ヒトに存在するタンパク質
| RPL35 |
|---|
|
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
4UG0、4V6X、5AJ0、4V5Z、4UJD、4D67、4D5Y、4UJE、4UJC |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | RPL35、L35、リボソームタンパク質L35、DBA19 |
|---|
| 外部ID | オミム：618315; MGI : 1913739;ホモロジーン: 31432;ジーンカード：RPL35; OMA :RPL35 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置（マウス） |
|---|
 | | キリスト | 染色体2（マウス）[2] |
|---|
| | バンド | 2|2 B | 始める | 38,891,592 bp [2] |
|---|
| 終わり | 38,895,636 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
|---|
| 上位の表現 | - 腹部の皮膚
- 脚の皮膚
- 太ももの皮膚
- 下垂体前葉
- 右精巣
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 左精巣
- 左卵巣
- 右卵管
- ヒップの皮膚
|
| | 上位の表現 | - 膀胱
- 卵巣
- 性器結節
- 胚
- 神経管
- 胚
- 副腎
- 胎盤
- 白色脂肪組織
- 骨髄
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS | |
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- mRNA結合
- RNA結合
- リボソームの構造構成要素
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- リボソーム
- 膜
- 細胞内解剖学的構造
- 核小体
- 細胞質大リボソームサブユニット
| | 生物学的プロセス |
- ウイルス転写
- SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化
- トリシストロン性rRNA転写産物（SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA）からのLSU-rRNAの成熟
- 翻訳開始
- 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解
- rRNA処理
- タンパク質生合成
| | 出典：Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
60Sリボソームタンパク質L35は、ヒトではRPL35遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
リボソームはタンパク質合成を触媒する細胞小器官であり、小さな40Sサブユニットと大きな60Sサブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類のRNAと約80種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、 60Sサブユニットを構成するリボソームタンパク質をコードしています。このタンパク質はリボソームタンパク質のL29Pファミリーに属し、細胞質に局在しています。リボソームタンパク質をコードする遺伝子に典型的に見られるように、この遺伝子には複数の処理済み擬遺伝子がゲノム中に散在しています。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000136942 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000062997 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 上地 剛志、田中 剛志、剣持 暢志 (2001年6月). 「ヒトリボソームタンパク質遺伝子の完全地図：80遺伝子の細胞遺伝学的地図への割り当てとヒト疾患への影響」.ゲノミクス. 72 (3): 223– 230. doi :10.1006/geno.2000.6470. PMID 11401437.
- ^ ab 「Entrez Gene: RPL35 リボソームタンパク質 L35」。
外部リンク
さらに読む
- Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). 「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」.生化学と細胞生物学. 73 ( 11–12 ): 933–947 . doi :10.1139/o95-101. PMID 8722009.
- Ou JH, Yen TS, Wang YF, Kam WK, Rutter WJ (1987年11月). 「胎児細胞および腫瘍細胞における発現増強を示すヒトリボソームタンパク質遺伝子のクローニングと特性解析」. Nucleic Acids Research . 15 (21): 8919– 8934. doi :10.1093/nar/15.21.8919. PMC 306413. PMID 2891103 .
- 加藤 聡、関根 誠、Oh SW、Kim NS、梅澤 雄二、阿部 暢、他 (1994年12月). 「ヒト完全長cDNAバンクの構築」. Gene . 150 (2): 243– 250. doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID 7821789.
- 的場 亮, 大久保 健, 堀 暢, 福島 明, 松原 健 (1994年9月). 「3'末端cDNAライブラリーへの5'末端コーディング情報の付加は遺伝子発現解析を改善する」.遺伝子. 146 (2): 199– 207. doi :10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, 他 (哺乳類遺伝子収集プログラムチーム) (2002年12月). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Odintsova TI, Muller EC, Ivanov AV, Egorov TA, Bienert R, Vladimirov SN, et al. (2003年4月). 「ヒト大細胞質リボソームサブユニットタンパク質の質量分析およびエドマンシークエンシングによる翻訳後修飾の特性評価と解析」. Journal of Protein Chemistry . 22 (3): 249– 258. doi :10.1023/A:1025068419698. PMID 12962325. S2CID 10710245.
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, et al. (2004年2月). 「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」. Nature Cell Biology . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, et al. (2005年1月). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 (7021): 77– 83. Bibcode :2005Natur.433...77A. doi :10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Oh JH, Yang JO, Hahn Y, Kim MR, Byun SS, Jeon YJ, et al. (2005年12月). 「ヒト胃癌のトランスクリプトーム解析」. Mammalian Genome . 16 (12): 942– 954. doi :10.1007/s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, et al. (2007). 「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」. Molecular Systems Biology . 3 (1) 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
