ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| SOX11 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SOX11、MRD27、SRYボックス11、CSS9、SRYボックス転写因子11 |
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| 外部ID | オミム:600898; MGI : 98359;ホモロジーン: 37733;ジーンカード:SOX11; OMA :SOX11 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12|12 A2 | 始める | 27,384,263 bp [2] |
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| 終わり | 27,392,573 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 神経節隆起
- 心室帯
- 口腔粘膜細胞
- 軟骨組織
- 視神経
- 網膜色素上皮
- 内淡蒼球
- 側坐核
- 視床下部
- 延髄
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| | 上位の表現 | - 吻側回遊流
- 内側神経節隆起
- 腹壁
- 上顎突出
- 性器結節
- 人間の胎児
- 下顎突出
- 窩
- 耳小胞
- 三叉神経節
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- 転写コアクチベーター活性
- DNA結合転写因子活性
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 翻訳因子活性、RNA結合
- 転写シス調節領域結合
- シス調節領域配列特異的DNA結合
- RNAポリメラーゼIIコアプロモーター配列特異的DNA結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 胚骨格系の形態形成
- 骨格系の発達
- ノルアドレナリンニューロンの分化
- 水晶体上皮細胞増殖の正の調節
- 細胞分化
- 心室形成
- グリア細胞の発達
- 転写の制御、DNAテンプレート
- 肢芽形成
- 肺の形態形成
- 交感神経系の発達
- 神経堤細胞の発達
- 腎臓の発達
- グリア細胞増殖の負の制御
- 軟口蓋の発達
- 心室中隔の形態形成
- カメラ型眼における角膜の発達
- 流出路の形態形成
- 骨化の正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 細胞死の負の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- カメラ型眼における眼瞼の発達
- 遺伝子発現の負の調節
- リンパ球増殖の負の調節
- 体節の発達
- 転写、DNAテンプレート
- 神経上皮細胞の分化
- トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路の調節
- 神経系の発達
- 転写の正の制御、DNAテンプレート
- ヒッポシグナル伝達の正の調節
- 神経新生の正の調節
- 多細胞生物の発達
- 遺伝子発現の正の調節
- 骨芽細胞分化の正の制御
- カメラ型眼における水晶体の形態形成
- 転写調節領域の負の調節 DNA結合
- 硬口蓋の発達
- ニューロン分化の正の調節
- ニューロンの分化
- 細胞集団増殖の正の調節
- 脊髄の発達
- BMPシグナル伝達経路の正の調節
- グリア細胞の増殖
- 骨格筋細胞の分化
- 胚の消化管の形態形成
- オリゴデンドロサイトの発達
- 細胞集団の増殖
- 幹細胞増殖の正の調節
- 神経管形成
- ホルモン分泌の正の調節
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- 視神経裂の閉鎖
- タンパク質生合成
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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転写因子SOX-11は、ヒトではSOX11遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
このイントロンのない遺伝子は、胚発生の制御と細胞運命の決定に関与するグループC SOX(SRY関連HMGボックス)転写因子ファミリーのメンバーをコードしています。コードされているタンパク質は、他のタンパク質とタンパク質複合体を形成した後、転写調節因子として作用する可能性があります。このタンパク質は発達中の神経系で機能し、腫瘍形成および成体神経新生に関与している可能性があります。[7] [8] Tuj1とTead2はSox11の直接的な標的として示唆されています。[9] [10] [11]
臨床的側面
SOX11免疫組織化学染色によるリンパ球染色では、他の成熟リンパ系腫瘍や正常リンパ球ではなく、マントル細胞リンパ腫(サイクリンD1陽性および陰性)が示される。[12]
SOX11の変異はコフィン・シリス症候群[13]やマントル細胞リンパ腫[14]と関連している。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000176887 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000063632 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Jay P, Gozé C, Marsollier C, Taviaux S, Hardelin JP, Koopman P, Berta P (1995年9月). 「ヒトSOX11遺伝子:クローニング、染色体割り当て、組織発現」. Genomics . 29 (2): 541–5 . doi :10.1006/geno.1995.9970. PMID 8666406.
- ^ Wiebe MS, Nowling TK, Rizzino A (2003年5月). 「DNA結合の自己阻害とパートナーシップ特異性に関わるSox-2およびSox-11内の新規ドメインの同定」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (20): 17901–11 . doi : 10.1074/jbc.M212211200 . PMID 12637543.
- ^ ab "Entrez Gene: SOX11 SRY (性別決定領域Y)-ボックス11".
- ^ Haslinger A, Schwarz TJ, Covic M, Lie DC (2009年6月). 「成体神経発生ニッチにおけるSox11の発現は、成体神経発生における段階特異的な役割を示唆する」.ヨーロッパ神経科学ジャーナル. 29 (11): 2103–14 . doi :10.1111/j.1460-9568.2009.06768.x. PMID 19490090. S2CID 42742018.
- ^ Bergsland M, Werme M, Malewicz M, Perlmann T, Muhr J (2006年12月). 「神経細胞特性の確立はSox4とSox11によって制御される」. Genes & Development . 20 (24): 3475–86 . doi :10.1101/gad.403406. PMC 1698453. PMID 17182872 .
- ^ Bhattaram P, Penzo-Méndez A, Sock E, Colmenares C, Kaneko KJ, Vassilev A, Depamphilis ML, Wegner M, Lefebvre V (2010年4月). 「器官形成は神経系および間葉系前駆細胞の生存にSoxC転写因子を依存している」. Nature Communications . 1 (1) 9. Bibcode :2010NatCo...1....9B. doi :10.1038/ncomms1008. PMC 2892298. PMID 20596238 .
- ^ Larson BL, Ylostalo J, Lee RH, Gregory C, Prockop DJ (2010年11月). 「Sox11はヒト多能性間質細胞の初期前駆細胞で発現し、細胞の広範な増殖とともに減少する」.組織工学. パートA. 16 ( 11): 3385–94 . doi :10.1089/ten.tea.2010.0085. PMC 2965191. PMID 20626275 .
- ^ Anna Dusenbery医学博士、Mark R. Wick医学博士「染色とCDマーカー - SOX11」。病理学アウトライン。
{{cite web}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク)トピック完了: 2018年1月1日。マイナーチェンジ: 2021年8月12日
- ^ 津留崎裕、小清水英、大橋英、ファドケ・S、甲I、椎名正人、鈴木隆、岡本直、今村真、山下正、渡辺真、吉浦一、小寺英、宮武真、中島正、才津弘、尾形一、池川真、三宅直、松本直 (2014) 「新たなSOX11変異はコフィン・シリス症候群を引き起こす」。ネイチャーコミュニケーションズ。5 4011。ビブコード:2014NatCo...5.4011T。土井: 10.1038/ncomms5011。PMID 24886874。
- ^ Vose, Julie M. (2017年8月). 「マントル細胞リンパ腫:2017年の診断、リスク層別化、臨床管理の最新情報」. American Journal of Hematology . 92 (8): 806– 813. doi : 10.1002/ajh.24797 . ISSN 1096-8652. PMID 28699667.
さらに読む
- Wilson M, Koopman P (2002年8月). 「Matching SOX:SOXファミリー転写制御因子のパートナータンパク質および補因子」Current Opinion in Genetics & Development . 12 (4): 441–6 . doi :10.1016/S0959-437X(02)00323-4. PMID 12100890.
- Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (2002年8月). 「20組のSOX:マウスおよびヒトのSOX転写因子遺伝子ファミリーの範囲、相同性、および命名法」. Developmental Cell . 3 (2): 167–70 . doi : 10.1016/S1534-5807(02)00223-X . PMID 12194848.
- Gozé C, Poulat F, Berta P (1993年6月). 「ヒトSOX遺伝子2種、SOX-11およびSOX-12の部分クローニング」. Nucleic Acids Research . 21 (12): 2943. doi :10.1093/nar/21.12.2943. PMC 309692. PMID 8332506 .
- Kuhlbrodt K, Herbarth B, Sock E, Enderich J, Hermans-Borgmeyer I, Wegner M (1998年6月). 「グリア細胞におけるPOUタンパク質とSOXタンパク質の協同的機能」. The Journal of Biological Chemistry . 273 (26): 16050–7 . doi : 10.1074/jbc.273.26.16050 . PMID 9632656.
- 東 徹、青 S、斉藤 裕、矢野 和、関 N、若尾 裕、増穂 裕、村松 正 (1999 年 10 月)。 「神経分化中に上方制御される遺伝子であるヒト SOX11 には、長い 3' 非翻訳領域があります。」DNA 研究。6 (5): 357–60 .土井: 10.1093/dnares/6.5.357。PMID 10574465。
- Lee CJ, Appleby VJ, Orme AT, Chan WI, Scotting PJ (2002年5月). 「髄芽腫におけるSOX4とSOX11の発現差」Journal of Neuro-Oncology 57 ( 3): 201–14 . doi :10.1023/A:1015773818302. PMID 12125983. S2CID 20719302.
- Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (2004年11月). 「マウス脳発達過程のリン酸化プロテオミクス解析」. Molecular & Cellular Proteomics . 3 (11): 1093–101 . doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747.
- Bouma GJ, Albrecht KH, Washburn LL, Recknagel AK, Churchill GA, Eicher EM (2005年7月). 「変異Dax1 XYマウスにおける生殖腺の性転換:プレセルトリ細胞におけるSox9の上方制御の失敗」. Development . 132 (13): 3045–54 . doi : 10.1242/dev.01890 . PMID 15944188.
- Thevenet L, Albrecht KH, Malki S, Berta P, Boizet-Bonhoure B, Poulat F (2005年11月). 「NHERF2/SIP-1はヒトSRYとは異なるメカニズムでマウスSRYと相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 280 (46): 38625–30 . doi : 10.1074/jbc.M504127200 . PMID 16166090.
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外部リンク