60S酸性リボソームタンパク質P1

RPLP1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2LBF、4BEH、4V6X、%%s4V6X、4BEH
識別子
エイリアス	RPLP1、LP1、P1、RPP1、リボソームタンパク質側方茎サブユニットP1
外部ID	オミム：180520; MGI : 1927099;ホモロジーン: 133573;ジーンカード：RPLP1; OMA :RPLP1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 15番染色体（ヒト）[1] バンド 15q23 始める 69,452,814 bp [1] 終わり 69,456,205 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 9番染色体（マウス）[2] バンド 9|9 B 始める 61,820,566 bp [2] 終わり 61,821,824 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 気管支上皮 胸腺 気管 滑膜 大腿四頭筋 脊髄神経節 外側広筋 骨髄細胞 脚の皮膚 腹部の皮膚 上位の表現 胚 胚葉上層 リップ 胚 脾臓 膀胱 心室帯 胸腺 レンズ 骨髄 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 リボソームの構造構成要素 タンパク質結合 タンパク質キナーゼ活性化因子活性 リボ核タンパク質複合体結合 細胞成分 細胞質 リボソーム 焦点接着 細胞内解剖学的構造 細胞質大リボソームサブユニット 細胞外エクソソーム 生物学的プロセス ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 翻訳開始 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 並進伸長 タンパク質キナーゼ活性の活性化 細胞質翻訳 タンパク質キナーゼ活性の正の調節 タンパク質生合成 rRNA処理 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6176 56040 アンサンブル ENSG00000137818 ENSMUSG00000007892 ユニプロット P05386 P47955 RefSeq (mRNA) NM_213725 NM_001003 NM_018853 RefSeq（タンパク質） NP_000994 NP_998890 NP_000994.1 NP_061341 場所（UCSC） 15章: 69.45 – 69.46 Mb 9章: 61.82 – 61.82 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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60S酸性リボソームタンパク質P1は、ヒトではRPLP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]

関数

リボソームは、タンパク質合成を触媒する細胞小器官で、小さな40Sサブユニットと大きな60Sサブユニットから構成されています。これらのサブユニットは、4種類のRNAと約 80 種類の構造的に異なるタンパク質で構成されています。この遺伝子は、60S サブユニットの構成要素であるリボソームリンタンパク質をコードしています。このタンパク質は、大腸菌のL7 / L12リボソームタンパク質と機能的に同等であり、リボソームタンパク質の L12P ファミリーに属しています。これは、タンパク質合成の伸長段階で重要な役割を果たします。ほとんどのリボソームタンパク質が塩基性であるのに対し、コードされているタンパク質は酸性です。その C 末端は、リボソームリンタンパク質P0およびP2の C 末端とほぼ同じです。P1 タンパク質は、P0 および P2 と相互作用して、P1 および P2 の二量体と P0 単量体からなる五量体複合体を形成できます。このタンパク質は細胞質に局在する。異なるタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが観察されている。リボソームタンパク質をコードする遺伝子に典型的であるように、この遺伝子にはゲノム中に複数の処理された擬遺伝子が散在している。 ^[5]

相互作用

RPLP1はRPLP2と相互作用することが示されている。^[6]

RPLP1はCSFV（豚インフルエンザ）と結合することも発見されており、ウイルスの拡散速度に寄与している可能性がある。^[7]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000137818 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000007892 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. "Entrez Gene: RPLP1 リボソームタンパク質、ラージ、P1".
6. Tchórzewski M, Boldyreff B, Issinger OG, Grankowski N (2000年7月). 「ヒト酸性リボソームPタンパク質間のタンパク質間相互作用の解析：2ハイブリッドシステムによる評価」. The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 32 (7): 737–46 . doi :10.1016/S1357-2725(00)00017-0. PMID  10856704.
7. チャン・ロンシャン、リン・ジフイ、ウェン・マオヤン、イン・ウェン、チャン・ヤンミン、ウェン・デン。 「NS4B相互作用タンパク質であるRPLP1は、ウイルスゲノムの翻訳を促進することによりCSFVの産生を増強します。」毒性。

さらに読む

• Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). 「哺乳類リボソームタンパク質の構造と進化」.生化学と細胞生物学. 73 ( 11–12 ): 933–47 . doi :10.1139/o95-101. PMID  8722009.
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• 加藤 聡、関根 誠、Oh SW、Kim NS、梅澤 勇、阿部 暢、横山（小林） 正治、青木 剛（1994年12月）「ヒト完全長cDNAバンクの構築」Gene . 150 (2): 243–50 . doi :10.1016/0378-1119(94)90433-2. PMID  7821789.
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外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : P05386 (60S 酸性リボソームタンパク質 P1)のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要。