RNF4

RNF4
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2EA6、2XEU、4PPE
識別子
エイリアス	RNF4、SLX5、SNURF、RES4-26、リングフィンガータンパク質4
外部ID	オミム：602850; MGI : 1201691;ホモロジーン: 37711;ジーンカード：RNF4; OMA :RNF4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 4番染色体（ヒト）[1] バンド 4p16.3 始める 2,462,220 bp [1] 終わり 2,625,320 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 5番染色体（マウス）[2] バンド 5|5 B2 始める 34,493,633 bp [2] 終わり 34,512,973 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 胸腺 卵母細胞 中側頭回 結腸上皮 扁桃腺 二次卵母細胞 骨髄細胞 リンパ節 ベータ細胞 子宮内膜間質細胞 上位の表現 精細管 接合子 乳腺 積雲細胞 回腸上皮 二次卵母細胞 足首関節 卵黄嚢 精子細胞 胚葉上層 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 DNA結合転写因子活性 転写コアクチベーター活性 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 タンパク質結合 アンドロゲン受容体結合 同一のタンパク質結合 ヌクレオソーム結合 トランスフェラーゼ活性 転写因子結合 SUMOポリマー結合 亜鉛イオン結合 核受容体コアクチベーター活性 細胞成分 細胞質 PML本体 核質 核 生物学的プロセス アンドロゲン受容体シグナル伝達経路 転写の制御、DNAテンプレート タンパク質K63結合ユビキチン化 ヒ素含有物質に対する反応 転写、DNAテンプレート 転写の正の制御、DNAテンプレート タンパク質K11結合ユビキチン化 キネトコアの組み立ての調節 タンパク質K48結合ユビキチン化 タンパク質K6結合ユビキチン化 タンパク質のユビキチン化 スピンドルアセンブリの調整 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス タンパク質の自己ユビキチン化 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6047 19822 アンサンブル ENSG00000063978 ENSMUSG00000029110 ユニプロット P78317 Q9QZS2 RefSeq (mRNA) NM_002938 NM_001185009 NM_001185010 NM_011278 NM_001304269 NM_001304270 RefSeq（タンパク質） NP_001171938 NP_001171939 NP_002929 NP_001291198 NP_001291199 NP_035408 場所（UCSC） 4号線: 2.46 – 2.63 Mb 5章: 34.49 – 34.51 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

RINGフィンガータンパク質4は、ヒトではRNF4遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6]}

この遺伝子によってコードされるタンパク質はRINGフィンガードメインを含み、転写因子として作用する。このタンパク質は、 GATAを介した転写を抑制する転写抑制因子であるTRPS1と相互作用し、その活性を阻害することが示されている。転写抑制因子ZNF278/ PATZ1はこのタンパク質と相互作用し、このタンパク質を介したアンドロゲン受容体依存性転写の促進を抑制することが分かっている。マウスおよびラットにおける対照実験では、このタンパク質が精子形成において役割を果たしていることが示唆されている。^[6]

相互作用

RNF4はTCF20 ^[7]、PATZ1 ^{[8] [9]}、アンドロゲン受容体^{[9] [10] [11]}と相互作用することが示されている。RNF4はWRN阻害後のMSI-H細胞におけるウェルナー症候群ヘリカーゼの分解に関与することが示されている。^[12]

参照

• 薬指ドメイン

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000063978 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029110 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Chiariotti L, Benvenuto G, Fedele M, Santoro M, Simeone A, Fusco A, Bruni CB (1998年1月). 「4p16.3にマッピングされた新規RINGフィンガー遺伝子（RNF4）の同定と特性評価」. Genomics . 47 (2): 258–65 . doi :10.1006/geno.1997.5105. PMID  9479498.
6. 「Entrez Gene: RNF4 リングフィンガータンパク質 4」。
7. リンソー C、ブテイラー G、ダムガード CK、リョム D、サンチェス＝ムニョス S、ノルビー PL、ボンベン BJ、ヨルゲンセン P (2000 年 8 月)。 「転写因子SPBPと正の補因子RNF4の間の相互作用。タンパク質結合ジンクフィンガー間の相互作用」。生物化学ジャーナル。275 (34): 26144– 9.土井: 10.1074/jbc.M003405200。PMID  10849425。
8. Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (2000年3月). 「BTB/POZファミリーの新規メンバーであるPATZは、RNF4リングフィンガータンパク質と会合し、転写抑制因子として機能する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (11): 7894–901 . doi : 10.1074/jbc.275.11.7894 . PMID  10713105.
9. Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (2002年2月). 「PATZはRNF4を介したアンドロゲン受容体依存性転写の促進を減弱させる」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (5): 3280–5 . doi : 10.1074/jbc.M109491200 . PMID  11719514.
10. モイラネン AM、ポウッカ H、カルヴォネン U、ハックリ M、ヤンネ OA、パルビモ JJ (1998 年 9 月)。 「ステロイド受容体媒介遺伝子転写における補調節因子としての新規RINGフィンガータンパク質の同定」。分子および細胞生物学。18 (9): 5128–39 .土井:10.1128/mcb.18.9.5128。PMC 109098。PMID  9710597。 
11. Poukka H, Aarnisalo P, Santti H, Jänne OA, Palvimo JJ (2000年1月). 「Coregulator small nuclear RING finger protein (SNURF) は、異なるメカニズムによってSp1受容体およびステロイド受容体を介した転写を促進する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 571–9 . doi : 10.1074/jbc.275.1.571 . PMID  10617653.
12. Rodríguez Pérez F, Natwick D, Schiff L, McSwiggen D, Heckert A, Huey M, Morrison H, Loo M, Miranda RG, Filbin J, Ortega J, Van Buren K, Murnock D, Tao A, Butler R, Cheng K, Tarvestad W, Zhang Z, Gonzalez E, Miller RM, Kelly M, Tang Y, Ho J, Anderson D, Bashore C, Basham S (2024年7月). 「WRN阻害はPIAS4-RNF4-p97/VCP軸を介してクロマチン関連分解を引き起こす」. Nat. Commun . 15 (6059). doi : 10.1038/s41467-024-50178-3 . PMC 11258360. PMID  39025847 . 

さらに読む

• モイラネン AM、ポウッカ H、カルヴォネン U、ハックリ M、ヤンネ OA、パルビモ JJ (1998 年 9 月)。 「ステロイド受容体媒介遺伝子転写における補調節因子としての新規RINGフィンガータンパク質の同定」。分子および細胞生物学。18 (9): 5128–39 .土井:10.1128/mcb.18.9.5128。PMC  109098。PMID  9710597。
• 秦野 聡、石田 雄三、池田 純一 (1998年6月). 「ヒト染色体4p16.3上のハンチントン病遺伝子近傍に位置する5つの新規転写産物の一次構造とゲノム構成」. DNA Research . 5 (3): 177–86 . doi : 10.1093/dnares/5.3.177 . PMID  9734812.
• Poukka H, Aarnisalo P, Santti H, Jänne OA, Palvimo JJ (2000年1月). 「Coregulator small nuclear RING finger protein (SNURF) は、異なるメカニズムでSp1受容体およびステロイド受容体を介した転写を促進する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 571–9 . doi : 10.1074/jbc.275.1.571 . PMID  10617653.
• Fedele M, Benvenuto G, Pero R, Majello B, Battista S, Lembo F, Vollono E, Day PM, Santoro M, Lania L, Bruni CB, Fusco A, Chiariotti L (2000年3月). 「BTB/POZファミリーの新規メンバーであるPATZは、RNF4リングフィンガータンパク質と会合し、転写抑制因子として機能する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (11): 7894–901 . doi : 10.1074/jbc.275.11.7894 . PMID  10713105.
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• リンソー C、ブテイラー G、ダムガード CK、リョム D、サンチェス・ムニョス S、ノルビー PL、ボンベン BJ、ヨルゲンセン P (2000 年 8 月)。 「転写因子SPBPと正の補因子RNF4の間の相互作用。タンパク質結合ジンクフィンガー間の相互作用」。生物化学ジャーナル。275 (34): 26144– 9.土井: 10.1074/jbc.M003405200。PMID  10849425。
• ヘクリ M、カルボネン U、ヤンネ OA、パルビモ JJ (2001 年 6 月)。 「リングフィンガータンパク質SNURFは、DNA結合活性を有する二機能性タンパク質です。」生物化学ジャーナル。276 (26): 23653–60 .土井: 10.1074/jbc.M009891200。PMID  11319220。
• Saville B, Poukka H, Wormke M, Janne OA, Palvimo JJ, Stoner M, Samudio I, Safe S (2002年1月). 「SNURFとTATA結合タンパク質によるZR-75ヒト乳がん細胞におけるエストロゲン受容体αの協調的共活性化」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (4): 2485–97 . doi : 10.1074/jbc.M109021200 . PMID  11696545.
• Pero R, Lembo F, Palmieri EA, Vitiello C, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (2002年2月). 「PATZはRNF4を介したアンドロゲン受容体依存性転写の促進を減弱させる」. The Journal of Biological Chemistry . 277 (5): 3280–5 . doi : 10.1074/jbc.M109491200 . PMID  11719514.
• ヤン W、ヒルボネン サンティ SJ、パルビモ JJ、トッパリ J、ヤンネ OA (2002 年 10 月)。 「ラットの精巣発生中の核RINGフィンガータンパク質SNURF/RNF4の発現は、精子細胞の成熟における役割を示唆している。」発達のメカニズム。118 ( 1–2 ): 247–53 .土井: 10.1016/S0925-4773(02)00261-7。PMID  12351196。S2CID 15579434  。
• Pero R, Lembo F, Chieffi P, Del Pozzo G, Fedele M, Fusco A, Bruni CB, Chiariotti L (2003年9月). 「新規精巣特異的RNF4転写産物の翻訳制御」. Molecular Reproduction and Development . 66 (1): 1– 7. doi :10.1002/mrd.10322. PMID  12874792. S2CID  6206480.
• Kaiser FJ, Möröy T, Chang GT, Horsthemke B, Lüdecke HJ (2003年10月). 「転写の共制御因子であるRINGフィンガータンパク質RNF4は、転写因子TRPS1と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (40): 38780–5 . doi : 10.1074/jbc.M306259200 . PMID  12885770.
• Lin DY, Fang HI, Ma AH, Huang YS, Pu YS, Jenster G, Kung HJ, Shih HM (2004年12月). 「Daxxによるアンドロゲン受容体転写活性の負の調節」. Molecular and Cellular Biology . 24 (24): 10529–41 . doi :10.1128/MCB.24.24.10529-10541.2004. PMC  533990. PMID 15572661  .

外部リンク

• RNF4+タンパク質、+ヒト 米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH）