SNX4

SNX4
識別子
エイリアス	SNX4、ATG24B、nexin 4のソート
外部ID	オミム: 605931 ; MGI : 1916400 ;ホモロジーン: 36143 ;ジーンカード：SNX4 ; OMA : SNX4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3q21.2 始める 1億2544万6650年前[ 1 ] 終わり 125,520,202 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 16番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 16|16 B3 始める 33,071,812 bp [ 2 ] 終わり 33,120,639 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 二次卵母細胞 小腸粘膜 アキレス腱 腎臓尿細管 神経節隆起 心室帯 ランゲルハンス島 十二指腸 脈絡叢上皮 上腕二頭筋腱 上位の表現 房室弁 左肺葉 心内膜クッション 坐骨神経 顆粒球 卵黄嚢 前庭感覚上皮 尿管 原始的な条線 接合子 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 インスリン受容体結合 レプチン受容体結合 上皮成長因子受容体結合 タンパク質結合 ホスファチジルイノシトール結合 トランスフェリン受容体結合 脂質結合 細胞成分 細胞質 膜の外因性成分 エンドソーム 初期エンドソーム膜 膜 細胞膜 SNARE複合体 細胞質ダイニン複合体 タンパク質含有複合体 初期エンドソーム 生物学的プロセス エンドサイトーシス 小胞組織 エンドサイトーシスリサイクル タンパク質輸送 肥満細胞によるヒスタミン分泌の正の調節 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 8723 69150 アンサンブル ENSG00000114520 ENSMUSG00000022808 ユニプロット O95219 Q91YJ2 RefSeq (mRNA) NM_003794 NM_080557 RefSeq（タンパク質） NP_003785 NP_542124 場所（UCSC） 3 章: 125.45 – 125.52 Mb 16章: 33.07 – 33.12 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ソーティングネキシン4は、ヒトではSNX4遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

この遺伝子はソーティングネキシンファミリーのメンバーをコードしています。このファミリーのメンバーは、ホスホイノシチド結合ドメインであるフォックス（PX）ドメインを含み、細胞内輸送に関与しています。このタンパク質は、細胞培養においてレプチン受容体の長鎖アイソフォーム、および血小板由来成長因子、インスリン、上皮成長因子の受容体チロシンキナーゼと会合しますが、その機能は不明です。このタンパク質は、ファミリーのメンバーとオリゴマー複合体を形成する可能性があります。^{[ 6 ]}

相互作用

SNX4はBIN1と相互作用することが示されている。^{[ 7 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000114520 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000022808 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Haft CR, de la Luz Sierra M, Barr VA, Haft DH, Taylor SI (1998年12月). 「ソーティングネキシン分子ファミリーの同定と受容体との関連の特徴づけ」 . Mol Cell Biol . 18 (12): 7278–87 . doi : 10.1128/mcb.18.12.7278 . PMC 109309. PMID 9819414 .  
6. 「Entrez Gene: SNX4 ソーティングネキシン 4」。
7. Leprince, Corinne; Le Scolan Erwan; Meunier Brigitte; Fraisier Vincent; Brandon Nathalie; De Gunzburg Jean; Camonis Jacques (2003年5月). 「ソーティングネキシン4とアンフィフィシン2：エンドサイトーシスと細胞内輸送の新たな連携」 . J. Cell Sci . 116 (Pt 10). イギリス: 1937– 1948. doi : 10.1242/jcs.00403 . ISSN 0021-9533 . PMID 12668730 .  

さらに読む

• Traer CJ, Rutherford AC, Palmer KJ, et al. (2008). 「SNX4はTfnRのエンドソーム選別とダイニンを介したエンドサイトーシスリサイクリングコンパートメントへの輸送を調整する」Nat . Cell Biol . 9 (12): 1370–80 . doi : 10.1038/ncb1656 . PMID  17994011. S2CID  23816176 .
• Skånland SS, Wälchli S, Utskarpen A, et al. (2007). 「ホスホイノシチド制御によるリシンの逆行輸送：hVps34とソーティングネキシン間のクロストーク」. Traffic . 8 ( 3): 297– 309. doi : 10.1111/j.1600-0854.2006.00527.x . hdl : 10852/11339 . PMID  17319803. S2CID  21600584 .
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC  528928. PMID 15489334  .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039 .
• Leprince C, Le Scolan E, Meunier B, et al. (2004). 「ソーティングネキシン4とアンフィフィシン2：エンドサイトーシスと細胞内輸送の新たな連携」 . J. Cell Sci . 116 (Pt 10): 1937–48 . doi : 10.1242/jcs.00403 . PMID  12668730 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Parks WT, Frank DB, Huff C, et al. (2001). 「新規SNXであるソーティングネキシン6は、受容体型セリン・スレオニンキナーゼであるトランスフォーミング成長因子βファミリーと相互作用する」 . J. Biol. Chem . 276 (22): 19332–9 . doi : 10.1074/jbc.M100606200 . PMID  11279102 .