ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
PTPRZ1 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3JXF、3S97、5AWX
識別子 エイリアス PTPRZ1 、HPTPZ、HPTPゼータ、PTP-ゼータ、PTP18、PTPRZ、PTPZ、R-PTP-ゼータ-2、RPTPB、RPTPベータ、ホスファカン、タンパク質チロシンホスファターゼ、受容体型Z1、タンパク質チロシンホスファターゼ受容体型Z1 外部ID オミム ：176891; MGI : 97816; ホモロジーン : 2136; ジーンカード ：PTPRZ1; OMA :PTPRZ1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 6番染色体（マウス） [2] バンド 6|6 A3.1 始める 22,875,501 bp [2] 終わり 23,052,915 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 心室帯 神経節隆起 内皮細胞 扁桃体 海馬固有部I領域 視神経 尾状核 側坐核 脳梁 外淡蒼球
上位の表現 蝸牛管の前庭膜 吻側回遊流 乳頭体 中央隆起 腹内側核 小脳葉 弓状核 小脳虫部 外側中隔核 前扁桃体領域
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性 ホスファターゼ活性 タンパク質結合 タンパク質チロシンホスファターゼ活性 膜貫通受容体タンパク質チロシンホスファターゼ活性 加水分解酵素活性 インテグリン結合 細胞成分
膜の不可欠な構成要素 膜 細胞膜の不可欠な構成要素 細胞外領域 神経周縁網 細胞膜の本質的な構成要素 細胞膜 細胞外マトリックス シナプス 生物学的プロセス
軸索形成 タンパク質の脱リン酸化 オリゴデンドロサイトの分化 オリゴデンドロサイト前駆細胞の増殖の制御 中枢神経系の発達 造血前駆細胞の分化 学習または記憶 ペプチジルチロシン脱リン酸化 脱リン酸化 サイトカインを介したシグナル伝達経路 髄鞘形成の調節 ニューロンのアポトーシス過程の負の調節 オリゴデンドロサイト分化の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001206838 NM_001206839 NM_002851 NM_001369395 NM_001369396
NM_001081306 NM_011219 NM_178180 NM_001311064 NM_001361349
RefSeq（タンパク質） NP_001193767 NP_001193768 NP_002842
NP_001074775 NP_001297993 NP_001348278 NP_035349 NP_001389981 NP_001389982 NP_001389983
場所（UCSC） 7章: 121.87 – 122.06 Mb 6章: 22.88 – 23.05 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
受容体型チロシンタンパク質ホスファターゼゼータは ホスファカン としても知られ、ヒトでは PTPRZ1 遺伝子 によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子は受容体チロシンホスファターゼ ファミリーのメンバーであり、2つ の細胞質 チロシンタンパク質ホスファターゼドメイン、α-炭酸脱水酵素ドメイン、および III型フィブロネクチンドメイン を有する、1回膜貫通型I型膜タンパク質をコードし ています。異なるタンパク質アイソフォームをコードする選択的スプライスバリアントが報告されていますが、それらの全長は未だ解明されていません。 [7]
臨床的意義 この遺伝子の発現は、 胃癌 細胞、多発性硬化症病変の再髄鞘化 オリゴデンドロサイト、および 低酸素 条件下でのヒト胎児腎細胞において誘導される。 グリオーブラ ストーマ細胞では、タンパク質と転写産物の両方が過剰発現し、 接着性 遊走を促進する 。 [7]
参考文献
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さらに読む
Krueger NX, Saito H (1992). 「ヒト膜貫通型タンパク質チロシンホスファターゼPTPゼータは脳で発現しており、炭酸脱水酵素と相同性のあるN末端受容体ドメインを有する」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (16): 7417–21 . Bibcode :1992PNAS...89.7417K. doi : 10.1073/pnas.89.16.7417 . PMC 49721. PMID 1323835 . Kaplan R, Morse B, Huebner K, Croce C, Howk R, Ravera M, Ricca G, Jaye M, Schlessinger J (1990). 「3種類のヒトチロシンホスファターゼのクローニングにより、脳で発現する受容体結合型タンパク質チロシンホスファターゼの多重遺伝子ファミリーが明らかになった」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (18): 7000–4 . Bibcode :1990PNAS...87.7000K. doi : 10.1073/pnas.87.18.7000 . PMC 54670. PMID 2169617 . Krueger NX, Streuli M, Saito H (1990). 「ヒト受容体様タンパク質チロシンホスファターゼの構造多様性と進化」. EMBO J. 9 ( 10): 3241–52 . doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb07523.x. PMC 552056. PMID 2170109 . Morton SM, Veile RA, Helms C, Lee M, Kuo WL, Gray J, Donis-Keller H (1998). 「新たに同定されたYACおよびP1を用いたFISH法による7番染色体特異的発現配列タグ（EST）21個のサブリージョン局在」 Genomics . 46 (3): 491–4 . doi :10.1006/geno.1997.5051. PMID 9441757. Onyango P, Lubyova B, Gardellin P, Kurzbauer R, Weith A (1998). 「染色体1p36における5つの新規遺伝子の分子クローニングと発現解析」. Genomics . 50 (2): 187–98 . doi : 10.1006/geno.1997.5186 . PMID 9653645. サンガーセンターT、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンターT (1999). 「完全なヒトゲノム配列の解明に向けて」 Genome Res . 8 (11): 1097–108 . doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074. Maeda N, Ichihara-Tanaka K, Kimura T, Kadomatsu K, Muramatsu T, Noda M (1999). 「受容体様タンパク質チロシンホスファターゼPTPζ/RPTPβはヘパリン結合性増殖因子ミッドカインに結合する。ミッドカインのアルギニン78はPTPζへの高親和性結合に関与する」 J. Biol. Chem . 274 (18): 12474–9 . doi : 10.1074/jbc.274.18.12474 . PMID 10212223. 河内 浩, 田村 秀, 渡辺 郁, 新谷 剛, 前田 暢, 野田 正之 (1999). 「タンパク質チロシンホスファターゼζ/RPTPβはPSD-95/SAP90ファミリーと相互作用する」. Brain Res. Mol. Brain Res . 72 (1): 47– 54. doi :10.1016/S0169-328X(99)00204-1. PMID 10521598. Meng K, Rodriguez-Peña A, Dimitrov T, Chen W, Yamin M, Noda M, Deuel TF (2000). 「プレイオトロフィンシグナルは、受容体型タンパク質チロシンホスファターゼβ/ζの固有の触媒活性を不活性化することにより、β-β-カテニンのチロシンリン酸化を増加させる」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (6): 2603–8 . Bibcode :2000PNAS...97.2603M. doi : 10.1073/pnas.020487997 . PMC 15975 . PMID 10706604. 河内 浩、藤川 明、前田 暢、野田 正之 (2001). 「酵母基質捕捉システムによるタンパク質チロシンホスファターゼζ/βの基質分子としてのGIT1/Cat-1の同定」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 98 (12): 6593–8 . Bibcode :2001PNAS...98.6593K. doi : 10.1073/pnas.041608698 . PMC 34398 . PMID 11381105. Thomaidou D, Coquillat D, Meintanis S, Noda M, Rougon G, Matsas R (2001). 「可溶性NCAMおよびF3神経細胞接着分子はシュワン細胞の移動を促進する：シュワン細胞上の推定F3受容体としてタンパク質チロシンホスファターゼζ/βを同定」 J. Neurochem . 78 (4): 767– 78. doi :10.1046/j.1471-4159.2001.00454.x. PMID 11520897. S2CID 24682985. Harroch S, Furtado GC, Brueck W, Rosenbluth J, Lafaille J, Chao M, Buxbaum JD, Schlessinger J (2002). 「脱髄病変の機能回復におけるタンパク質チロシンホスファターゼ受容体Z型の重要な役割」 Nat. Genet . 32 (3): 411–4 . doi :10.1038/ng1004. PMID 12355066. S2CID 19800079. Müller S, Kunkel P, Lamszus K, Ulbricht U, Lorente GA, Nelson AM, von Schack D, Chin DJ, Lohr SC, Westphal M, Melcher T (2003). 「神経膠腫細胞の移動における受容体チロシンホスファターゼζの役割」. Oncogene . 22 (43): 6661–8 . doi : 10.1038/sj.onc.1206763 . PMID 14555979. ボノーラ E、ラム JA、バーンビー G、サイクス N、モバリー T、バイエル KS、クラウク SM、プストカ F、バッケリ E、ブラジ F、マストリーニ E、バタグリア A、ハラコポス D、ペダーセン L、イザガー T、エリクセン G、ヴィスクム B、ソレンセン EU、ブロンダム ニールセン K、コッテリル R、ファン エンゲランド H、デ ヨンジM、ケムナー C、シュテッゲハウス K、シェルペニス M、ルッター M、ボルトン PF、パー JR、プストカ A、ベイリー AJ、モナコ AP (2005)。 「染色体7q上の6つの自閉症候補遺伝子の変異スクリーニングと関連解析」。 ユーロ。 J. ハム。ジュネット 。 13 (2): 198– 207. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201315 . PMID 15523497. Polykratis A, Katsoris P, Courty J, Papadimitriou E (2005). 「ヒト内皮細胞におけるヘパリン親和性調節ペプチドシグナル伝達の特性解析」 J. Biol. Chem . 280 (23): 22454–61 . doi : 10.1074/jbc.M414407200 . PMID 15797857. Wang V, Davis DA, Haque M, Huang LE, Yarchoan R (2005). 「HEK293T細胞における低酸素誘導因子1αと低酸素誘導因子2αによる遺伝子発現の差異」 Cancer Res . 65 (8): 3299– 306. doi :10.1158/0008-5472.CAN-04-4130. PMID 15833863. Lu KV, Jong KA, Kim GY, Singh J, Dia EQ, Yoshimoto K, Wang MY, Cloughesy TF , Nelson SF, Mischel PS (2005). 「2種類のプレオトロフィンによるグリオーブラストーマの移動と増殖の異なる誘導」 J. Biol. Chem . 280 (29): 26953–64 . doi : 10.1074/jbc.M502614200 . PMID 15908427.
