PPIB
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
PPIB
利用可能な構造
PDBオーソログ検索: PDBe RCSB
識別子
エイリアスPPIB、CYP-S1、CYPB、HEL-S-39、OI9、SCYLP、ペプチジルプロリルイソメラーゼB、B
外部IDオミム: 123841; MGI : 97750;ホモロジーン: 726;ジーンカード：PPIB; OMA :PPIB - オルソログ
オルソログ
種人間ねずみ
エントレズ

5479

19035

アンサンブル

ENSG00000166794

ENSMUSG00000032383

ユニプロット

P23284

P24369

RefSeq (mRNA)

NM_000942

NM_011149

RefSeq（タンパク質）

NP_000933

NP_035279

場所（UCSC）15章: 64.16 – 64.16 Mb9章: 65.97 – 65.97 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼBは、 PPIB遺伝子によってコードされる酵素である。[5] ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼ（PPIase）ファミリーのメンバーとして、このタンパク質はプロリンイミドペプチド結合のシストランス異性化を触媒し、 I型コラーゲンのタンパク質フォールディングを制御する。[6] [7]一般に、PPIaseはすべての真正細菌と真核生物、およびいくつかの古細菌に見られ、高度に保存されている。

構造

他のシクロフィリンと同様に、PPIBは疎水性コアを持つβバレル構造を形成する。このβバレルは8本の反平行βストランドから構成され、その上部と下部には2本のαヘリックスがキャップされている。さらに、ストランド内のβターンとループがバレルの柔軟性に寄与している。[8]特に、PPIBは21 kDaのタンパク質で、C末端にER保持モチーフを有し、タンパク質をERオルガネラへ誘導する。一方、N末端延長部はPPIBを基質に結合させる。[7] [9]

関数

PPIBはペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼ（ PPIase ）ファミリーの一員です。PPIaseはプロリンイミドペプチド結合のシストランス異性化を触媒し、タンパク質の折り畳みと成熟を制御します。プロリンは、生体内でシス異性化とトランス異性化の両方の速度で存在することが知られている唯一のアミノ酸であり、タンパク質の再折り畳みにおける律速段階となることがよくあります。[10] PPIaseファミリーはさらに、シクロフィリン（CyP）、FK506結合タンパク質（FKBP）、およびパルブリン（Pvn）という3つの構造的に異なるサブファミリーに分類されます。[11] [12]各ファミリーはPPIase活性を示しますが、ファミリー間には構造上の類似点はありません。シクロフィリンであるPPIBはシクロスポリンA（CsA）に結合し、細胞内に存在するか、細胞から分泌されます。[9] [13]

ヒトPPIB

PPIBは、CypAに次いでヒトで同定された18種のシクロフィリンのうちの2番目である。[11] [13] PPIBは小胞体（ER）に局在し、ミトコンドリア代謝、アポトーシス、酸化還元、炎症などの多くの生物学的プロセスに関与しているほか、虚血再灌流障害、エイズ、癌などの関連疾患や症状にも関与している。[9] [14] PPIB はウイルス感染とも関連している。真核生物では、シクロフィリンは多くの細胞や組織型に遍在している。[9] [8] PPIaseおよびタンパク質シャペロン活性に加えて、シクロフィリンはミトコンドリア代謝、アポトーシス、免疫応答、炎症、細胞の成長と増殖に機能している。[6] [9] [8] PPICと共にPPIBは小胞体（ER）に局在し、そこで酸化還元恒常性を維持する。これら2つのシクロフィリンの枯渇はERの過酸化を引き起こす。[15]

ERにおいて、PPIBはP3H1、CRTAP、BiP、GRP94、PDI、カルレティキュリンなどのタンパク質と相互作用し、フォールダーゼおよびシャペロン複合体を形成し、特にI型コラーゲンのタンパク質フォールディングを促進します。[16] [17] I型コラーゲンには、適切なフォールディングのためにシス-トランス異性化を必要とするプロリンが豊富に含まれているため、PPIBはI型コラーゲンの主要なPPIaseです。したがって、PPIBはコラーゲンの生合成と翻訳後修飾に不可欠であり、線維の組み立て、マトリックスの架橋、および骨の石灰化に影響を与えます。[16]

さらに、PPIBは分泌経路に関与し、体液中に放出されます。このタンパク質はTリンパ球およびBリンパ球由来の細胞に結合し、シクロスポリンAを介した免疫抑制を制御する可能性があります。[18]ある実験では、PPIBをin vitro細胞培養に添加すると、 T細胞の走化性とインテグリンを介した細胞外マトリックス（ECM）への接着が誘導されました。これは、PPIBがin vivoで感染組織にT細胞をリクルートすることで自然免疫に機能する可能性があることを示唆しています。[9]

臨床的意義

PPIB はシクロフィリンとして免疫抑制剤 CsA と結合して CsA-シクロフィリン複合体を形成し、その後カルシニューリンを標的にしてT 細胞活性化のシグナル伝達経路を阻害します。

心筋細胞において、シクロフィリンは熱ショックや低酸素状態による再酸素化によって活性化され、また熱ショックタンパク質と複合体を形成することが観察されている。したがって、シクロフィリンは虚血再灌流障害時の心臓保護に機能する可能性がある。[9]

PPIBは、エイズ、C型肝炎、麻疹、A型インフルエンザなどの疾患を引き起こすウイルスの複製と感染に寄与する。そのため、選択的阻害剤を用いたPPIBの治療標的化は、ウイルス感染や炎症の抑制に有効であることが証明される可能性がある。[7]現在、PPIBは様々な種類の癌のバイオマーカーとして用いられている。[14]さらに、HLA-A24拘束性および腫瘍特異的な細胞傷害性Tリンパ球によって認識される2つの抗原 エピトープ（CypB84-92およびCypB91-99）があり、これらは癌ワクチンとして使用できる可能性があり、実際に臨床試験で肺癌の治療に使用された。 [9]

細菌性PPIB

PPIBはグラム陰性細菌とグラム陽性細菌の両方において細胞内タンパク質として同定されている。大腸菌では、PPIBはPPIase活性とシャペロン（タンパク質）活性の両方を持つことが示されている。[19]黄色ブドウ球菌では、PPIBはPPIase活性を持ち、ブドウ球菌ヌクレアーゼのリフォールディングを直接的に補助することが示されている。[20]これらの細菌以外にも、ブルセラ・アボルタス、結核菌、枯草菌などの細菌においてPPIBが同定されている。 [21] [22] [23]

相互作用

PPIB は以下と相互作用することが示されています。

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000166794 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032383 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Price ER, Zydowsky LD, Jin MJ, Baker CH, McKeon FD, Walsh CT (1991年4月). 「ヒトシクロフィリンB：シグナル配列を持つペプチジルプロリルイソメラーゼをコードする第二のシクロフィリン遺伝子」Proc Natl Acad Sci USA . 88 (5): 1903–7 . Bibcode :1991PNAS...88.1903P. doi : 10.1073/pnas.88.5.1903 . PMC 51134. PMID 2000394  . 
  6. ^ ab 和井 孝文、井上 暢、山田 修、小松 誠（1992年1月）「大動脈弓部動脈瘤手術における選択的脳灌流：再評価」『胸部外科年報』 53 ( 1): 109-14 . doi : 10.1016/0003-4975(92)90767-x . PMID  1530810.
  7. ^ abc Hoffmann H, Schiene-Fischer C (2014年7月). 「細胞外シクロフィリンの機能的側面」.生物化学. 395 ( 7–8 ): 721–35 . doi :10.1515/hsz-2014-0125. PMID  24713575. S2CID  32395688.
  8. ^ abc Wang T, Yun CH, Gu SY, Chang WR, Liang DC (2005年8月). 「1.88 hCyP33のCドメインの結晶構造：ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼの新規ドメイン」.生化学および生物理学的研究通信. 333 (3): 845–9 . Bibcode :2005BBRC..333..845W. doi :10.1016/j.bbrc.2005.06.006. PMID  15963461.
  9. ^ abcdefgh Yao Q, Li M, Yang H, Chai H, Fisher W, Chen C (2005年3月). 「がんおよび他の臓器系におけるシクロフィリンの役割」. World Journal of Surgery . 29 (3): 276–80. doi : 10.1007/s00268-004-7812-7. PMID  15706440. S2CID  11678319.
  10. ^ Göthel, SF; Marahiel, MA (1999年3月). 「ペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ：普遍的なフォールディング触媒のスーパーファミリー」. Cellular and Molecular Life Sciences . 55 (3): 423– 436. doi :10.1007/s000180050299. ISSN  1420-682X. PMC 11146858. PMID 10228556.  S2CID 24868224  . 
  11. ^ ab 和井 孝文、井上 暢、山田 修、小松 誠（1992年1月）「大動脈弓部動脈瘤手術における選択的脳灌流：再評価」『胸部外科年報』 53 ( 1): 109-14 . doi : 10.1016/0003-4975(92)90767-x . PMID  1530810.
  12. ^ Wang T, Yun CH, Gu SY, Chang WR, Liang DC (2005年8月). 「1.88 hCyP33のCドメインの結晶構造：ペプチジルプロリルシストランスイソメラーゼの新規ドメイン」.生化学および生物理学的研究通信. 333 (3): 845–9 . Bibcode :2005BBRC..333..845W. doi :10.1016/j.bbrc.2005.06.006. PMID  15963461.
  13. ^ ab Hoffmann H, Schiene-Fischer C (2014年7月). 「細胞外シクロフィリンの機能的側面」.生物化学. 395 ( 7–8 ): 721–35 . doi :10.1515/hsz-2014-0125. PMID  24713575. S2CID  32395688.
  14. ^ ab Ray P, Rialon-Guevara KL, Veras E, Sullenger BA, White RR (2012年5月). 「in vitroアプタマー選択によるヒト膵臓細胞セクレトームの比較により、シクロフィリンBが膵臓がんの候補バイオマーカーとして同定された」. The Journal of Clinical Investigation . 122 (5): 1734–41 . doi :10.1172/JCI62385. PMC 3336995. PMID  22484812 . 
  15. ^ Stocki P, Chapman DC, Beach LA, Williams DB (2014年8月). 「シクロフィリンBおよびCの枯渇は小胞体の酸化還元恒常性の調節不全につながる」. The Journal of Biological Chemistry . 289 (33): 23086–96 . doi : 10.1074/jbc.M114.570911 . PMC 4132807. PMID 24990953  . 
  16. ^ abcdef Cabral WA, Perdivara I, Weis M, Terajima M, Blissett AR, Chang W, Perosky JE, Makareeva EN, Mertz EL, Leikin S, Tomer KB, Kozloff KM, Eyre DR, Yamauchi M, Marini JC (2014年6月). 「劣性骨形成不全症のシクロフィリンB KOマウスモデルにおける異常なI型コラーゲンの翻訳後修飾と架橋」. PLOS Genetics . 10 (6) e1004465. doi : 10.1371/journal.pgen.1004465 . PMC 4072593. PMID  24968150 . 
  17. ^ abc 石川雄三、ベッヒンガーHP（2013年11月）「粗面小胞体タンパク質複合体プロリル3-ヒドロキシラーゼ1・軟骨関連タンパク質・シクロフィリンBの追加機能：CXXXCモチーフはin vitroジスルフィドイソメラーゼ活性を明らかにする」『Journal of Biological Chemistry』288 (44): 31437–46 . doi : 10.1074/jbc.M113.498063 . PMC 3814740. PMID  24043621 . 
  18. ^ 「Entrez Gene: PPIB ペプチジルプロリルイソメラーゼ B (シクロフィリン B)」。
  19. ^ スカギア、アゲリキ;ヴェジリ、エレニ。シガラ、マルケジナ;コッキノウ、アレティ。カルプサス、マイケル。ヴェニラキ、アナスタシア。カティナキス、パナギオティス。マリア、ディモウ（2017年1月）。 「シクロフィリン PpiB 変異体の構造および機能解析は、プロリル異性化活性に限定されない生体内機能を裏付けています。」遺伝子から細胞へ: 分子および細胞のメカニズムに特化。22 (1): 32–44 .土井: 10.1111/gtc.12452。ISSN  1365-2443。PMID  27868330。
  20. ^ Wiemels, Richard E.; Cech, Stephanie M.; Meyer, Nikki M.; Burke, Caleb A.; Weiss, Andy; Parks, Anastacia R.; Shaw, Lindsey N.; Carroll, Ronan K. (2017-01-01). 「細胞内ペプチジルプロリルシス/トランスイソメラーゼは、黄色ブドウ球菌分泌型毒性因子ヌクレアーゼのフォールディングと活性に必須である」. Journal of Bacteriology . 199 (1). doi :10.1128/JB.00453-16. ISSN  1098-5530. PMC 5165095. PMID 27795319  . 
  21. ^ ロゼット、マラ S.ガルシア・フェルナンデス、ルシア。デルベッキオ、ヴィトー G.ブリオネス、ガブリエル（2013 年 2 月）。 「細胞内で誘導されたシクロフィリンは、ストレス適応とブルセラ・アボルツスの病原性において重要な役割を果たす。」感染症と免疫。81 (2): 521–530。土井:10.1128/IAI.01125-12。ISSN  0019-9567。PMC 35538​​18。PMID  23230297。 
  22. ^ Göthel, SF; Scholz, C.; Schmid, FX; Marahiel, MA (1998-09-22). 「枯草菌由来のシクロフィリンとトリガー因子はin vitroタンパク質フォールディングを触媒し、飢餓条件下での生存に必須である」.生化学. 37 (38): 13392– 13399. doi :10.1021/bi981253w. ISSN  0006-2960. PMID  9748346.
  23. ^ パンディー、サウラブ;シャルマ、アシシュ。トリパティ、ディクシャ。クマール、アシュトシュ。クバイブ、モハド。ブワン、マニッシュ。チョードゥリ、タパン・クマール。ハスナイン、セイド・エテシャム。エテシャム、ナスリーン・ザファール (2016-03-16)。 「結核菌ペプチジルプロリルイソメラーゼも、インビトロおよびインビボでシャペロン様活性を示す」。プロスワン。11 (3) e0150288。Bibcode :2016PLoSO..1150288P。土井：10.1371/journal.pone.0150288。ISSN  1932-6203。PMC 4794191。PMID  26981873。 
  24. ^ Zhang J, Herscovitz H (2003年2月). 「新生脂質化アポリポタンパク質Bは、小胞体分子シャペロン（GRP94、ERp72、BiP、カルレティキュリン、およびシクロフィリンB）のネットワークとの会合によって、不完全に折り畳まれた中間体としてゴルジ体へ輸送される」J. Biol. Chem . 278 (9): 7459–68 . doi : 10.1074/jbc.M207976200 . PMID  12397072.

さらに読む

  • Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J (1993). 「正常ヒト表皮ケラチノサイトの2次元ゲルタンパク質データベースに記録された145種類のタンパク質のマイクロシーケンス」. Electrophoresis . 13 (12): 960–9 . doi :10.1002/elps.11501301199. PMID  1286667. S2CID  41855774.
  • Peddada LB, McPherson JD, Law R, Wasmuth JJ, Youderian P, Deans RJ (1992). 「ヒトシクロフィリンB遺伝子（PPIB）の15番染色体への体細胞マッピング」Cytogenet. Cell Genet . 60 ( 3–4 ): 219–21 . doi :10.1159/000133343. PMID  1505219.
  • Arber S, Krause KH, Caroni P (1992). 「S-シクロフィリンは、特有のCOOH末端配列を介して細胞内に保持され、カルシウム貯蔵タンパク質であるカルレティキュリンと共局在する」J. Cell Biol . 116 (1): 113– 25. doi :10.1083/jcb.116.1.113. PMC 2289259.  PMID 1530944  .
  • Hasel KW, Glass JR, Godbout M, Sutcliffe JG (1991). 「小胞体特異的シクロフィリン」. Mol. Cell. Biol . 11 (7): 3484–91 . doi :10.1128/mcb.11.7.3484. PMC  361082. PMID 1710767  .
  • Spik G、Haendler B、Delmas O、Mariller C、Chamoux M、Maes P、Tartar A、Montreuil J、Stedman K、Kocher HP (1991)。 「新規分泌型シクロフィリン様タンパク質（SCYLP）」。Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学。266 (17): 10735– 8.土井: 10.1016/S0021-9258(18)99078-2。PMID  2040592。
  • Bram RJ, Crabtree GR (1994). 「シクロフィリンB結合タンパク質によって刺激されたT細胞におけるカルシウムシグナル伝達」. Nature . 371 (6495): 355–8 . Bibcode :1994Natur.371..355B. doi :10.1038/371355a0. PMID  7522304. S2CID  4318545.
  • Allain F, Boutillon C, Mariller C, Spik G (1995). 「高特異性抗ペプチド抗体を用いたヒト血中CyPAおよびCyPBの選択的アッセイ」. J. Immunol. Methods . 178 (1): 113–20 . doi :10.1016/0022-1759(94)00249-V. PMID  7829860.
  • Price ER, Jin M, Lim D, Pati S, Walsh CT, McKeon FD (1994). 「分泌経路を通じたシクロフィリンBの輸送はシクロスポリンAの結合によって変化する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (9): 3931–5 . Bibcode :1994PNAS...91.3931P. doi : 10.1073/pnas.91.9.3931 . PMC  43696. PMID 7909608  .
  • Mikol V, Kallen J, Walkinshaw MD (1994). 「シクロフィリンB/シクロスポリン複合体のX線構造：シクロフィリンAとの比較およびカルシニューリン結合ドメインの描写」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 91 (11): 5183–6 . Bibcode :1994PNAS...91.5183M. doi : 10.1073/pnas.91.11.5183 . PMC  43956. PMID  8197205 .
  • Allain F, Denys A, Spik G (1994). 「ヒト腫瘍T細胞株におけるシクロフィリンBの表面結合部位の特性解析」J. Biol. Chem . 269 (24): 16537–40 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)89421-8 . PMID  8206968.
  • Luban J, Bossolt KL, Franke EK, Kalpana GV, Goff SP (1993). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Gagタンパク質はシクロフィリンAおよびBに結合する」. Cell . 73 (6): 1067–78 . doi :10.1016/0092-8674(93)90637-6. PMID  8513493. S2CID  38546328.
  • Braaten D, Ansari H, Luban J (1997). 「シクロフィリンの疎水性ポケットはヒト免疫不全ウイルス1型Gagポリタンパク質の結合部位である」. J. Virol . 71 (3): 2107–13 . doi :10.1128/JVI.71.3.2107-2113.1997. PMC 191305.  PMID 9032343  .
  • Montague JW, Hughes FM, Cidlowski JA (1997). 「天然組換えシクロフィリンA、B、Cはペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ活性とは独立してDNAを分解する。アポトーシスにおけるシクロフィリンの潜在的役割」J. Biol. Chem . 272 (10): 6677–84 . doi : 10.1074/jbc.272.10.6677 . PMID  9045699.
  • Denys A, Allain F, Foxwell B, Spik G (1997). 「ヒト末梢血リンパ球サブセットにおけるシクロフィリンB結合部位の分布」.免疫学. 91 (4): 609–17 . doi :10.1046/j.1365-2567.1997.00296.x. PMC  1363883. PMID  9378502 .
  • Endrich MM, Gehring H (1998). 「ヒト免疫不全ウイルス1型エンベロープタンパク質のV3ループは、ヒト血液中に存在するイムノフィリンに対する高親和性リガンドである」. Eur. J. Biochem . 252 (3): 441–6 . doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2520441.x . PMID  9546659.
  • Endrich MM, Gehrig P, Gehring H (1999). 「HIV-1カプシドタンパク質の成熟誘導性構造変化とC末端ドメインにおけるシクロフィリンに対する2つの高親和性部位の同定」J. Biol. Chem . 274 (9): 5326–32 . doi : 10.1074/jbc.274.9.5326 . PMID  10026140.
  • Bristow R, Byrne J, Squirell J, Trencher H, Carter T, Rodgers B, Saman E, Duncan J (1999). 「ヒトシクロフィリンはHIV-1組換えp55に対してp24よりも有意に高い親和性を示す」. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol . 20 (4): 334–6 . doi : 10.1097/00042560-199904010-00002 . PMID  10096576.
  • Rycyzyn MA, Reilly SC, O'Malley K, Clevenger CV (2001). 「プロラクチンシグナル伝達と核内逆転座におけるシクロフィリンBの役割」Mol. Endocrinol . 14 (8): 1175–86 . doi : 10.1210/mend.14.8.0508 . PMID  10935542.
  • ユルチェンコ V、オコナー M、ダイ WW、郭 H、ツール B、シェリー B、ブクリンスキー M (2001)。 「CD147 はシクロフィリン B のシグナル伝達受容体です」。生化学。生物物理学。解像度共通。288 (4): 786– 8. Bibcode :2001BBRC..288..786Y。土井：10.1006/bbrc.2001.5847。PMID  11688976。
  • PDBe-KBのUniProt : P23284 (ペプチジルプロリル シス-トランス イソメラーゼ B)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。
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