ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| RSF1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | RSF1、HBXAP、RSF-1、XAP8、p325、リモデリングおよびスペーシング因子1 |
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| 外部ID | オミム:608522; MGI : 2682305;ホモロジーン:41142;ジーンカード:RSF1; OMA :RSF1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 7番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 7|7 E1 | 始める | 97,229,096 bp [2] |
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| 終わり | 97,341,985 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - アキレス腱
- 内淡蒼球
- 腓骨神経
- 結腸上皮
- 上腕二頭筋腱
- 小脳虫部
- ブロードマン野23
- 網状部
- 中側頭回
- 外淡蒼球
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| | 上位の表現 | - 手
- 吻側回遊流
- 胚の尾
- 性器結節
- 腹内側核
- 外側中隔核
- 耳石器官
- 嗅結節
- 卵形嚢
- 上顎突出
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヒストン結合
- ATPase活性
- タンパク質結合
- 金属イオン結合
- ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 |
- RSF複合体
- 核
- 核質
- ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体
| | 生物学的プロセス |
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- DNA結合の負の調節
- クロマチンリモデリング
- ウイルス転写の正の制御
- 転写の負の制御、DNAテンプレート
- 転写の制御、DNAテンプレート
- CENP-Aを含むクロマチンアセンブリ
- 転写、DNAテンプレート
- DNAテンプレート転写、開始
- ヌクレオソームの組み立て
- クロマチン組織
- ヒストンのアセチル化
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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リモデリングおよびスペーシング因子1は、ヒトではRSF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
HBXAPは転写抑制、 B型肝炎ウイルスXタンパク質(HBX)と関連する転写共活性化、およびSNF2H(MIM 603375)と関連するクロマチンリモデリングとスペーシングに関与している。[OMIM提供] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000048649 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000035623 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Shamay M, Barak O, Doitsh G, Ben-Dor I, Shaul Y (2002年3月). 「B型肝炎ウイルスpXはPHDフィンガータンパク質HBXAPと相互作用し、転写を共活性化する」. J Biol Chem . 277 (12): 9982–8 . doi : 10.1074/jbc.M111354200 . PMID 11788598.
- ^ Loyola A, Huang JY, LeRoy G, Hu S, Wang YH, Donnelly RJ, Lane WS, Lee SC, Reinberg D (2003年9月). 「クロマチンアセンブリ因子RSFのサブユニットの機能解析」. Mol Cell Biol . 23 (19): 6759–68 . doi :10.1128/MCB.23.19.6759-6768.2003. PMC 193931. PMID 12972596 .
- ^ ab 「Entrez Gene: RSF1 リモデリングとスペーシング因子 1」。
さらに読む
- Lee TH, Elledge SJ, Butel JS (1995). 「B型肝炎ウイルスXタンパク質は細胞内DNA修復タンパク質と相互作用する」J. Virol . 69 (2): 1107–14 . doi :10.1128/JVI.69.2.1107-1114.1995. PMC 188683. PMID 7815490 .
- LeRoy G, Orphanides G, Lane WS, Reinberg D (1998). 「in vitroクロマチンテンプレートの転写におけるRSFとFACTの必要性」. Science . 282 (5395): 1900–4 . doi :10.1126/science.282.5395.1900. PMID 9836642.
- Shamay M, Barak O, Shaul Y (2002). 「新規PHDフィンガータンパク質HBXAPは転写抑制活性を有する」. Genomics . 79 (4): 523–9 . doi :10.1006/geno.2002.6717. PMID 11944984.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Obuse C, Yang H, Nozaki N, et al. (2004). 「HeLa細胞間期におけるセントロメア複合体のプロテオミクス解析:UV損傷DNA結合タンパク質1(DDB-1)はCEN複合体の構成要素であり、BMI-1は間期においてセントロメア領域と一時的に共局在する」. Genes Cells . 9 (2): 105–20 . doi : 10.1111/j.1365-2443.2004.00705.x . PMID 15009096. S2CID 21813024.
- Huang JY, Shen BJ, Tsai WH, Lee SC (2004). 「核マトリックス関連HBXAPとNF-κBの機能的相互作用」. Exp. Cell Res . 298 (1): 133– 43. doi :10.1016/j.yexcr.2004.04.019. PMID 15242768.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Shih IeM, Sheu JJ, Santillan A, et al. (2005). 「卵巣癌におけるクロマチンリモデリング遺伝子Rsf-1/HBXAPの増幅」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 102 (39): 14004–9 . Bibcode :2005PNAS..10214004S. doi : 10.1073/pnas.0504195102 . PMC 1236547. PMID 16172393 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). 「確率に基づくアプローチによるハイスループットタンパク質リン酸化解析と部位局在化」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92 . doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.