配列関連増幅多型

SRAP（配列関連増幅多型）は、2001年にG. LiとCF Quirosによって開発された分子技術であり、 ^[1]植物や関連生物のゲノムのオープンリーディングフレーム（ORF）内の遺伝的変異を検出するためのものです。^[2]

参照

• 包含複合区間マッピング
• マイクロサテライト（遺伝学）
• 分子計算による同定
• 分子マーカー
• RAPD
• 配列プロファイリングツール

参考文献

1. Kole 2007、88ページ。
2. Li & Quiros 2001、455–461 ページ。

出典

• Kole, Chittaranjan (2007). 「分子マーカーと遺伝子マッピング」. Oilseeds .植物におけるゲノムマッピングと分子育種第2巻. Springer. p. 88. ISBN 978-3540343875。
• Li, G.; Quiros, CF (2001). 「配列関連増幅多型（SRAP）：シンプルなPCR反応に基づく新しいマーカーシステム：アブラナ科植物におけるマッピングと遺伝子タグ付けへの応用」.理論・応用遺伝学. 103 ( 2–3 ): 455– 461. doi :10.1007/s001220100570. S2CID  3362269.

さらに読む

本

• Kidwell, KK; Osborn, TC (1992). 「植物DNAの簡易単離手順」. Beckman, JS; Osborn, TC (編).植物ゲノム：遺伝的・物理的マッピング法. アムステルダム（オランダ）：Kluwer Academic Publishers . pp.  1– 13.
• Tegelstrom, H. (1992). 「ミトコンドリアDNA断片の検出」. Hoelzel, AR (編). 『集団の分子遺伝学的解析：実践的アプローチ』. オックスフォード: IRL Press. pp.  89– 114.

記事とジャーナル

• Broude, Natalia E.; Chandra, Abha; Smith, Cassandra L. (1997). 「特定の散在反復配列を含むゲノムサブセットのディファレンシャルディスプレイ」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (9): 4548– 4553. Bibcode :1997PNAS...94.4548B. doi : 10.1073/pnas.94.9.4548 . PMC  20760. PMID  9114027 .
• Brown, Allan F.; Jeffery, Elizabeth H.; Juvik, John (2007). 「ブロッコリーのポリメラーゼ連鎖反応による連鎖地図と、収穫日および穂重に関連する量的形質遺伝子座の同定」(PDF) . Journal of the American Society for Horticultural Science . 4 (132): 507– 513. doi : 10.21273/JASHS.132.4.507 .
• Dicks, J.; Anderson, M.; Cardle, L.; Cartinhour, S.; Couchman, M.; Davenport, G.; Dickson, J.; Gale, M.; Marshall, D.; May, S.; Mcwilliam, H.; O'Malia, A.; Ougham, H.; Trick, M.; Walsh, S.; Waugh, R. (2000). 「UK CropNet：作物ゲノム解析のためのデータベースおよびバイオインフォマティクスリソース集積」. Nucleic Acids Research . 28 (1): 104– 107. doi :10.1093/nar/28.1.104. PMC 102397.  PMID 10592194  .
• Doyle, JJ; Doyle, JL (1987). 「少量の新鮮な葉組織からの迅速なDNA単離法」. Phytochemical Bulletin . 19 : 11–15 .
• Kosambi, D. (1944). 「組換え値による地図距離の推定」Annals of Eugenics . 12 : 172– 175. doi : 10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x .
• Lander, ES; Green, P.; Abrahamson, J.; Barlow, A.; Daly, MJ; Lincoln, SE; Newburg, L. (1987年10月). 「MAPMAKER：実験集団および自然集団の一次遺伝子連鎖地図を作成するための対話型コンピュータパッケージ」. Genomics . 1 (2): 174– 181. doi :10.1016/0888-7543(87)90010-3. PMID  3692487.
• Li, Huihui; Ribaut, Jean-Marcel; Li, Zhonglai; Wang, Jiankang (2008). 「二親性集団における量的形質の二遺伝子エピスタシスに関する包括的複合区間マッピング（ICIM）」.理論・応用遺伝学. 116 (2): 243– 260. doi :10.1007/s00122-007-0663-5. PMID  17985112. S2CID  21798268.
• Quiros, CF; Grellet, F.; Sadowski, J.; Suzuki, T.; Li, G.; Wroblewski, T. (2001). 「ArabidopsisとBrassicaにおけるABI1-Rps2-Ckl染色体セグメントおよび関連領域における比較配列、構造、遺伝子含有量」Genetics . 157 (3): 1321– 1330. doi :10.1093/genetics/157.3.1321. PMC  1461565. PMID  11238417 .
• Saha, Gopesh; Sarkerb, Ashutosh; Chena, Weidong; Vandemarka, George J.; Muehlbauera, Fred J. (2010). 「レンズ豆の茎枯れ病抵抗性を付与する遺伝子の遺伝と連鎖地図上の位置」 . Crop Science . 50 (5). Crop Science Society of America: 1831– 1839. doi :10.2135/cropsci2009.12.0709.
• Shapiro, SS; Wilk, MB (1965). 「正規性検定のための分散分析（完全標本）. Biometrika . 52 ( 3–4 ): 591–611 . doi :10.1093/biomet/52.3-4.591.
• Sharma, R.; Mahla, RH; Mohapatra, T.; Bhargava, CS; Shama, MM (2003). 「液体窒素を使用しない植物ゲノムDNAの単離」. Plant Molecular Biology . 21 : 43– 50. doi :10.1007/bf02773395. S2CID  2893909.
• シェン、ジュンリン。ニー、フイクン。チェン、シャオヤン。黄、シャオウェイ (2010)。 「SRAP分子マーカーによるジャトロファ・クルカスの遺伝的多様性」。浙江林業大学の雑誌。27 ( 3): 347–353。ISSN 1000-5692  。
• Sorkheh, K.; Shiran, B.; Kiani, S.; Amirbakhtiar, N.; Mousavi, S.; Rouhi, Vahid; Mohammady-d, Shahram; Gradziel, Thomas M.; Malysheva-Otto, Lyudmyla V.; Martínez-Gómez, Pedro (2009). 「アーモンドおよび関連ウェルド属植物の栽培種における遺伝的関係の確立における分子マーカーと形態学的特徴の識別能力」. Journal of Forestry Research . 20 (3): 183– 194. doi :10.1007/s11676-009-0036-9. S2CID  22190347.
• Williams, JGK; Kubelik, AR; Livak, KJ; Rafalski, JA; Tingey, SV (1990). 「任意プライマーによるDNA多型増幅は遺伝子マーカーとして有用である」. Nucleic Acids Research . 18 (22): 6531– 6535. doi :10.1093/nar/18.22.6531. PMC  332606. PMID  1979162 .