パクシン2
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
パクシン2
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスニューロン2におけるPACSIN2、SDPII、タンパク質キナーゼC、カゼインキナーゼ基質
外部IDオミム：604960; MGI : 1345153;ホモロジーン: 21414;ジーンカード：PACSIN2; OMA :PACSIN2 - オルソログ
オルソログ
種人間ねずみ
エントレズ

11252

23970

アンサンブル

ENSG00000100266

ENSMUSG00000016664

ユニプロット

Q9UNF0

Q9WVE8

RefSeq (mRNA)
RefSeq（タンパク質）
場所（UCSC）22章: 42.84 – 43.02 MB15章: 83.26 – 83.35 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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ニューロンタンパク質キナーゼCおよびカゼインキナーゼ基質2 （パクシン2）は、ヒトではPACSIN2 遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]パクシン2は、小胞体の形成に関与している。[8]

PACSIN2の変異体rs2413739は、急性リンパ芽球性白血病の小児の寛解維持療法中の酵素チオプリンメチルトランスフェラーゼの活性と、主に代謝拮抗物質であるメルカプトプリンとメトトレキサートに基づく急性リンパ芽球性白血病の小児の寛解強化療法中の重篤な胃腸系有害事象の発生率と関連している。[9]

相互作用

PACSIN2 は以下と相互作用することが示されています。

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100266 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000016664 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Ritter B, Modregger J, Paulsson M, Plomann M (1999年8月). 「PACSIN 2：細胞質アダプタータンパク質PACSINファミリーの新規メンバー」. FEBS Lett . 454 (3): 356–62 . doi : 10.1016/S0014-5793(99)00830-3 . PMID  10431838. S2CID  44788141.
  6. ^ abc Modregger J, Ritter B, Witter B, Paulsson M, Plomann M (2001年1月). 「3種類のPACSINアイソフォームはすべてエンドサイトーシスタンパク質に結合し、エンドサイトーシスを阻害する」J Cell Sci . 113 (24): 4511–21 . doi :10.1242/jcs.113.24.4511. PMID  11082044.
  7. ^ 「Entrez Gene: ニューロン2のPACSIN2タンパク質キナーゼCとカゼインキナーゼ基質」。
  8. ^ Shvets, E; Ludwig, A; Nichols, BJ (2014年8月). 「洞窟からのニュース：カベオラの構造と機能の最新情報」Current Opinion in Cell Biology . 29 : 99– 106. doi :10.1016/j.ceb.2014.04.011. PMID  24908346.
  9. ^ フランカ、ラファエラ;ストッコ、ガブリエレ。ファブレット、ディエゴ。ジュリシ、ナグア。デル・リッツォ、アイリーン。ロカテッリ、フランコ。ヴィンティ、ルシアナ。ビオンディ、アンドレア。コロンビーニ、アントネッラ。ファジョーリ、フランカ。バリゾン、エレナ。ペリン、マルコ。マルテロッシ、ステファノ。ベンチュラ、アレッサンドロ。デコルティ、ジュリアナ。マルコ・ラブシン（2020）。 「PACSIN2 rs2413739 チオプリン薬物動態への影響: 小児患者における検証研究」。薬理ゲノミクス ジャーナル。20 (3): 415–425。土井:10.1038/s41397-019-0130-0。hdl : 2318/1757668。PMID  31792371。S2CID 208539277  。
  10. ^ Ghadimi MP, Sanzenbacher R, Thiede B, Wenzel J, Jing Q, Plomann M, Borkhardt A, Kabelitz D, Janssen O (2002年5月). 「CD95リガンド（CD178）の細胞質ポリプロリン領域の相互作用パートナーの同定」. FEBS Lett . 519 ( 1–3 ): 50–8 . doi :10.1016/s0014-5793(02)02709-6. PMID  12023017. S2CID  26765451.
  11. ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

さらに読む

  • Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」. Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
  • Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」. Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC  139146. PMID  9110174 .
  • Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). 「ヒト22番染色体のDNA配列」. Nature . 402 (6761): 489–95 .書誌コード:1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID  10591208.
  • Sumoy L, Pluvinet R, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (2001). 「PACSIN 3は、パクシン-シンダピン-FAP52遺伝子ファミリーに属する新規SH3ドメイン細胞質アダプタータンパク質である」. Gene . 262 ( 1– 2): 199– 205. doi :10.1016/S0378-1119(00)00531-X. PMID  11179684.
  • ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターホフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム解析11 (3): 422–35 .土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC  311072。PMID  11230166。
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  • Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). 「ゲノムアノテーションに基づくヒトORFeomeクローニングへのアプローチ」Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC  545604 . PMID  15461802.
  • ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  • Kessels MM, Dong J, Leibig W, Westermann P, Qualmann B (2006). 「シンダピンIIとダイナミンIIの複合体はトランスゴルジ体ネットワークにおける小胞形成を促進する」J. Cell Sci . 119 (Pt 8): 1504–16 . doi : 10.1242/jcs.02877 . PMID  16551695.
  • Cuajungco MP, Grimm C, Oshima K, D'hoedt D, Nilius B, Mensenkamp AR, Bindels RJ, Plomann M, Heller S (2006). 「PACSINはTRPV4陽イオンチャネルに結合する。PACSIN 3はTRPV4の細胞内局在を調節する」J. Biol. Chem . 281 (27): 18753–62 . doi : 10.1074/jbc.M602452200 . hdl : 2066/51163 . PMID  16627472.
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983.


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