PNKD

PNKD
識別子
エイリアスPNKD、BRP17、DYT8、FPD1、KIPP1184、MR-1、MR1、PDC、PKND1、TAHCCP2、FKSG19、発作性非運動誘発性ジスキネジア、PNKD1、MBLドメイン含有、MR-1S、PNKDメタロβラクタマーゼドメイン含有、R1
外部IDオミム: 609023 ; MGI : 1930773 ;ホモロジーン: 75045 ;ジーンカード: PNKD ; OMA : PNKD - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_022572 NM_001077399 NM_015488

NM_001039509 NM_019999 NM_025580

RefSeq(タンパク質)

NP_001070867 NP_056303 NP_072094

NP_001034598 NP_064383 NP_079856

場所(UCSC)2章: 218.27 – 218.35 Mb1章: 74.32 – 74.39 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
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PNKDは、ヒト神経運動障害である発作性非運動性ジスキネジア(PNKD)の略称です 。他の多くのヒト遺伝性疾患と同様に、PNKDは疾患名、疾患遺伝子、そしてコードされているタンパク質も指します。PNKDは、ヒトにおいてPNKD遺伝子によってコードされているタンパク質です。[ 5 ] [ 6 ]選択的スプライシングにより、3つのアイソフォームが転写されます。マウスの相同遺伝子は脳タンパク質17(Brp17)と呼ばれています。

構造

この遺伝子は2番染色体の2q35バンドに位置し、12のエクソンを含む。[ 6 ]この遺伝子の選択的スプライシングによって、少なくとも3種類の異なる長さのアイソフォーム(長、中、短)が生成される。長(PNKD-L)および中(PNKD-M)アイソフォームの遺伝子産物にはC末端β-ラクタマーゼドメインが含まれるが、短(PNKD-S)アイソフォーム(一般に筋原線維形成調節因子-1(MR-1)と呼ばれる)は3つのエクソンのみを含み、既知のタンパク質との相同性がない。[ 7 ] [ 8 ]これらのアイソフォームは、組織特異的な発現および細胞内局在も異なる。具体的には、PNKD-Lは中枢神経系でのみ発現するのに対し、PNKD-MおよびPNKD-Sは組織全体に遍在的に発現する。[ 7 ]さらに、PNKD-Lは細胞膜に、PNKD-Sは細胞質に、PNKD-Mはミトコンドリアに局在する。[ 9 ]

関数

PNKDタンパク質の機能は不明ですが、PNKDの長鎖および中鎖アイソフォームには保存されたβ-ラクタマーゼドメインが含まれており、酵素として機能する可能性が示唆されています。PNKDに最も近い哺乳類ホモログは HAGHであり、この酵素はSLGを加水分解してD-乳酸と還元型GSHを生成する2段階反応に関与します。しかし、PNKDの加水分解活性はごくわずかです。[ 7 ]

PNKDの長型は神経細胞特異的であり、主にシナプス前膜に局在するシナプスタンパク質をコードしています。シナプス後領域および小胞構造にも、PNKD長型が時折存在します。PNKD長型はシナプス前タンパク質RIMと相互作用し、シナプス開口放出を阻害します。疾患変異を伴うPNKDでは、この阻害効果が低下するため、シナプス放出が増加します。これは脳内で過剰な神経伝達物質放出を引き起こし、PNKD患者におけるてんかん発症の根本原因である可能性があります。[ 10 ]

臨床的意義

PNKDエクソン1の点変異は、発作性非運動誘発性ジスキネジアと呼ばれる遺伝性の神経運動障害をヒトに引き起こす。[ 6 ] PNKDの過剰発現は、膵管腺癌[ 11 ]胃癌[ 12 ] 、卵巣癌[ 13 ]乳癌[ 8 ]など複数の癌とも関連付けられており、これらの癌の治療標的、または患者の転帰を評価するためのバイオマーカーとして機能する可能性がある関与するシグナル伝達経路は、癌によって異なる可能性がある。例えば、ヒト乳癌(MCF7)細胞では、PNKDはMEK/ERKシグナル伝達経路を活性化することで腫瘍細胞の増殖を促進する可能性があるが、ヒト肝癌(HepG2)細胞では、PNKDはMLC2/FAK/AKT経路を介して機能する可能性がある。[ 8 ]

相互作用

PNKD は以下と相互作用することが示されています:

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000127838Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026179Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^フィンク・JK、ライナー・S、ウィルコウスキー・J、ジョーンズ・SM、久米・A、ヘデラ・P、アルビン・R、マセイ・J、ガーバッハ・L、ヴァーヴィル・T、オッテルード・B、レパート・M (1996年7月)。「発作性ジストニア性舞踏アテトーゼ:染色体 2q との密接な関係」アメリカ人類遺伝学ジャーナル59 (1): 140–5 . PMC 1915128PMID 8659518  
  6. ^ a b c「Entrez Gene: PNKD発作性非運動原性ジスキネジア」
  7. ^ a b c Shen Y, Lee HY, Rawson J, Ojha S, Babbitt P, Fu YH, Ptácek LJ (2011年6月). 「発作性ジスキネジアを引き起こすPNKDの変異はタンパク質切断と安定性を変化させる」 .ヒト分子遺伝学. 20 (12): 2322–32 . doi : 10.1093/hmg/ddr125 . PMC 3098736. PMID 21487022 .  
  8. ^ a b c Gong Y, He H, Liu H, Zhang C, Zhao W, Shao RG (2014年8月). 「筋原線維形成調節因子1のリン酸化はMAPKシグナル伝達経路を活性化し、ヒト乳がんMCF7細胞の増殖と遊走を誘導する」 . FEBS Letters . 588 (17): 2903–10 . doi : 10.1016 / j.febslet.2014.07.018 . PMID 25066297. S2CID 38906043 .  
  9. ^ 「PNKD - 推定加水分解酵素PNKD - ホモ・サピエンス(ヒト) - PNKD遺伝子とタンパク質」 www.uniprot.org . 2016年7月25日閲覧
  10. ^ a b c Shen Y, Ge WP, Li Y, Hirano A, Lee HY, Rohlmann A, Missler M, Tsien RW, Jan LY, Fu YH, Ptáček LJ (2015年3月). 「発作性ジスキネジアにおいて変異したタンパク質は活性領域タンパク質RIMと相互作用し、シナプス小胞のエキソサイトーシスを抑制する」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 112 ( 10): 2935–41 . Bibcode : 2015PNAS..112.2935S . doi : 10.1073/pnas.1501364112 . PMC 4364199. PMID 25730884 .  
  11. ^ Zhao CY, Guo ZJ, Dai SM, Zhang Y, Zhou JJ (2013年10月). 「膵管腺癌における筋原線維形成調節因子1タンパク質発現の臨床病理学的および予後予測的意義」.腫瘍生物学. 34 (5): 2983–7 . doi : 10.1007 / s13277-013-0862-4 . PMID 23696030. S2CID 6019528 .  
  12. ^ Guo J, Dong B, Ji JF, Wu AW (2012年10月). 「Myofibrillogenesis regulator-1の過剰発現は胃癌患者の予後不良と関連する」 . World Journal of Gastroenterology . 18 (38): 5434–41 . doi : 10.3748 / wjg.v18.i38.5434 . PMC 3471113. PMID 23082061 .  
  13. ^ Lu RQ, Sun M, Gao X, Guo L (2012年3月). 「卵巣癌における新規バイオマーカーMR-1Sの発現とその生物学的意義」.中国腫瘍学雑誌. 34 (3): 176– 81. doi : 10.3760/cma.j.issn.0253-3766.2012.03.004 . PMID 22780969 .