ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
スピンク5 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1H0Z、1HDL、1UUC、1UVF、1UVG
識別子 エイリアス SPINK5 、LEKTI、LETKI、NETS、NS、VAKTI、セリンペプチダーゼ阻害剤、カザール 5 型、セリンペプチダーゼ阻害剤 カザール 5 型 外部ID オミム :605010; MGI : 1919682; ホモロジーン : 4987; ジーンカード :SPINK5; OMA :SPINK5 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) キリスト 18番染色体(マウス) [2] バンド 18 B3|18 23.74 cM 始める 44,096,302 bp [2] 終わり 44,155,568 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) 上位の表現 外陰部 歯茎 太ももの皮膚 歯肉上皮 口腔 咽頭粘膜 人間のペニス ヒップの皮膚 腕の皮膚 舌体
上位の表現 腹部の皮膚 食道 外耳の皮膚 リップ 背中の皮膚 前立腺 前立腺の葉 臍帯 左肺葉 胃
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
ペプチダーゼ阻害活性
セリン型エンドペプチダーゼ阻害活性
細胞成分
細胞質
細胞質
小胞体膜
細胞皮質
小胞体
細胞質の核周囲領域
表皮層状体
細胞外領域
細胞内膜小器官
生物学的プロセス
表皮細胞の分化
タンパク質分解の負の調節
セリン型ペプチダーゼ活性の負の制御
ペプチダーゼ活性の負の調節
上皮細胞の分化
有毛細胞の分化
細胞外マトリックスの組織化
抗菌ペプチド産生の負の調節
免疫反応の負の調節
細胞接着の調節
血管新生の負の調節
セリン型エンドペプチダーゼ活性の負の制御
T細胞分化の調節
角質化
成長期のタイミングの調節
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001127698 NM_001127699 NM_006846
RefSeq(タンパク質) NP_001121170 NP_001121171 NP_006837
場所(UCSC) 5章: 148.03 – 148.14 Mb 18章: 44.1 – 44.16 MB PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
リンパ上皮カザール型関連阻害剤 (LEKTI)は、 セリンプロテアーゼ阻害剤カザール型5 (SPINK5)としても知られ 、ヒトでは SPINK5 遺伝子によってコードされる タンパク質 です。 [5] [6]
構造と機能
LEKTIは、重層上皮組織に発現する大型のマルチ ドメインセリンプロテアーゼ 阻害剤 です。15個のドメインから構成され、プロテアーゼである フューリン によってより小さな機能的断片に切断されます。これらのドメインのうち、2つ(ドメイン2と15)のみが、 カザール型関連阻害剤 の特徴である3つの分子内 ジスルフィド結合 を形成する6つの等間隔の システインを 含んでいます。残りのドメインは4つのシステインを含んでいます。 [7] これらのジスルフィド結合は、分子を強固な構造に押し込み、タンパク質が伸長した βシート を介して標的プロテアーゼと相互作用することを可能にします。すべてのドメイン(ドメイン1、2、15を除く)はP1に アルギニンを 含んでおり、トリプシン様プロテアーゼが標的となる可能性が高いことを示しています。 [7]
表皮において、LEKTIは KLK5 、 KLK7 、 KLK14を 選択的に阻害する能力を介して 落屑の 調節に関与している。 [8] 組み換え 全長LEKTIは、外因性セリンプロテアーゼである トリプシン 、 プラスミン 、 サブチリシンA 、 カテプシンG 、ヒト好中球 エラスターゼ を阻害する。 [9]
LEKTIは皮膚や毛髪の形態形成、粘膜上皮の抗炎症および/または抗菌保護に役割を果たす可能性がある。 [6]
遺伝子
SPINK5は、 染色体5q32 に位置する遺伝子ファミリークラスター[ 10] のメンバーであり、 セリンプロテアーゼ阻害剤をコードしています。これには、他の表皮タンパク質 SPINK6 および LEKTI-2 ( SPINK9 )が含まれます。SPINK5 遺伝子 は61kbの長さで、33のエクソンを含みます [7] 。SPINK5 の 選択的プロセシング により、分化したケラチノサイトで同定されている3つの異なる遺伝子産物が形成されます [11] 。
臨床的意義
SPINK5遺伝子の変異は、 魚鱗癬 と特定の免疫系の欠陥を 特徴とする疾患である ネザートン症候群を引き起こします。 [6]
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000133710 – Ensembl 、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000055561 – Ensembl 、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。
^ 「マウスPubMedリファレンス:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。
^ Magert HJ、Standker L、クロイツマン P、Zucht HD、ライネッケ M、ゾンマーホフ CP、フリッツ H、フォルスマン WG (1999 年 8 月)。 「新規15ドメインタイプのヒトセリンプロテイナーゼ阻害剤LEKTI」。 Jバイオルケム . 274 (31): 21499–502 . 土井 : 10.1074/jbc.274.31.21499 。 PMID 10419450。
^ abc 「Entrez Gene: SPINK5セリンペプチダーゼ阻害剤、Kazalタイプ5」。
^ abc Furio L, Hovnanian A (2011年11月). 「活性には分解が必要である場合:特異的プロテアーゼ阻害のためのLEKTIタンパク質分解活性化カスケード」. J Invest Dermatol . 131 (11): 2169–73 . doi : 10.1038/jid.2011.295 . PMID 21997416.
^ Deraison C, Bonnart C, Lopez F, Besson C, Robinson R, Jayakumar A, Wagberg F, Brattsand M, Hachem JP, Leonardsson G, Hovnanian A (2007年9月). 「LEKTI断片はKLK5、KLK7、およびKLK14を特異的に阻害し、pH依存的な相互作用を介して落屑を抑制する」 Mol. Biol. Cell . 18 (9): 3607–19 . doi :10.1091/mbc.E07-02-0124. PMC 1951746. PMID 17596512 .
^ ミツド K、ジャヤクマール A、ヘンダーソン Y、フレデリック MJ、カン Y、ワン M、エルナガー AK、クレイマン GL (2003 年 4 月)。 「LEKTIによるセリンプロテイナーゼのプラスミン、トリプシン、ズブチリシンA、カテプシンG、エラスターゼの阻害:動態解析」。 生化学 。 42 (13): 3874–81 . 土井 :10.1021/bi027029v。 PMID 12667078。
^ 「SPINK5セリンペプチダーゼ阻害剤、Kazalタイプ5 [Homo sapiens (ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。
^ Tartaglia-Polcini A, Bonnart C, Micheloni A, Cianfarani F, Andrè A, Zambruno G, Hovnanian A, D'Alessio M (2006年2月). 「ネザートン症候群の欠陥遺伝子SPINK5は、選択的pre-mRNAプロセシングから誘導される複数のLEKTIアイソフォームをコードする」 J Invest Dermatol . 126 (2): 315–24 . doi : 10.1038/sj.jid.5700015 . PMID 16374478.
さらに読む
Norgett EE, Kelsell DP (2002). 「SPINK5:稀少かつ一般的な皮膚疾患」. Trends in Molecular Medicine . 8 (1): 7. doi :10.1016/S1471-4914(01)02228-6. PMID 11796258.
Mägert HJ, Kreutzmann P, Ständker L, et al. (2002). 「LEKTI:病態生理学的関連性を持つマルチドメインセリンプロテアーゼ阻害剤」. Int. J. Biochem. Cell Biol . 34 (6): 573–6 . doi :10.1016/S1357-2725(01)00179-0. PMID 11943586.
Walden M, Kreutzmann P, Drögemüller K, et al. (2003). 「ヒト15ドメインセリンプロテアーゼ阻害剤LEKTIの生化学的特徴、分子生物学および臨床的意義」 Biol. Chem . 383 ( 7–8 ): 1139–41 . doi : 10.1515 /BC.2002.124. PMID 12437098. S2CID 26084613.
Chavanas S, Garner C, Bodemer C, et al. (2000). 「連鎖解析とホモ接合性マッピングによるネザートン症候群遺伝子の染色体5q32への局在」 Am. J. Hum. Genet . 66 (3): 914–21 . doi :10.1086/302824. PMC 1288172. PMID 10712206 .
Chavanas S, Bodemer C, Rochat A, et al. (2000). 「セリンプロテアーゼ阻害剤をコードするSPINK5の変異がネザートン症候群を引き起こす」 Nat. Genet . 25 (2): 141–2 . doi :10.1038/75977. PMID 10835624. S2CID 40421711.
Sprecher E, Chavanas S, DiGiovanna JJ, et al. (2001). 「ネザートン症候群19家系におけるSPINK5遺伝子の病原性変異のスペクトル:変異検出と出生前診断の初例への示唆」 J. Invest. Dermatol . 117 (2): 179–87 . doi : 10.1046/j.1523-1747.2001.01389.x . PMID 11511292.
Walley AJ, Chavanas S, Moffatt MF, et al. (2001). 「ネザートン症候群における遺伝子多型と一般的なアトピー性疾患」 Nat. Genet . 29 (2): 175–8 . doi :10.1038/ng728. PMID 11544479. S2CID 20292050.
Ahmed A, Kandola P, Ziada G, Parenteau N (2002). 「ヒト表皮ケラチノサイト調整培地からのタンパク質の精製および部分アミノ酸配列」. J. Protein Chem . 20 (4): 273–8 . doi :10.1023/A:1010902815953. PMID 11594460. S2CID 11877191.
Bitoun E, Chavanas S, Irvine AD, et al. (2002). 「ネザートン症候群:21家系における疾患発現とSPINK5遺伝子変異のスペクトル」 J. Invest. Dermatol . 118 (2): 352– 61. doi : 10.1046/j.1523-1747.2002.01603.x . PMID 11841556.
小松 暢、高田 正治、大月 暢、他 (2002). 「ネザートン症候群における角質層加水分解活性の上昇は、SPINK5由来ペプチドによる落屑抑制制御を示唆する」 J. Invest. Dermatol . 118 (3): 436–43 . doi : 10.1046/j.0022-202x.2001.01663.x . hdl : 2297/15796 . PMID 11874482.
Bitoun E, Micheloni A, Lamant L, et al. (2004). 「ヒト初代角化細胞におけるLEKTIのタンパク質分解プロセシング、組織分布、そしてネザートン症候群における発現異常」 Hum. Mol. Genet . 12 (19): 2417–30 . doi : 10.1093/hmg/ddg247 . PMID 12915442.
西尾雄三、野口英二、柴崎正治、他 (2004). 「日本人におけるSPINK5遺伝子多型とアトピー性皮膚炎との関連」 Genes Immun . 4 (7): 515–7 . doi : 10.1038/sj.gene.6363889 . PMID 14551605.
Raghunath M, Tontsidou L, Oji V, et al. (2004). 「SPINK5とネザートン症候群:新規変異、LEKTI欠損の証明、およびトランスグルタミナーゼの差次的発現」 J. Invest. Dermatol . 123 (3): 474– 83. doi : 10.1111/j.0022-202X.2004.23220.x . PMID 15304086.
Tidow H, Lauber T, Vitzithum K, et al. (2004). 「キメラLEKTIドメインの溶液構造はカメレオン配列を明らかにする」 (PDF) . 生化学 . 43 (35): 11238–47 . doi :10.1021/bi0492399. PMID 15366933.
Yang T, Liang D, Koch PJ, et al. (2004). 「Spink5-/-マウスにおける表皮剥離、デスモソーム解離、およびコルネオデスモシンの不安定化」. Genes Dev . 18 (19): 2354–8 . doi :10.1101/gad.1232104. PMC 522985. PMID 15466487 .
Ishida-Yamamoto A, Deraison C, Bonnart C, et al. (2005). 「LEKTIはKLK5およびKLK7から分離され、ラメラ顆粒に局在し、表層顆粒層の細胞外スペースに分泌される」. J. Invest. Dermatol . 124 (2): 360–6 . doi : 10.1111/j.0022-202X.2004.23583.x . PMID 15675955.
外部リンク