SH3RF1

SH3RF1
識別子
エイリアス	SH3RF1、POSH、RNF142、SH3MD2、リングフィンガー1を含むSH3ドメイン
外部ID	MGI : 1913066; HomoloGene : 10988; GeneCards : SH3RF1; OMA :SH3RF1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 4番染色体（ヒト）[1] バンド 4q32.3-q33 始める 1億6909万4259塩基対[1] 終わり 1億6927万956塩基対[1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 8番染色体（マウス）[2] バンド 8|8 B3.1 始める 61,676,906 bp [2] 終わり 61,849,105 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 膵臓上皮細胞 回腸粘膜 眼瞼結膜 膵管細胞 内皮細胞 胚上皮 心室帯 結腸粘膜 小腸粘膜 副鼻腔粘膜 上位の表現 輸出管 精嚢 前庭感覚上皮 内側神経節隆起 一次卵母細胞 結膜円蓋 精管 二次卵母細胞 網膜色素上皮 毛様体 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質結合 金属イオン結合 トランスフェラーゼ活性 MAPキナーゼ足場活性 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 細胞成分 細胞質 細胞質の核周囲領域 細胞質 ゴルジ体 細胞投影 ラメリポディウム 生物学的プロセス 外因性アポトーシスシグナル伝達経路の負の制御 アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の負の制御 アポトーシス過程の負の調節 JNKカスケードの制御 タンパク質のユビキチン化 アポトーシス過程 ニューロンの移動 CD4陽性α-βT細胞分化の調節 タンパク質の自己ユビキチン化 CD8陽性αβT細胞増殖の調節 JNKカスケードの正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 57630 59009 アンサンブル ENSG00000154447 ENSMUSG00000031642 ユニプロット Q7Z6J0 Q69ZI1 RefSeq (mRNA) NM_020870 NM_021506 NM_198678 RefSeq（タンパク質） NP_065921 NP_067481 場所（UCSC） 4章: 169.09 – 169.27 MB 8章: 61.68 – 61.85 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
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推定E3ユビキチンタンパク質リガーゼSH3RF1は、ヒトではSH3RF1遺伝子によってコードされる酵素である。^{[5] [6]}

関数

この遺伝子は、N末端RINGフィンガー、4つのSH3ドメイン、およびRho GTPase Racの結合に関与する領域を含むタンパク質をコードしています。RINGフィンガーを介して、コードされたタンパク質は、トランスゴルジ体ネットワークにおけるタンパク質選別に関与するユビキチンタンパク質リガーゼとして機能することが示されています。また、コードされたタンパク質は、c-Jun N末端キナーゼシグナル伝達経路の足場として機能し、機能的なシグナル伝達モジュールの形成を促進する可能性があります。^[6]

相互作用

SH3RF1はAKT2 ^[7]およびMAP3K11 ^[7]と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000154447 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031642 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Tapon N, Nagata K, Lamarche N, Hall A (1998年4月). 「新規RAC標的POSHは、JNKおよびNF-κBシグナル伝達経路に関与するSH3含有足場タンパク質である」. EMBO J. 17 ( 5): 1395– 404. doi :10.1093/emboj/17.5.1395. PMC 1170487. PMID  9482736 . 
6. "Entrez Gene: リングフィンガー1を含むSH3RF1 SH3ドメイン".
7. Figueroa C, Tarras S, Taylor J, Vojtek AB (2003年11月). 「Akt2はPOSH-MLK-JNKシグナル伝達複合体の集合を負に制御する」. J. Biol. Chem . 278 (48): 47922–7 . doi : 10.1074/jbc.M307357200 . PMID  14504284.

さらに読む

• Lyons TR, Thorburn J, Ryan PW, Thorburn A, Anderson SM, Kassenbrock CK (2007). 「Aktによるアポトーシス誘導性足場タンパク質POSHの制御」. J. Biol. Chem . 282 (30): 21987–97 . doi : 10.1074/jbc.M704321200 . PMID  17535800.
• 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根M、釣谷和、若栗H、石井S、杉山隆、斉藤和、磯野Y、入江R、櫛田N、米山隆、大塚R、神田K、横井隆、近藤H、我妻M、村川隆、石田S、石橋隆、高橋・藤井A、棚瀬隆、永井和、菊池英、中井和、磯貝 哲、菅野 S (2006) 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム解析16 (1): 55–65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC  1356129。PMID  16344560。
• アルロイ I、トゥヴィア S、グリーナー T、ゴードン D、バー HM、タグリヒト D、マンディル レビン R、ベン アブラハム D、コンフォルティ D、ニル A、レビウス O、ビコヴィスキー V、ドリ M、コーエン S、ヤール L、エレズ O、プロフェタ メイラン O、コスカス M、カスピ バシャール E、アルチャナティ I、セラ ブラウン A、モスコウィッツH、テスマー U、シューベルト U、リース Y (2005)。 「トランスゴルジネットワークに関連するヒトユビキチンタンパク質リガーゼPOSHは、HIV 1型の産生に不可欠です。」手順国立アカド。科学。アメリカ。102 (5): 1478–83。ビブコード:2005PNAS..102.1478A。doi : 10.1073/pnas.0408717102 . PMC  545085 . PMID  15659549 .
• Figueroa C, Tarras S, Taylor J, Vojtek AB (2003). 「Akt2はPOSH-MLK-JNKシグナル伝達複合体の集合を負に制御する」J. Biol. Chem . 278 (48): 47922–7 . doi : 10.1074/jbc.M307357200 . PMID  14504284.
• 中山 正之、菊野 亮、小原 修 (2002). 「巨大タンパク質間のタンパク質間相互作用：長鎖cDNAからなる機能分類ライブラリーを用いた2ハイブリッドスクリーニング」Genome Res . 12 (11): 1773–84 . doi :10.1101/gr.406902. PMC 187542.  PMID 12421765  .
• 永瀬 剛志、菊野 亮、石川 健、広澤 正之、小原 修 (2000). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVII. 脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列（in vitroで巨大タンパク質をコードする）. DNA Res . 7 (2): 143–50 . doi : 10.1093/dnares/7.2.143 . PMID  10819331.