ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| OBSL1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2CPC、2E6P、2E6Q、2LU7、2LVC、2WP3、2WWK、2WWM、3KNB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | OBSL1、オブスキュリン様1、オブスキュリン様細胞骨格アダプター1 |
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| 外部ID | オミム:610991; MGI : 2138628;ホモロジーン: 28013;ジーンカード:OBSL1; OMA :OBSL1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 C4 | 始める | 75,455,954 bp [2] |
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| 終わり | 75,483,096 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 右精巣
- 左精巣
- 左卵巣
- 右卵巣
- 甲状腺の右葉
- 甲状腺の左葉
- 右副腎皮質
- 右卵管
- 心臓の頂点
- 小脳の右半球
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| | 上位の表現 | - 卵黄嚢
- 内頸動脈
- 外頸動脈
- 窩
- 太ももの筋肉
- 顆状突起
- 精管
- 腎小体
- 性器結節
- 髄質集合管
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 細胞骨格アンカー活性
- タンパク質結合
- 筋肉の構造成分
- アクチンフィラメント結合
- 筋肉のα-アクチニン結合
- 弾力性を付与する構造分子の活性
| | 細胞成分 |
- Z ディスクカック
- 3Mコンプレックス
- 介在板
- Mバンド
- 中心体
- 微小管形成中心
- 細胞骨格
- 細胞質
- ゴルジ体
- 細胞質の核周囲領域
- 筋ミオシン複合体
- 細胞質
- 横紋筋の細いフィラメント
- 筋節
| | 生物学的プロセス |
- ゴルジ体へのタンパク質の局在
- 心筋原線維集合体
- 微小管細胞骨格組織
- 細胞骨格の組織
- 有糸分裂核分裂の調節
- 樹状突起形態形成の正の調節
- ゴルジ体
- 横紋筋の収縮
- アクチンフィラメントの組織化
- サルコメア組織
- 横紋筋ミオシン太いフィラメント集合体
- 翻訳後タンパク質修飾
- 筋肉の収縮
- 骨格筋の細いフィラメント集合体
- 骨格筋ミオシン太いフィラメントの集合体
- 心筋組織の形態形成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001173408 NM_001173431 NM_015311 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001166879 NP_001166902 NP_056126 |
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NP_001297608 NP_849215 NP_001390042 NP_001390043 |
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| 場所(UCSC) | 2章: 219.55 – 219.57 Mb | 1章: 75.46 – 75.48 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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オブスキュリン様タンパク質1は、ヒトではOBSL1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000124006 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026211 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 石川 功、永瀬 剛、須山 正之、宮島 暢、田中 明、小谷 秀、野村 暢、小原 修 (1998年12月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. X. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」. DNA Res . 5 (3): 169–76 . doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811.
- ^ 「Entrez遺伝子:OBSL1オブスキュリン様1」。
さらに読む
- 中島大将、岡崎直人、山川博司、他(2003年)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Geisler SB, Robinson D, Hauringa M, et al. (2007). 「オブスキュリン様タンパク質1(OBSL1)はオブスキュリンに関連する新規細胞骨格タンパク質である」. Genomics . 89 (4): 521–31 . doi :10.1016/j.ygeno.2006.12.004. PMC 1885211. PMID 17289344 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID 9110174.
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
外部リンク
- GeneReviews/NIH/NCBI/UW の 3-M 症候群に関するエントリー
- 3-M症候群に関するOMIMエントリ
- PDBe-KBは、ヒトオブスキュリン様タンパク質1(OBSL1)のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。