OSR1
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
OSR1
識別子
エイリアスOSR1、ODD、奇数スキップ関連転写因子1、奇数スキップ関連転写因子1
外部IDオミム：608891; MGI : 1344424;ホモロジーン: 8035;ジーンカード：OSR1; OMA :OSR1 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

130497

23967

アンサンブル

ENSG00000143867

ENSMUSG00000048387

ユニプロット

Q8TAX0

Q9WVG7

RefSeq (mRNA)

NM_145260

NM_011859

RefSeq（タンパク質）

NP_660303

NP_035989

場所（UCSC）2章: 19.35 – 19.36 Mb12章: 9.62 – 9.63 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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タンパク質オッドスキップ関連1は、ヒトではOSR1遺伝子によってコードされる転写因子である。[5] [6] [7] OSR1およびOSR2転写因子は、腎臓などの体の部分の正常な発達に関与している。[8]

タンパク質odd-skipped related 1は、ジンクフィンガー転写因子であり、ヒトでは第2染色体（2p24.1）に位置するOSR1遺伝子によって、マウスではOsr1遺伝子によってコードされています。哺乳類において、OSR1は腎臓、心臓、口蓋の発生に関与しており、しばしばOSR2と共発現します。OSR1とOSR2は、ショウジョウバエのodd-skippedクラス転写因子と相同性があり、 odd [ 5] 、 bowl [9]、sob [ 10]、arm [11]によってコードされています。

構造

OSR1は266アミノ酸からなるタンパク質で、3つのC2H2ジンクフィンガードメインを含んでいます。[ 12 ] OSR1とOSR2はアミノ酸配列が65%、ジンクフィンガードメインが98%の類似性を持っています。[ 13]

関数

早期発現

マウスでは、胚発生7.5日目の胚葉形成期に、中間中胚葉となる運命の細胞がマウスOSR1ホモログであるOsr1の発現を示す。翌日には、神経板の側方に位置する中間中胚葉で発現が見られる。Osr1の発現は9.5日目までに弱まり、後方の予定腎臓へと移行する。10.5日目には、鰓弓と肢でもOsr1の発現が始まる。[12] [14]

心臓の発達

Odd1遺伝子に標的ヌル変異を持つマウスは、Odd1が心臓および中間中胚葉の発達に必須であることを示している。[15] Osr1は心臓の心房中隔形成を制御する。Osr1は、一次心房中隔が出現する背側心房壁で発現し、後に中隔および左静脈弁尖でも発現する。[14]また、胸腔の中皮および壁側心膜にも存在する。[14] Osr1発現を欠く胚は、通常、房室接合部の変形および静脈弁の形成不全のために出生前に死亡し、満期まで進んだ胚でも壁側心膜が不完全である。[14]これらの病理は、Nkx2.5、Pitx2、Tbx5などの心房中隔形成に重要な他の転写因子の存在下で発生する。[14]第二心野におけるOsr1の欠損は、心房中隔の欠如を実証した。また、Osr1は第二心野におけるTbx5の直接的な下流標的であり、心房中隔形成に必要なHhシグナル伝達と並行するTbx5-Osr1経路を確立することが実証されている。[16] Osr1はTbx5と相互作用し、心房中隔形成における第二心野後部の細胞周期進行を制御することもできる。[17]

腎臓の発達

Osr1 は、生殖腺と腎臓を形成する中間中胚葉の最も初期のマーカーである。この発現は中間中胚葉の形成には必須ではないが、腎臓と生殖腺構造への分化に必須である。[14] [18] Osr1 は、初期の泌尿生殖器の発達に関与する転写因子Lhx1、Pax2 、およびWt1の上流で作用し、これらの発現を引き起こす。 [14]正常な腎臓の発達では、 Pax2-Eya1-Hox11 複合体の活性化とそれに続くSix2およびGdnf発現の活性化により、尿管芽の分岐とネフロンを形成する帽間葉の維持が可能になる。[19] Six2 は帽間葉の自己複製状態を維持する。[20]そしてGdnf は、 Gdnf-Ret シグナル伝達経路を介して、成長中の尿管芽の誘引と分岐に必要である。[21] 発達中の腎臓において、Osr1発現細胞はメサンギウム細胞、周皮細胞、尿管平滑筋、腎被膜へと分化します。Osr1発現細胞が分化する細胞種は、発現喪失のタイミングによって決定されます。血管系または尿管上皮細胞となる細胞はOsr1の発現を早期（E8.5）に喪失し、ネフロンとなる細胞は後期（E11.5）に発現を失います。[22] Osr1発現欠損マウスでは、腎臓形成の3段階すべてが影響を受け、 Wt1およびPax2発現が低下したマウスと類似しています。つまり、ウォルフ管に異常があり、中腎尿細管の数が少なく、腎臓を形成する後腎と生殖腺が欠損しています。[14]胎生10.5日目にOsr1の発現を欠く胚は、未圧縮中腎間葉へ移動する尿管芽を成長させることができない。[14]尿管芽からの誘導シグナルの欠如と下流のPax2発現の減少が組み合わさり、腎臓のアポトーシスと無形成を引き起こす。[14]

四肢形成

肢芽におけるOsr1の発現は、最初は内胚葉のすぐ下にある間葉系に限られているが、胎生 11.5 日目までに前方および近位に移動する。[12]マウスでは、肢の発達中にOsr1 は趾間間葉系[12]および予定滑膜関節で発現する。[23]ここで、Osr1は関節形成の初期マーカーであるGdf5の発現と重複する。 [24]マウス胎生肢筋結合組織細胞は転写因子 Osr1 を発現し、in vivo および in vitro で線維形成細胞および脂肪形成細胞に分化し、胚性線維脂肪前駆細胞 (FAP) 様集団を定義する。遺伝子系統追跡により、発生中の Osr1+ 細胞が成人 FAP のサブセットを生じることが示されている。 Osr1機能の喪失は筋原細胞の増殖と生存の減少につながり、四肢の筋肉のパターン形成異常を引き起こす。[25]

癌

OSR1の発現は、正常肺組織よりも肺癌組織で低下しており、分化不良と相関していた。OSR1は、SOX9とβ-カテニンの発現を抑制することで、Wntシグナル伝達経路の活性をダウンレギュレーションすることができる。[26] OSR1の発現は、隣接する正常組織と比較して、原発性胃癌組織ではmRNAレベルとタンパク質レベルの両方で有意にダウンレギュレーションされている。胃癌において、OSR1はp53の転写活性化とTCF/LEFの抑制を介して機能的な腫瘍抑制因子として機能する。[27] OSR1の発現は原発性腎細胞癌でダウンレギュレーションされており、組織学的悪性度と負の相関関係にあった。OSR1のダウンレギュレーションは、腎細胞癌の潜在的な予後マーカーおよび治療標的となる可能性がある。

その他のサイト

Osr1は、第一および第二鰓弓、肢芽、口および鼻窩、体幹、前脳で発現しています。[12]発達中の体節、遠位下顎骨、発達中の眼で発現しています。[13]

規制

Osr1の発現はRunx2とIkzf1によって負に制御される。これらの遺伝子は、 Osr1プロモーター領域との相互作用を通じて、骨芽細胞およびリンパ球の分化に関与する。[28]ヒト骨芽細胞および骨肉腫細胞株において、OSR1は1,25-ジヒドロキシビタミンD3によって直接誘導される。 [ 29]

臨床的関連性

変異アレルによる腎臓サイズの縮小

機能的な転写産物を生成しない変異型ヒトOSR1アレルは、白人集団の6％に見られ、新生児の腎臓の大きさを11.8％減少させる。 [30]

癌におけるOSR1メチル化

OSR1は、胃癌細胞および組織の51.8%でメチル化され、ダウンレギュレーションされている。[31]正常に発現している場合、OSR1は抗増殖性であり、胃癌細胞において細胞周期停止を誘導し、アポトーシスを誘導する。[31] OSR1は、扁平上皮癌の85%以上でメチル化されている。[32] >

オーソログ

モデル生物における OSR1相同遺伝子
生物 遺伝子 関数
ひよこ cOsr1 中間板中胚葉と側板中胚葉、心臓の静脈洞、上顎骨と下顎骨の突起、眼と四肢の発達中に発現する。[23]
アフリカツメガエル XOsr 中間中胚葉で発現し、前腎形成に必要である。[33]
ゼブラフィッシュ （Danio rerio） zOsr 前腎形成。zOsrの発現低下は、腎上皮ナトリウム-グルコース共輸送体およびナトリウム-カリウム-塩素共輸送体遺伝子の発現低下をもたらす。[33]
D.melanogasterショウジョウバエ 奇妙な、ボウル、すすり泣き 胚盤葉期には7本の縞模様で発現し、胚葉形成期には7本の一次縞に加え、交互の節に現れる二次縞が出現する。これにより、拡張胚帯の各節が標識される。また、胚においては、腸管の特定の領域、前胃に関連するガーランド細胞、心膜細胞、心臓に関連するリンパ腺、中枢神経系の細胞サブセット、および特定の掌節にも発現する。第1～4趾節を除く各予定脚節の遠位端にある脚盤において、節状に繰り返されるパターンで発現する。[34] [35] [36]
線虫（Caenorhabditis elegans） 奇数1、奇数2 ヒトOSR1（奇数スキップ関連転写因子1）およびOSR2（奇数スキップ関連転写因子2）の相同遺伝子である。RNAポリメラーゼII調節領域配列特異的なDNA結合活性を有すると予測される。腸管で発現する。[37]

参照

OSR2（遺伝子）

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000143867 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000048387 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ ab Coulter DE, Swaykus EA, Beran-Koehn MA, Goldberg D, Wieschaus E, Schedl P (1990年11月). 「新規ペアルール発現パターンを有するジンクフィンガー遺伝子をコードするodd-skippedの分子解析」. The EMBO Journal . 9 (11): 3795–804 . doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb07593.x. PMC 552139. PMID 2120051  . 
  6. ^ Katoh M (2002年8月). 「ヒト染色体2p24におけるOSR1の分子クローニングと特性解析」. International Journal of Molecular Medicine . 10 (2): 221–5 . doi :10.3892/ijmm.10.2.221. PMID  12119563.
  7. ^ 「Entrez遺伝子：OSR1 odd-skipped related 1（ショウジョウバエ）」。
  8. ^ Zhang Z, Iglesias D, Eliopoulos N, El Kares R, Chu L, Romagnani P, Goodyer P (2011年11月). 「腎前駆細胞におけるOSR1 mRNA発現を阻害する変異OSR1アレルは、新生児の腎臓のサイズと機能の低下と関連する」. Human Molecular Genetics . 20 (21): 4167–74 . doi :10.1093/hmg/ddr341. PMID  21821672.
  9. ^ Hart MC, Wang L, Coulter DE (1996). 「ショウジョウバエにおける新しいジンクフィンガータンパク質ファミリーをコードするodd-skipped遺伝子と2つの関連遺伝子の構造と発現の比較」Genetics . 144 (1): 171–82 . doi :10.1093/genetics/144.1.171. PMC 1207491. PMID  8878683 . 
  10. ^ Green RB, Hatini V, Johansen KA, Liu XJ, Lengyel JA (2002). 「ドラムスティックは、ショウジョウバエ後腸のパターン形成と形態形成を制御するためにLinesに拮抗するジンクフィンガータンパク質である」. Development . 129 (15): 3645–56 . doi :10.1242/dev.129.15.3645. PMID  12117814.
  11. ^ Wang L, Coulter DE (1996). 「奇数スキップホモログであるbowelは、ショウジョウバエの胚発生における終末経路で機能する」. The EMBO Journal . 15 (12): 3182–96 . doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00681.x. PMC 450261. PMID  8670819 . 
  12. ^ abcde So PL, Danielian PS (1999). 「ショウジョウバエのodd-skippedに関連するマウス遺伝子のクローニングと発現解析」.発達機構. 84 ( 1– 2): 157– 60. doi : 10.1016/s0925-4773(99)00058-1 . PMID  10473132. S2CID  18447231.
  13. ^ ab Lan Y, Kingsley PD, Cho ES, Jiang R (2001). 「ショウジョウバエのodd-skippedに関連する新規マウス遺伝子Osr2は、頭蓋顔面、四肢、腎臓の発達において動的な発現パターンを示す」.発達のメカニズム. 107 ( 1– 2): 175– 9. doi :10.1016/s0925-4773(01)00457-9. PMID  11520675. S2CID  14286470.
  14. ^ abcdefghij Wang Q, Lan Y, Cho ES, Maltby KM, Jiang R (2005). 「Odd-skipped related 1 (Odd 1) は心臓および泌尿生殖器の発達に必須の調節因子である」. Developmental Biology . 288 (2): 582–94 . doi :10.1016/j.ydbio.2005.09.024. PMC 3869089. PMID 16223478  . 
  15. ^ 発生生物学 288 (2005) 582 – 594
  16. ^ Xie L, Hoffmann AD, Burnicka-Turek O, Friedland-Little JM, Zhang K, Moskowitz IP (2012年8月). 「Tbx5-hedgehog分子ネットワークは心房中隔形成における第二心臓野に必須である」. Developmental Cell . 23 (2): 280–91 . doi :10.1016/j.devcel.2012.06.006. PMC 3912192. PMID 22898775  . 
  17. ^ Zhou L, Liu J, Olson P, Zhang K, Wynne J, Xie L (2015年8月). 「Tbx5とOsr1の相互作用は、心室中隔形成における後部第二心野の細胞周期進行を制御する」. Journal of Molecular and Cellular Cardiology . 85 : 1–12 . doi :10.1016/j.yjmcc.2015.05.005. PMC 4530064. PMID 25986147  . 
  18. ^ James RG, Kamei CN, Wang Q, Jiang R, Schultheiss TM (2006). 「Odd-skipped related 1は後腎の発達に必須であり、腎前駆細胞の形成と分化を制御する」. Development . 133 (15): 2995– 3004. doi : 10.1242/dev.02442 . PMID  16790474.
  19. ^ Gong KQ, Yallowitz AR, Sun H, Dressler GR, Wellik DM (2007). 「Hox-Eya-Pax複合体は腎臓の初期発達における遺伝子発現を制御する」. Molecular and Cellular Biology . 27 (21): 7661–8 . doi :10.1128/MCB.00465-07. PMC 2169072. PMID 17785448  . 
  20. ^ Self M, Lagutin OV, Bowling B, Hendrix J, Cai Y, Dressler GR, Oliver G (2006). 「発達中の腎臓における腎形成および前駆細胞再生の抑制にはSix2が必要である」. The EMBO Journal . 25 (21): 5214–28 . doi :10.1038/sj.emboj.7601381. PMC 1630416. PMID 17036046  . 
  21. ^ Costantini F (2006). 「腎臓の分岐形態形成：概念、疑問、そして最近の進歩」.分化; 生物多様性研究. 74 (7): 402–21 . doi :10.1111/j.1432-0436.2006.00106.x. PMID  16916378.
  22. ^ Mugford JW, Sipilä P, McMahon JA, McMahon AP (2008). 「Osr1の発現は、哺乳類の腎臓において、Osr1依存性ネフロン前駆細胞区画への漸進的な制限を受ける中間中胚葉の多能性集団を画定する」Developmental Biology . 324 (1): 88– 98. doi :10.1016/j.ydbio.2008.09.010. PMC 2642884 . PMID  18835385. 
  23. ^ ab Stricker S, Brieske N, Haupt J, Mundlos S (2006). 「ニワトリ胚発生における奇数スキップ関連遺伝子Osr1およびOsr2の比較発現パターン」.遺伝子発現パターン. 6 (8): 826–34 . doi :10.1016/j.modgep.2006.02.003. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8395-5 . PMID  16554187.
  24. ^ Gao Y, Lan Y, Liu H, Jiang R (2011). 「ジンクフィンガー転写因子Osr1とOsr2は滑膜関節の形成を制御する」. Developmental Biology . 352 (1): 83– 91. doi :10.1016/j.ydbio.2011.01.018. PMC 3057278. PMID 21262216  . 
  25. ^ Vallecillo-García, P., Orgeur, M., vom Hofe-Schneider, S. et al. Odd skipped-related 1は、四肢発達中の筋形成を制御する胚性線維脂肪前駆細胞集団を同定する。Nat Commun 8, 1218 (2017).
  26. ^ Wang Y, Lei L, Zheng YW, Zhang L, Li ZH, Shen HY, Jiang GY, Zhang XP, Wang EH, Xu HT (2018年6月). 「Odd-skipped related 1はSOX9とβ-カテニンの抑制を介してWntシグナルを減少させ、肺癌の増殖と浸潤を阻害する」. Cancer Science . 109 (6): 1799– 1810. doi :10.1111/cas.13614. PMC 5989870. PMID  29660200 . 
  27. ^ Otani K, Dong Y, Li X, Lu J, Zhang N, Xu L, Go MY, Ng EK, Arakawa T, Chan FK, Sung JJ, Yu J (2014年11月). 「Odd-skipped related 1は新規腫瘍抑制遺伝子であり、胃癌における潜在的な予後バイオマーカーである」. The Journal of Pathology . 234 (3): 302–15 . doi :10.1002/path.4391. PMC 4277686. PMID 24931004  . 
  28. ^ 山内 正之、河合 誠、加藤 剛志、大島 剛志、天野 明 (2008). 「Odd-skipped related 1遺伝子の発現はRunx2とIkzf1転写因子によって制御される」. Gene . 426 ( 1– 2): 81– 90. doi :10.1016/j.gene.2008.08.015. PMID  18804520.
  29. ^ Verlinden L, Kriebitzsch C, Eelen G, Van Camp M, Leyssens C, Tan BK, Beullens I, Verstuyf A (2013). 「奇数スキップ関連遺伝子Osr1およびOsr2は1,25-ジヒドロキシビタミンD3によって誘導される」. The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology . 136 : 94–7 . doi :10.1016/j.jsbmb.2012.12.001. PMID  23238298. S2CID  206498738.
  30. ^ Zhang Z, Iglesias D, Eliopoulos N, El Kares R, Chu L, Romagnani P, Goodyer P (2011). 「腎前駆細胞におけるOSR1 mRNA発現を阻害する変異OSR1アレルは、新生児の腎臓のサイズと機能の低下と関連する」. Human Molecular Genetics . 20 (21): 4167–74 . doi :10.1093/hmg/ddr341. PMID  21821672.
  31. ^ ab Otani K, Dong Y, Li X, Lu J, Zhang N, Xu L, Go MY, Ng EK, Arakawa T, Chan FK, Sung JJ, Yu J (2014). 「Odd-skipped related 1は新規腫瘍抑制遺伝子であり、胃癌における潜在的な予後バイオマーカーである」. The Journal of Pathology . 234 (3): 302–15 . doi :10.1002/path.4391. PMC 4277686. PMID 24931004  . 
  32. ^ Rauch TA, Wang Z, Wu X, Kernstine KH, Riggs AD, Pfeifer GP (2012). 「肺がんにおけるDNAメチル化バイオマーカー」.腫瘍生物学. 33 (2): 287–96 . doi :10.1007/s13277-011-0282-2. PMID  22143938. S2CID  15200709.
  33. ^ ab テナ JJ、ネト A、デ・ラ・カジェ＝ムスティネス E、ブラス＝ペレイラ C、カサレス F、ゴメス＝スカルメタ JL (2007)。 「奇数スキップ遺伝子は、腎臓の発達を制御するリプレッサーをコードしている。」開発バイオル。301 (2): 518–31 .土井:10.1016/j.ydbio.2006.08.063。PMID  17011543。
  34. ^ Dev Biol. 2003 11 15;263(2):282-95。
  35. ^ 発達のメカニズム 第96巻 第2号 2000年9月 233-236ページ
  36. ^ EMBO J. 1990年11月;9(11):3795-804.
  37. ^ ワームベース

さらに読む

  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000年11月). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」. Genome Research . 10 (11): 1788–95 . doi :10.1101/gr.143000. PMC  310948. PMID  11076863 .
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000年9月). 「大規模cDNAシークエンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」. EMBO Reports . 1 (3): 287–92 . doi :10.1093/embo-reports/kvd058. PMC  1083732. PMID  11256614 .
  • Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 (10B): 2136–44 .土井:10.1101/gr.2576704。PMC  528930。PMID  15489336。
  • Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (2005年3月). 「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」. Science . 307 (5715): 1621–5 . Bibcode :2005Sci...307.1621B. doi :10.1126/science.11​​05776. PMID:  15761153. S2CID  : 39457788.
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (2006年1月). 「LIFEdbデータベース 2006」. Nucleic Acids Research . 34 (データベース号): D415-8. doi :10.1093/nar/gkj139. PMC 1347501.  PMID 16381901  .
  • シカゴ・トリビューンのトライン・ツォウデロス氏がOSRの抗酸化物質を批判 2016年3月6日アーカイブ、Wayback Machineにて

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