PDE6D

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
PDE6D
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスPDE6D、JBTS22、PDED、ホスホジエステラーゼ6D
外部IDオミム:602676; MGI : 1270843;ホモロジーン: 1954;ジーンカード:PDE6D; OMA :PDE6D - オルソログ
EC番号3.1.4.35
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_001291018
NM_002601

NM_008801
NM_001360816
NM_001360817

RefSeq(タンパク質)

NP_001277947
NP_002592
NP_002592.1

NP_032827
NP_001347745
NP_001347746

場所(UCSC)2番目の文字: 231.73 – 231.79 MB1章: 86.47 – 86.51 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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網膜桿体ロドプシン感受性cGMP 3',5'-環状ホスホジエステラーゼサブユニットデルタは、ヒトではPDE6D遺伝子によってコードされる酵素である[5] [6] [7] PDE6Dはもともと桿体細胞特異的cGMPホスホジエステラーゼ(PDE)(EC 3.1.4.35)の4番目のサブユニットとして同定された。桿体特異的GMP-PDE複合体におけるPDEデルタサブユニットの正確な機能は不明である。さらに、PDEデルタサブユニットは光受容細胞に限定されず、さまざまな組織に広く分布している。PDEデルタサブユニットは、特定のプレニル化タンパク質の特異的な可溶性輸送因子であり、Arl2-GTPはPDEを介した輸送の調節因子であると考えられている。[8]

相互作用

PDE6D は以下と相互作用することが示されています:

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000156973 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026239 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Ershova G, Derré J, Chételin S, Nancy V, Berger R, Kaplan J, Munnich A, de Gunzburg J (1998年4月). 「網膜桿体細胞のcGMPホスホジエステラーゼのデルタサブユニットをコードするヒト遺伝子PDE6DのcDNA配列、ゲノム構成、および染色体2q36へのマッピング」. Cytogenetics and Cell Genetics . 79 ( 1–2 ): 139–41 . doi :10.1159/000134701. PMID  9533031.
  6. ^ Li N, Florio SK, Pettenati MJ, Rao PN, Beavo JA, Baehr W (1998年4月). 「ヒトおよびマウス桿体cGMPホスホジエステラーゼデルタサブユニット(PDE6D)の特性解析とヒト遺伝子の染色体局在」. Genomics . 49 (1): 76– 82. doi :10.1006/geno.1998.5210. PMID  9570951.
  7. ^ 「Entrez Gene: PDE6D ホスホジエステラーゼ 6D、cGMP 特異的、ロッド、デルタ」。
  8. ^ Wittinghofer A, Renault L, Hanzal-bayer M, Roversi P, Hillig RC (2002). 「Arl2-GTPとPDEデルタの複合体:構造から機能へ」. EMBO J. 21 ( 9): 2095–2106 . doi : 10.1093 /emboj/21.9.2095. PMC 125981. PMID  11980706 . 
  9. ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  10. ^ abcd Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (2002年5月). 「Arl2-GTPとPDEデルタの複合体:構造から機能へ」. The EMBO Journal . 21 (9): 2095–106 . doi :10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981. PMID  11980706 . 
  11. ^ abc Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (2002年4月). 「網膜桿体cGMPホスホジエステラーゼのデルタサブユニットはRasおよびRap GTPaseの膜結合を制御する」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (17): 15076–84 . doi : 10.1074/jbc.M109983200 . PMID  11786539.
  12. ^ Linari M, Ueffing M, Manson F, Wright A, Meitinger T, Becker J (1999年2月). 「網膜色素変性症GTPase調節因子RPGRは桿体サイクリックGMPホスホジエステラーゼのデルタサブユニットと相互作用する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (4): 1315–20 . Bibcode :1999PNAS...96.1315L. doi : 10.1073/pnas.96.4.1315 . PMC 15460. PMID  9990021 . 

さらに読む

  • Marzesco AM, Galli T, Louvard D, Zahraoui A (1998年8月). 「桿体cGMPホスホジエステラーゼδサブユニットは低分子GTPase Rab13を膜から解離する」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (35): 22340–5 . doi : 10.1074/jbc.273.35.22340 . PMID  9712853.
  • Lorenz B, Migliaccio C, Lichtner P, Meyer C, Strom TM, D'Urso M, Becker J, Ciccodicola A, Meitinger T (1998). 「ヒトおよびマウスにおける桿体cGMPホスホジエステラーゼデルタサブユニット遺伝子(PDED)のクローニングと遺伝子構造」. European Journal of Human Genetics . 6 (3): 283–90 . doi : 10.1038/sj.ejhg.5200215 . PMID  9781033.
  • Linari M, Ueffing M, Manson F, Wright A, Meitinger T, Becker J (1999年2月). 「網膜色素変性症GTPase制御因子RPGRは桿体サイクリックGMPホスホジエステラーゼのデルタサブユニットと相互作用する」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (4): 1315–20 . Bibcode :1999PNAS...96.1315L. doi : 10.1073/pnas.96.4.1315 . PMC  15460. PMID  9990021 .
  • Mou H, Grazio HJ, Cook TA, Beavo JA, Cote RH (Jun 1999). "cGMP binding to noncatalytic sites on mammalian rod photoreceptor phosphodiesterase is regulated by binding of its gamma and delta subunits". The Journal of Biological Chemistry. 274 (26): 18813–20. doi:10.1074/jbc.274.26.18813. PMID 10373499.
  • Linari M, Hanzal-Bayer M, Becker J (Sep 1999). "The delta subunit of rod specific cyclic GMP phosphodiesterase, PDE delta, interacts with the Arf-like protein Arl3 in a GTP specific manner". FEBS Letters. 458 (1): 55–9. doi:10.1016/S0014-5793(99)01117-5. PMID 10518933. S2CID 23460401.
  • Nancy V, Callebaut I, El Marjou A, de Gunzburg J (Apr 2002). "The delta subunit of retinal rod cGMP phosphodiesterase regulates the membrane association of Ras and Rap GTPases". The Journal of Biological Chemistry. 277 (17): 15076–84. doi:10.1074/jbc.M109983200. PMID 11786539.
  • Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (May 2002). "The complex of Arl2-GTP and PDE delta: from structure to function". The EMBO Journal. 21 (9): 2095–106. doi:10.1093/emboj/21.9.2095. PMC 125981. PMID 11980706.
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Sep 2005). "A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome". Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl:11858/00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
  • Wilson SJ, Smyth EM (Apr 2006). "Internalization and recycling of the human prostacyclin receptor is modulated through its isoprenylation-dependent interaction with the delta subunit of cGMP phosphodiesterase 6". The Journal of Biological Chemistry. 281 (17): 11780–6. doi:10.1074/jbc.M513110200. PMID 16527812.
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