| PrrF RNA | |
|---|---|
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| 識別子 | |
| シンボル | PrrF |
| Rfam | RF00444 |
| その他のデータ | |
| RNA型 | 遺伝子; sRNA |
| ドメイン | 細菌 |
| それで | SO:0000655 |
| PDB構造 | PDBe |
PrrF RNAは、鉄の恒常性維持に関与する小さな非コードRNAであり、全てのシュードモナス属細菌によってコードされています。PrrF RNAは、腸内細菌によってコードされるRyhB RNAの類似体です。細胞が鉄過剰条件下で培養されると、PrrF RNAの発現は鉄取り込み制御因子（Fur）によって抑制されます。鉄が不足すると、PrrF RNAが発現し、SodBやコハク酸脱水素酵素など、鉄含有タンパク質をコードする複数の遺伝子を負に制御します。[1]このように、PrrFの制御は、鉄が不足した際に鉄を「節約」する役割を果たします。
PrrFと毒性
緑膿菌（Pseudomonas aeruginosa ）において、PrrF RNAは、クオラムセンシング分子であるシュードモナスキノロンシグナル（PQS）の産生に必須であり、PQSは複数の病原性遺伝子の発現を活性化します。この現象は、PrrFがPQS合成の前駆体であるアントラニル酸を分解する酵素の発現を抑制することで起こります。 [2]このPQSとの調節的関係により、PrrF RNAは病原性において何らかの役割を果たすことが予測されています。
P. aeruginosaのPrrF RNAは、染色体上にタンデムに配列する2つの相同性の高い遺伝子prrF1とprrF2によってコードされている点で、他のPseudomonas属細菌とは異なります。prrF遺伝子のタンデム配列により、ヘム恒常性に関与する遺伝子を制御する、ヘム調節性を持つ3つ目の非コードRNAであるPrrHの発現が可能になっています。[3]ヘムはヒト宿主において豊富な鉄源であり、P. aeruginosaはヒトに感染を引き起こすことができる唯一のPseudomonas属細菌です。したがって、PrrH RNAはP. aeruginosaのヒト病原体としての適応性 に何らかの役割を果たしていると考えられています。
どちらのホモログもantR mRNAの翻訳を阻害し、クオラムセンシングと毒性因子の産生に影響を与える。[4]
参照
参考文献
- ^ Wilderman PJ, Sowa NA, FitzGerald DJ, FitzGerald PC, Gottesman S, Ochsner UA, Vasil ML (2004年6月). 「鉄恒常性維持に関与する緑膿菌におけるタンデム重複調節性小分子RNAの同定」.米国科学アカデミー紀要. 101 (26): 9792– 9797. Bibcode :2004PNAS..101.9792W. doi : 10.1073/pnas.0403423101 . PMC 470753. PMID 15210934 .
- ^ Oglesby, AG, Farrow, JM, 3rd, Lee, JH, Tomaras, AP, Greenberg, EP, Pesci, EC, Vasil, ML (2008). Pseudomonas aeruginosaの生理機能に対する鉄の影響：鉄とクオラムセンシングの調節的関係. J Biol Chem 283, 15558-15567. doi: 10.1074/jbc.M707840200.
- ^ Oglesby-Sherrouse, AG, Vasil, ML (2010). Pseudomonas aeruginosaのprrF遺伝子座にコードされるヘム制御性非コードRNAの特性解析. PLoS ONE 5, e9930.
- ^ Djapgne L, Panja S, Brewer LK, Gans JH, Kane MA, Woodson SA, Oglesby-Sherrouse AG (2018年5月). 「antR mRNA」. Journal of Bacteriology . 200 (10). doi :10.1128/JB.00704-17. PMC 5915787. PMID 29507088 .
外部リンク
- RfamのPrrF RNAのページ
