PDF（遺伝子）

PDF
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3G5K、3G5P
識別子
エイリアス	PDF、ペプチドデホルミラーゼ（ミトコンドリア）、ペプチドデホルミラーゼ、ミトコンドリア
外部ID	MGI : 1915273; HomoloGene : 69354; GeneCards : PDF; OMA :PDF - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 16番染色体（ヒト）[1] バンド 16q22.1 始める 69,326,913 bp [1] 終わり 69,330,588 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[2] バンド 8|8 D3 始める 1億777万1330bp [ 2] 終わり 107,775,246 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 睾丸 生殖腺 人間の腎臓 肝臓の右葉 子宮内膜間質細胞 腓腹筋 横行結腸粘膜 太ももの筋肉 骨格筋組織 右副腎 上位の表現 大腿四頭筋 近位尿細管 右腎臓 筋肉組織 骨格筋組織 太ももの筋肉 心臓 副腎 胚 肝臓 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 加水分解酵素活性 金属イオン結合 ペプチドデホルミラーゼ活性 細胞成分 ミトコンドリア 生物学的プロセス ペプチジルメチオニン修飾 N末端タンパク質アミノ酸修飾 タンパク質生合成 細胞集団増殖の正の調節 翻訳共役タンパク質修飾 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 64146 68023 アンサンブル ENSG00000258429 ENSMUSG00000078931 ユニプロット Q9HBH1 S4R2K0 RefSeq (mRNA) NM_022341 NM_026513 RefSeq（タンパク質） NP_071736 NP_080789 場所（UCSC） 16章: 69.33 – 69.33 Mb 8章: 107.77 – 107.78 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ミトコンドリアペプチドデホルミラーゼは、ヒトではPDF遺伝子によってコードされている酵素である。^{[5] [6] [7]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000258429 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000078931 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Giglione C, Serero A, Pierre M, Boisson B, Meinnel T (2000年11月). 「真核生物ペプチドデフォルミラーゼの同定は、N末端タンパク質プロセシング機構の普遍性を明らかにする」. EMBO J. 19 ( 21): 5916–29 . doi :10.1093/emboj/19.21.5916. PMC 305796. PMID 11060042  . 
6. Lee MD, She Y, Soskis MJ, Borella CP, Gardner JR, Hayes PA, Dy BM, Heaney ML, Philips MR, Bornmann WG, Sirotnak FM, Scheinberg DA (2004年10月). 「ヒトミトコンドリアペプチドデホルミラーゼ：アクチノニン系抗生物質の新たな抗がん標的」. J Clin Invest . 114 (8): 1107–16 . doi :10.1172/JCI22269. PMC 522256. PMID 15489958  . 
7. 「Entrez Gene: PDF ペプチドデホルミラーゼ（ミトコンドリア）」。

さらに読む

• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• Lee MD, Antczak C, Li Y, et al. (2004). 「アクチノニンによって阻害される新規ヒトペプチドデホルミラーゼ」Biochem. Biophys. Res. Commun . 312 (2): 309–15 . doi :10.1016/j.bbrc.2003.10.123. PMID  14637138.
• Serero A, Giglione C, Sardini A, et al. (2004). 「ヒトミトコンドリアN末端メチオニン除去経路における特異なペプチドデホルミラーゼの特徴」J. Biol. Chem . 278 (52): 52953–63 . doi : 10.1074/jbc.M309770200 . PMID  14532271.
• Nguyen KT, Hu X, Colton C, et al. (2003). 「ヒトペプチドデホルミラーゼの特性解析：抗菌薬設計への示唆」.生化学. 42 (33): 9952–8 . doi :10.1021/bi0346446. PMID  12924944.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, et al. (2003). 「北米インディアン小児肝硬変におけるcirhin遺伝子（FLJ14728）のミスセンス変異（R565W）の関与」Am. J. Hum. Genet . 71 (6): 1443–9 . doi :10.1086/344580. PMC 378590.  PMID 12417987  .

外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : Q9HBH1 (ヒトペプチドデホルミラーゼ、ミトコンドリア)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。