NP_001020771 NP_001297770 NP_061240 NP_997558 NP_997559 |
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| 場所(UCSC) | 11章: 115.17 – 115.5 Mb | 9章: 47.53 – 47.86 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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細胞接着分子1は、ヒトではCADM1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
相互作用
細胞接着分子1はEPB41L3と相互作用することが示されている。[7]
関連研究
ゲノムワイド関連研究では、体格指数とCADM1およびCADM2遺伝子付近の2つの遺伝子座との関連が特定されました。[8]別の研究の実験結果では、肥満マウスはCADM1およびCADM2遺伝子 の両方が過剰発現しており、 CADM1の喪失はマウスを肥満から保護し、負のエネルギーバランスと体重減少を促進することが示されました。[9]
さらに、2019年のGWAS研究では、神経性無食欲症とCADM1の関連が明らかになりました。[10]
脳では、この遺伝子はシナプス組み立てを媒介し、CADM1の変異は自閉症スペクトラム障害とも関連しています。 [11]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000182985 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032076 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 五明英、新井裕、谷上亜、村上裕、服部正人、細田文、新井和、相川裕、津田英、広橋信、浅川信、清水直、添田英、榊裕、大木正 (2000年2月)。 「染色体 11q23.2 の LOH 領域にある 2 Mb 配列対応コンティグ マップと新規免疫グロブリン スーパーファミリー遺伝子 IGSF4」。ゲノミクス。62 (2): 139–46 .土井:10.1006/geno.1999.6001。PMID 10610705。
- ^ 「Entrez Gene: CADM1 細胞接着分子 1」。
- ^ ヤゲタ、ミカ;倉持雅美;増田マリ;深見武士;福原寛;丸山智子;渋谷雅章。村上よしのり(2002年9月)。 「肺がんにおける 2 つの異なる腫瘍抑制タンパク質である TSLC1 と DAL-1 の直接的な関連」。がん研究所62 ( 18): 5129–33。ISSN 0008-5472 。PMID 12234973。
- ^ Speliotes EK, Willer CJ, Berndt SI, Monda KL, Thorleifsson G, Jackson AU, et al. (2010年11月). 「249,796人の関連解析により、BMIに関連する18の新たな遺伝子座が明らかに」Nature Genetics . 42 (11): 937–48 . doi :10.1038/ng.686. PMC 3014648. PMID 20935630 .
- ^ Rathjen T, Yan X, Kononenko NL, Ku MC, Song K, Ferrarese L, et al. (2017年8月). 「神経細胞接着分子1による体重およびエネルギー恒常性の調節」. Nature Neuroscience . 20 (8): 1096– 1103. doi :10.1038/nn.4590. PMC 5533218. PMID 28628102 .
- ^ Watson HJ, Yilmaz Z, Thornton LM, Hübel C, Coleman JR, Gaspar HA, et al. (2019年8月). 「ゲノムワイド関連研究により8つのリスク遺伝子座が特定され、神経性食欲不振症の代謝精神医学的起源が示唆される」Nature Genetics . 51 (8): 1207– 1214. doi :10.1038/s41588-019-0439-2. PMC 6779477. PMID 31308545 .
- ^ Fujita E, Tanabe Y, Imhof BA, Momoi MY, Momoi T (2012年12月). 「自閉症スペクトラム障害関連分子であるシナプス接着分子CADM1と小脳におけるMUPP1の複合体」J Neurochem . 123 (5): 886– 94. doi : 10.1111/jnc.12022 . PMID 22994563.
さらに読む
- 渡部 功、伊藤 暁、駒 勇、北村 雄一 (2004). 「IGSF4:多様な機能からTSLC1、SgIGSF、SynCAMの3つの名前で呼ばれる新規細胞間接着分子」Histol. Histopathol . 18 (4): 1321–9 . PMID 12973698.
- 倉持 正之、福原 秀、信國 孝文、他 (2001). 「TSLC1はヒト非小細胞肺癌における腫瘍抑制遺伝子である」(PDF) . Nat. Genet . 27 (4): 427–30 . doi :10.1038/86934. hdl : 2241/1028 . PMID 11279526. S2CID 9773234.
- 増田 正之、矢下 正之、福原 秀一、他 (2002). 「腫瘍抑制タンパク質TSLC1は細胞間接着に関与する」J. Biol. Chem . 277 (34): 31014–9 . doi : 10.1074/jbc.M203620200 . PMID 12050160.
- 福原 秀治、倉持 正治、深見 剛志、他 (2003). 「TSLC1のプロモーター領域のメチル化とヒト前立腺癌におけるその遺伝子産物による腫瘍抑制」. Jpn. J. Cancer Res . 93 (6): 605–9 . doi :10.1111/j.1349-7006.2002.tb01297.x. PMC 5927049. PMID 12079507 .
- Allinen M, Peri L, Kujala S, et al. (2002). 「乳がんにおける11q21-24ヘテロ接合性欠失候補標的遺伝子の解析:TSLC1プロモーター領域の高メチル化の兆候」Genes Chromosomes Cancer . 34 (4): 384–9 . doi :10.1002/gcc.10079. PMID 12112527. S2CID 396701.
- Biederer T, Sara Y, Mozhayeva M, et al. (2002). 「SynCAM:シナプス形成を促進するシナプス接着分子」. Science . 297 (5586): 1525–31 . Bibcode :2002Sci...297.1525B. doi :10.1126/science.1072356. PMID: 12202822 . S2CID :14529914.
- Yageta M, Kuramochi M, Masuda M, et al. (2002). 「肺癌における2つの異なる腫瘍抑制タンパク質TSLC1とDAL-1の直接的な関連性」Cancer Res . 62 (18): 5129–33 . PMID 12234973.
- Jansen M, Fukui, Rosty C, et al. (2003). 「TSLC1の5' CpGアイランドの異常メチル化は膵管腺癌でよく見られ、高悪性度PanlNで初めて発現する」. Cancer Biol. Ther . 1 (3): 293–6 . doi : 10.4161/cbt.84 . PMID 12432281.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 本田 剛志、田村 剛志、脇 剛志、他 (2003). 「原発性胃癌および胃癌細胞株におけるTSLC1遺伝子プロモーターの高メチル化」. Jpn. J. Cancer Res . 93 (8): 857–60 . doi : 10.1111 /j.1349-7006.2002.tb01329.x. PMC 5927103. PMID 12716461 .
- 新貝 剛志、池田 渉、角永 誠、他 (2003). 「ネクチン様分子-2/IGSF4/RA175/SgIGSF/TSLC1/SynCAM1の細胞間接着および上皮細胞における膜タンパク質局在への関与」J. Biol. Chem . 278 (37): 35421–7 . doi : 10.1074/jbc.M305387200 . PMID 12826663.
- 伊藤 明、岡田 正之、内野 健、他 (2003). 「肺上皮におけるTSLC1接着分子の発現と細気管支肺胞癌以外の肺腺癌におけるそのダウンレギュレーション」. Lab. Invest . 83 (8): 1175–83 . doi : 10.1097/01.LAB.0000081391.28136.80 . PMID 12920246.
- 深見 剛志、福原 秀、倉持 正治、他 (2003). 「進行肺腫瘍および様々な癌細胞株におけるTSLC1遺伝子のプロモーター領域のメチル化」. Int. J. Cancer . 107 (1): 53–9 . doi : 10.1002/ijc.11348 . PMID 12925956. S2CID 26363429.
- 内野 健、伊藤 明、若山 剛、他 (2003). 「肺腺癌における腫瘍抑制遺伝子TSLC1の臨床的意義と予後予測意義」. Cancer . 98 (5): 1002–7 . doi : 10.1002/cncr.11599 . PMID 12942568. S2CID 35242800.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ(SPDI):新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質同定のための大規模取り組み:バイオインフォマティクスによる評価」Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 .
- Fukuhara H, Masuda M, Yageta M, et al. (2003). 「肺腫瘍抑制因子TSLC1と、ショウジョウバエ腫瘍抑制因子DlgのヒトホモログであるMPP3との関連性」. Oncogene . 22 (40): 6160–5 . doi : 10.1038/sj.onc.1206744 . PMID 13679854.
- 伊藤 剛志、島田 雄志、橋本 雄志、他 (2003). 「食道扁平上皮癌の進行におけるTSLC1の関与」. Cancer Res . 63 (19): 6320–6 . PMID 14559819.
- Mao X, Seidlitz E, Ghosh K, et al. (2004). 「非小細胞肺癌におけるTSLC1の腫瘍抑制活性には細胞質ドメインが重要である」Cancer Res . 63 (22): 7979–85 . PMID 14633730.